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Gene network rewiring by an engineered CRIPSR-Cas12a variant

Descripción del proyecto

Edición génica a gran escala

Durante los últimos años se han empleado tecnologías ómicas para obtener una cantidad de información sin precedentes sobre la función celular que, sin embargo, todavía no ha sido validada de forma experimental. El proyecto GNRECC, financiado con fondos europeos, aprovechará una herramienta desarrollada anteriormente para la ingeniería genómica basada en CRISPR/12 capaz de realizar una edición múltiple en docenas de genes endógenos a la vez. En GNRECC, los científicos se proponen aumentar la eficacia de esta herramienta molecular para alterar las rutas de señalización en la proliferación celular. Para ello, diseñarán nuevas variantes de proteínas Cas12a y, combinando la física estadística con la ingeniería proteica y genómica, sentarán la base para la ingeniería a gran escala de redes génicas.

Objetivo

In the last 10 years, an increasing number of studies employed -omics technologies to describe the molecular changes underpinning cellular functions. However, a large part of these findings is awaiting an experimental validation. This is due to the lack of efficient molecular tools able to control both multiple and distinct genetic interactions. Recently, I described a new CRISPR/12-based genome engineering tool that, for the first time, it provides the constitutive, conditional, inducible, orthogonal and multiplexed engineering of dozens of endogenous genes, simultaneously. In this research proposal, I aim to increase the efficiency of this platform in the context of multiplexed genome engineering applications, such as gene network rewiring. To this aim, I will use techniques inspired by the statistical physics of complex disordered systems, to design a more potent version of my CRISPR/Cas12-based genome engineering tool and, I will use this novel platform to rewire signaling pathways involved in cellular proliferation. This research proposal is structured into the following tasks: rational design of novel Cas12a variants, validation of novel Cas12a variants, gene network rewiring by a novel Cas12a variant. By coupling statistical physics to both protein and genome engineering this project will pave the way for efficient and large-scale engineering of gene networks.

Palabras clave

Coordinador

POLITECNICO DI TORINO
Aportación neta de la UEn
€ 171 473,28
Dirección
CORSO DUCA DEGLI ABRUZZI 24
10129 Torino
Italia

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Región
Nord-Ovest Piemonte Torino
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
€ 171 473,28