Objectif
Extracted evolutionary and epidemiological information from pathogen genomes has grown into an important instrument across infectious disease research. By harnessing such information, molecular epidemiologists aim to shed light on the origin and epidemic history of pathogens, from reservoir dynamics to emergence and adaptation to new hosts, and their spatiotemporal spread. However, despite the revolution in genome sequencing technologies and advances in statistical methodology, key questions about pathogen emergence and establishment in human populations remain unresolved for major viral epidemics. When confronted with new viral outbreaks, such as the recent devastating Ebola virus epidemic, we also struggle to deploy these technologies in a systematic and concerted way despite a critical need to support public health interventions.
In this project, we propose to unravel crucial steps in the emergence and establishment of key viral pathogens. We will scrutinise the reservoir dynamics of HCV by sequencing complete hepacivirus genomes from infected samples emerging from a large-scale screening of African rodents, and analyze the cross-species transmission history using novel evolutionary methods that accommodate spatial and temporal variability in selective pressures. To test hypotheses about the early establishment of HIV-1, we will carve a genomic window into the past epidemic history of the virus by integrating molecular work on archival samples from Central Africa and on samples representative of the current HIV-1 diversity, with the development of ancestral recombination graphs that accommodate dated tips and spatial diffusion, as well as population dynamic models that incorporate epidemiological information. Finally, we will take the recent Ebola epidemic in West Africa as a model to develop high-performance statistical approaches for extracting practical and timely epidemiological information from virus genome sequences during epidemics as they unfold.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences médicales et de la santé sciences de la santé santé publique et environnementale
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse virus à ARN ebola
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse virus à ARN hépatite C
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2016-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
3000 Leuven
Belgique
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.