Objectif BaSynthec will combine computational and experimental biology approaches with novel high-throughput methodologies to reduce and modify à la carte the chromosome of Bacillus subtilis, a genetically tractable bacterium and one of the key microbes used as a Cell Factory in biotechnology. Simpler B. subtilis strains with reduced energy consumption for self maintenance will be designed and constructed by removing some potentially expensive cellular processes. The cells with the lowest experimentally determined waste of energy and with industrially relevant phenotypes will be engineered to reroute the flux devoted to biomass formation through rational modifications of the complex metabolic regulations, and will be used as biotechnological platforms to plug in synthetic modules. For this purpose, BaSynthec will develop a model-driven approach to design and engineer the strains with predetermined features, with a particular focus on unrestricted metabolic activity and the plug-in of synthetic functional modules. This strategy is based on the recent development of two complementary modelling approaches for B. subtilis: i) a genome-scale model of genetic and metabolic regulatory networks associated with a novel method called “Resource Balance Analysis” defining the formal background of model-based approaches for engineering strains; and ii) the development of a new genome-scale metabolic model of B. subtilis which is the most complete and accurate that exists today. Two pathways of high biotechnological relevance will be used for establishing the proof-of-principle of the assembly of functional synthetic modules: i) the vitamin B5 biosynthetic pathway, and ii) the secretion machinery for the export of extra-cellular enzymes. It is anticipated that validated simpler bacterial strains together with the modelling framework generated by BaSynthec will be used as generic biotechnological platforms to better control and exploit cell metabolism in industrial processes. Champ scientifique natural sciencesbiological sciencesmicrobiologybacteriologynatural sciencesbiological sciencescell biologycell metabolismnatural sciencesbiological sciencesgeneticschromosomesnatural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomesnatural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsenzymes Programme(s) FP7-KBBE - Specific Programme "Cooperation": Food, Agriculture and Biotechnology Thème(s) KBBE-2009-3-6-05 - Synthetic biology for biotechnological applications Appel à propositions FP7-KBBE-2009-3 Voir d’autres projets de cet appel Régime de financement CP-FP - Small or medium-scale focused research project Coordinateur INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE POUR L'AGRICULTURE, L'ALIMENTATION ET L'ENVIRONNEMENT Contribution de l’UE € 893 043,00 Adresse 147 RUE DE L'UNIVERSITE 75007 Paris France Voir sur la carte Région Ile-de-France Ile-de-France Paris Type d’activité Research Organisations Contact administratif Philippe Noirot (Dr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée Participants (7) Trier par ordre alphabétique Trier par contribution de l’UE Tout développer Tout réduire ACADEMISCH ZIEKENHUIS GRONINGEN Pays-Bas Contribution de l’UE € 326 422,00 Adresse HANZEPLEIN 1 9713 GZ Groningen Voir sur la carte Région Noord-Nederland Groningen Overig Groningen Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Jan Maarten Van Dijl (Prof.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée THE UNIVERSITY OF CHICAGO États-Unis Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse S ELLIS AVE 5801 ROOM 503 60637 Chicago Illinois Voir sur la carte Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Rick Stevens (Prof.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée DSM Nutritional Products Ltd Suisse Contribution de l’UE € 306 510,00 Adresse Wurmisweg 576 4303 Kaiseraugst Voir sur la carte Région Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Aargau Type d’activité Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contact administratif Zoltán Prágai (Dr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH Suisse Contribution de l’UE € 607 418,00 Adresse Raemistrasse 101 8092 Zuerich Voir sur la carte Région Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Uwe Sauer (Prof.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée UNIVERSITAET GREIFSWALD Allemagne Contribution de l’UE € 339 203,00 Adresse DOMSTRASSE 11 17489 Greifswald Voir sur la carte Région Mecklenburg-Vorpommern Mecklenburg-Vorpommern Vorpommern-Greifswald Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Michael Hecker (Prof.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée INRAE TRANSFERT SAS France Contribution de l’UE € 222 854,00 Adresse RUE DU DOCTEUR FINLAY 28 75015 Paris Voir sur la carte Région Ile-de-France Ile-de-France Paris Type d’activité Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contact administratif Marie Dufourcq (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée NOVOZYMES A/S Danemark Contribution de l’UE € 297 712,00 Adresse Krogshoejvej 36 2880 Bagsvaerd Voir sur la carte Région Danmark Hovedstaden Københavns omegn Type d’activité Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contact administratif Michael Dolberg Rasmussen (Dr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée
