Wspólnotowy Serwis Informacyjny Badan i Rozwoju - CORDIS

FP7

PPI-MARKER Wynik w skrócie

Project ID: 247097
Źródło dofinansowania: FP7-PEOPLE
Kraj: Niemcy

Interakcje międzybiałkowe prowadzące do choroby nowotworowej

Choroba nowotworowa dotyka miliony ludzi na całym świecie, a przy czym rak prostaty i glejak wielopostaciowy (GBM) odpowiadają za większość przypadków śmiertelnych. Naukowcy finansowani ze środków UE zajęli się badaniem zmian rakotwórczych w interakcjach międzybiałkowych oraz sieci genów powiązanych z tymi nowotworami.
Interakcje międzybiałkowe prowadzące do choroby nowotworowej
Nowotwór to choroba bardzo złożona będąca rezultatem zaburzeń genomowych, które wspomagają przetrwanie komórek nowotworowych poprzez zmiany w obrębie kilku mechanizmów komórkowych, w tym apoptozy i naprawy DNA. Naukowcom udało się uzyskać wgląd w odpowiadające za ten proces mechanizmy molekularne.

Kluczem do odnalezienia skutecznych metod terapii jest zrozumienie interakcji międzybiałkowych i sieci regulacji genowej, które zostają zaatakowane w fazie początkowej raka, jego progresji i reakcji na lek. Celem projektu PPI-MARKER (Interruption of protein-protein interaction and network to cancer biomarkers and therapeutic targets) było zastosowanie zysków lub strat wynikających z interakcji międzybiałkowych w celu ujawnienia ich roli w rozwoju nowotworu.

Badacze przyjęli podejście sieciowe, aby odnaleźć biomarkery raka prostaty i GBM. W tym celu połączyli dane ekspresji genu z interakcjami międzybiałkowymi lub transkrypcyjnymi sieciami regulacyjnymi. Przedmiotem badania była sieć międzybiałkowa receptora androgenowego w raku prostaty i sieć kontrolowana przez sieć TGF-beta w glejakach.

Eksperymenty ChIP-Chip i ChIP-Seq na próbkach nowotworu pobranych od pacjenta pomogły zidentyfikować najważniejsze czynniki transkrypcyjne i ich cele. Aby określić odpowiednie motywy i moduły sieci, zastosowano nowatorską technikę zwaną metaDBSite. W rezultacie z powodzeniem wyjaśniono rolę IL-6 i sygnalizowania STAT3 w dół łańcucha, a także wyłoniono reaktywne formy tlenu w inicjacji raka prostat.

Zespół PPI-MARKER zajął się dalszym badaniem obiecujących biomarkerów kandydujących i dokonał ich walidacji w sposób eksperymentalny. Niektóre z nich poddano także modelowaniu przy użyciu danych strukturalnych białka w kompleksach białko-białko. To powinno pomóc w projektowaniu ligand, które przerywają interakcje istotne dla procesu nowotworzenia poprzez zajmowanie skojarzonych miejsc wiązania.

Rak prostaty jest główną przyczyną zgonów wśród mężczyzn w krajach rozwiniętych, a GBM jest najczęściej występującą agresywną formą pierwotnego nowotworu mózgu. Prace przeprowadzone w ramach projektu wniosły ważny wkład w diagnozowanie i projektowanie metod leczenia tych chorób.

Powiązane informacje

Słowa kluczowe

Rak, prostata, glejak wielopostaciowy, interakcje międzybiałkowe, sieci genów, biomarkery
Numer rekordu: 175135 / Ostatnia aktualizacja: 2016-02-10
Dziedzina: Biologia, Medycyna
Śledź nas na: RSS Facebook Twitter YouTube Zarządzany przez Urząd Publikacji UE W górę