Cel The main objective of the project is the development of a protocol capable of identifying i) novel drug binding sites and ii) novel drug-protein complexes of Mycobacterium tuberculosis proteins. Our present knowledge of human genomics and proteomics a llows possible new approaches in drug discovery, motivated by combinatorics-based data-mining and knowledge discovery techniques, sometimes labelled as "high throughput" techniques. Solely these approaches (without sound biological background) seem to be still inadequate for drug discovery. In the present project we aim to develop a protocol, rather than a software with two ingredients: a, A method, with an algorithmic solution in its centre, which identifies surface indentation patterns in protein 3 D structures. Using very high throughput methods based on recent result of data mining and information retrieval, pairwise searches will be conducted to predicate drug-protein binding in two main phases, a rough first phase (Silico 1) and a more thoroug h docking investigation (Silico 2) in the second phase. b, A structural and molecular biology protocol for examining the most promising drug-protein fit pairs with a variety of medium throughput and low throughput methods. Dziedzina nauki medical and health sciencesclinical medicinepneumologytuberculosismedical and health sciencesbasic medicinepharmacology and pharmacy Słowa kluczowe clustering techniques data mining biochemical databases high throughput techniques similarity search Program(-y) FP6-LIFESCIHEALTH - Life sciences, genomics and biotechnology for health: Thematic Priority 1 under the Focusing and Integrating Community Research programme 2002-2006. Temat(-y) LSH-2003-2.3.0-1 - Highly innovative approaches for the development of new interventions for HIV, malaria and tuberculosis Zaproszenie do składania wniosków FP6-2003-LIFESCIHEALTH-3 Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia System finansowania STREP - Specific Targeted Research Project Koordynator EOTVOS LORAND TUDOMANYEGYETEM Wkład UE Brak danych Adres Egyetem ter 1-3 BUDAPEST Węgry Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych Uczestnicy (6) Sortuj alfabetycznie Sortuj według wkładu UE Rozwiń wszystko Zwiń wszystko MTA ENZIMOLOGIAI KUTATOINTEZET Węgry Wkład UE Brak danych Adres Karolina ut 29-31 BUDAPEST Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych UNIVERSITY OF MESSINA Włochy Wkład UE Brak danych Adres C. da Papardo S. ta Sperone 31 MESSINA Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY Niemcy Wkład UE Brak danych Adres Meyerhofstrasse 1 HEIDELBERG Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych USTAV ORGANICKE CHEMIE A BIOCHEMIE, AKADEMIE VED CESKE REPUBLIKY Czechy Wkład UE Brak danych Adres Flemingovo n. 2 PRAGUE Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych COMBINATURE BIOPHARM AG Niemcy Wkład UE Brak danych Adres Robert-Rössle-Str. 10 BERLIN Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych MTA SZÁMÍTÁSTECHNIKAI ÉS AUTOMATIZÁLÁSI KUTATÓ INTÉZET (COMPUTER AND AUTOMATION RESEARCH INSTITUTE, HUNGARIAN ACADEMY OF SCIENCES) Węgry Wkład UE Brak danych Adres Kende u. 13-17. BUDAPEST Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych
