European Commission logo
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Elucidating how XRN1-mediated RNA degradation controls virus infection

Opis projektu

Nowy czynnik kierujący procesem zakażenia wirusem u gospodarza

W momencie zakażenia wirusy wywołują u gospodarza rozkład mRNA, proces, którym kieruje egzonukleaza XRN1. Komórki ludzkie pozbawione tego białka są oporne na działanie przenoszonego przez komary wirusa sindbis, co wyraźnie podkreśla znaczenie egzonukleazy XRN1 w procesie zakażenia. Jednakże dokładny mechanizm jej działania pozostaje niejasny. Celem finansowanego ze środków UE projektu RNAdeg-Virus jest zbadanie celów egzonukleazy XRN1 przy użyciu najnowocześniejszych metod ogólnoustrojowych oraz nakreślenie zdarzeń molekularnych, które powodują jej aktywację. Wyniki projektu doprowadzą do określenia potencjalnych celów dla leków przeciwwirusowych, co przyniesie oczywiste konsekwencje natury medycznej i społeczno-ekonomicznej.

Cel

Commandeering the cellular gene expression machinery is essential for viruses in order to replicate their genome and ensure the production of their progeny. One of the major events occurring during viral infection is the virus-induced host mRNA degradation, process orchestrated by the exonuclease XRN1. However, the exact role of this enzyme remains controversial and largely elusive. An exciting stepping stone for studying XRN1 involvement in virus infection is the observation that human cells depleted of this protein are refractory to the infection of sindbis (SINV), a mosquito-borne virus. This suggests that this exonuclease is essential for SINV infection. It has been shown that the cellular RNA is massively degraded upon infection and that RNA degradation is the main force shaping the host transcriptome. Thus, I propose to identify the cellular and viral RNAs directly bound to and regulated by XRN1, using cutting-edge system-wide approaches, which will shed light on the targetome of this protein. Moreover, I plan to study how XRN1 is triggered, for instance by virus-induced posttranslational modifications or by differential protein complex assembly using mass-spectrometry analysis. Discovering the molecular events that activate XRN1 will be fundamental for determining its precise molecular mechanism of action and why it is important for viral infection. Additionally, the outcomes of this multidisciplinary approach will be beneficial for studying gene expression and RNA degradation-related processes, such as cancer. This innovative project will generate a vast amount of valuable data, which will allow to dissect the infection mechanisms of a mosquito-borne virus, leading to the identification of potential targets for antiviral drugs, with a consequent strong medical and socio-economic impact.

System finansowania

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Koordynator

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
Wkład UE netto
€ 212 933,76
Adres
WELLINGTON SQUARE UNIVERSITY OFFICES
OX1 2JD Oxford
Zjednoczone Królestwo

Zobacz na mapie

Region
South East (England) Berkshire, Buckinghamshire and Oxfordshire Oxfordshire
Rodzaj działalności
Higher or Secondary Education Establishments
Linki
Koszt całkowity
€ 212 933,76