Descripción del proyecto
Profundizar en el microbioma de las esponjas mesofóticas
Los productos naturales han inspirado la mayoría de las moléculas pequeñas aprobadas en la actualidad para aplicaciones biomédicas. El entorno marino es una fuente contrastada de posibles moléculas bioactivas nuevas, pero la zona mesofótica, situada a entre 30 y 150 metros por debajo de la superficie marina, no se ha explorado suficientemente debido a la dificultad técnica para llegar a esta zona crepuscular del océano. Por consiguiente, las esponjas mesofóticas se han estudiado relativamente poco en cuanto a su potencial como producto natural. El proyecto financiado con fondos europeos COSMos tiene por objeto estudiar más detenidamente los metagenomas de las esponjas mesofóticas. Este estudio combinará grandes análisis de datos, enfoques de biología molecular y sintética, y bioinformática para evaluar el potencial como producto natural de ocho esponjas mesofóticas que se han establecido como prioritarias en la búsqueda de nuevas moléculas con potencial medicinal.
Objetivo
Molecules made by nature, or natural products, inspire the majority of currently approved small molecules for use in medicine. With an increase in widespread antibiotic resistance and the perpetual search for anticancer drugs, new sources of natural products must be discovered. The marine environment is a proven, prolific source of novel bioactive molecules and much of the ocean remains chemically and genetically unexplored. The mesophotic zone is particularly neglected because of the technological difficulty of reaching this twilight zone of the ocean. Shallow water marine sponges have been well documented to have diverse microbial populations and impressive chemical repertoires. Mesophotic sponges, however, are relatively unstudied in terms of their natural product potential. This project aims to take a deep dive into the metagenomes of mesophotic sponges for their natural product potential. Hybrid sequencing and assembly of metagenomes of eight prioritized sponges will uncover new biosynthetic gene clusters for heterologous expression and chemical elucidation. This study will combine large data analyses, cutting edge molecular and synthetic biology approaches and bioinformatic techniques to survey the natural product potential of mesophotic sponges and discover new molecules with medicinal potential.
Ámbito científico
Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinador
6708 PB Wageningen
Países Bajos