Objetivo The GENEFUN project aims at addressing two important issues. Improving existing sequence-similarity based function annotation tools, and developing and integrating methods that consider information on 3D structure as well as on physical and functional interactions between genes and proteins and the processes in which they are involved. 1- It will develop criteria for evaluating the reliability of the annotations currently available in databases. These criteria will be used to assign reliability scores to these annotations and will be incorporated into standard annotation pipelines, for future use. 2- Higher-level features will be incorporated into functional annotations by combining sequence and structure information in order to identify non-linear functional features (interaction sites) and by integrating different methods for inferring function from context-based information (domain architecture, protein-protein interaction, gene order etc.). To achieve these goals several European groups with a strong track record in various aspects of bioinformatics have teamed up with an experimental group from Canada, which is well known for its strength in structural and functional proteomics. The expected output of the project is: improved procedures for inferring function on the basis of sequence similarity, a set of procedures for predicting non-linear functional features from sequence and 3D structure, and benchmarked procedures for predicting context-based functional features. Major efforts will be devoted to protocols that optimally combine the results from several methods. These protocols will be made available to the scientific community via the Web, and the community will be introduced to them through open workshops and training sessions. Ámbito científico natural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsproteomicsnatural sciencescomputer and information sciencesdatabases Palabras clave Annotation Bioinformatics Gene Protein Function Programa(s) FP6-LIFESCIHEALTH - Life sciences, genomics and biotechnology for health: Thematic Priority 1 under the Focusing and Integrating Community Research programme 2002-2006. Tema(s) LSH-2002-1.1.0-1 - Topics for Specific Targeted Research Project/CA in the area of Fundamental knowledge and basic tools for functional genomics in all organisms Convocatoria de propuestas FP6-2002-LIFESCIHEALTH Consulte otros proyectos de esta convocatoria Régimen de financiación STREP - Specific Targeted Research Project Coordinador UNIVERSITÉ LIBRE DE BRUXELLES Aportación de la UE Sin datos Dirección Avenue F.D. Roosevelt 50 BRUXELLES Bélgica Ver en el mapa Enlaces Sitio web Opens in new window Coste total Sin datos Participantes (10) Ordenar alfabéticamente Ordenar por aportación de la UE Ampliar todo Contraer todo CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS España Aportación de la UE Sin datos Dirección C/SERRANO, 117 MADRID Ver en el mapa Enlaces Sitio web Opens in new window Coste total Sin datos STOCKHOLMS UNIVERSITET Suecia Aportación de la UE Sin datos Dirección STOCKHOLM Ver en el mapa Enlaces Sitio web Opens in new window Coste total Sin datos EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY Alemania Aportación de la UE Sin datos Dirección Meyerhofstrasse 1 HEIDELBERG Ver en el mapa Enlaces Sitio web Opens in new window Coste total Sin datos BEN-GURION UNIVERSITY OF THE NEGEV Israel Aportación de la UE Sin datos Dirección 653 BEER-SHEVA Ver en el mapa Enlaces Sitio web Opens in new window Coste total Sin datos HEMERIS COMPUTING (MANY SA) Bélgica Aportación de la UE Sin datos Dirección Chaussée d'Ixelles 29-31 BRUSSELS Ver en el mapa Enlaces Sitio web Opens in new window Coste total Sin datos BIOLNFOBANK INSTITUTE Polonia Aportación de la UE Sin datos Dirección Limanowskiego 24A/16 POZNAN Ver en el mapa Enlaces Sitio web Opens in new window Coste total Sin datos UNIVERSITY HEALTH NETWORK Canadá Aportación de la UE Sin datos Dirección 190 Elisabeth St R Fraser Elliot TORONTO, ONTARIO Ver en el mapa Enlaces Sitio web Opens in new window Coste total Sin datos ALMA BIOINFORMATICS,S.L. España Aportación de la UE Sin datos Dirección Ronda de Poniente, 4,2°C-D TRES CANTOS - MADRID Ver en el mapa Enlaces Sitio web Opens in new window Coste total Sin datos FUNDATION CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES ONCOLOGICAS CARLOS III España Aportación de la UE Sin datos Dirección Mechior Fernandez Almagro, 3 MADRID Ver en el mapa Coste total Sin datos CENTER OF GENOMIC REGULATION España Aportación de la UE Sin datos Dirección Passeig Maritim 37-49 BARCELONA Ver en el mapa Enlaces Sitio web Opens in new window Coste total Sin datos