Objetivo NGS analysis pipelines are rapidly becoming part of the routine repertoire of research, clinical and public health laboratories in the public sector and private industry. Middle East Respiratory Syndrome-coronavirus (MERS-CoV) is only one example of the many recent virus discoveries made through analysis of next-generation sequencing (NGS) data. Yet, only a small part of the several millions of short-length sequence fragments generated by NGS machineries, many of which are expected to be of viral origin, can be analysed with current methods in bioinformatics. Even for well-known (pathogenic) viruses, proper epidemiological analyses are becoming more and more difficult due to the lack of bioinformatics tools that can handle the large and growing size of datasets. The VIROGENESIS consortium will overcome the most pressing bioinformatics obstacles to making full use of NGS by developing a software platform for end-users with tools underpinned by novel algorithms, models and bioinformatics methods. The speed and flexibility of the tools will make it possible to run analyses on a daily basis for a variety of subjects, including diagnostics, phylogeography, phylodynamics and transmission of drug resistance. The tools will be piloted and incorporated in the many available bioinformatics pipelines and software programmes used in the field. We will make our tools available in a modular, free and open source software platform that offers opportunities to SME’s to further exploit this market. The VIROGENESIS consortium brings together leading European academic and private small and medium enterprises (SME) bioinformatics developers and virology end-users who initiated this project in response to a clear interest from EMBL, NCBI and the Global Microbial Identifier (GMI) platform. Ámbito científico medical and health scienceshealth sciencesinfectious diseasesRNA virusescoronaviruses Palabras clave next-generation sequencing metagenomics viromics virus molecular epidemiology phylogeny phylodynamics virus discovery open source software infectious diseases Programa(s) H2020-EU.3.1. - SOCIETAL CHALLENGES - Health, demographic change and well-being Main Programme H2020-EU.3.1.6. - Health care provision and integrated care Tema(s) PHC-32-2014 - Advancing bioinformatics to meet biomedical and clinical needs Convocatoria de propuestas H2020-PHC-2014-2015 Consulte otros proyectos de esta convocatoria Convocatoria de subcontratación H2020-PHC-2014-two-stage Régimen de financiación RIA - Research and Innovation action Coordinador KATHOLIEKE UNIVERSITEIT LEUVEN Aportación neta de la UEn € 744 257,49 Dirección OUDE MARKT 13 3000 Leuven Bélgica Ver en el mapa Región Vlaams Gewest Prov. Vlaams-Brabant Arr. Leuven Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 744 258,73 Participantes (7) Ordenar alfabéticamente Ordenar por aportación neta de la UE Ampliar todo Contraer todo ERASMUS UNIVERSITAIR MEDISCH CENTRUM ROTTERDAM Países Bajos Aportación neta de la UEn € 586 010,00 Dirección DR MOLEWATERPLEIN 40 3015 GD Rotterdam Ver en el mapa Región West-Nederland Zuid-Holland Groot-Rijnmond Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 586 010,00 THE UNIVERSITY OF MANCHESTER Reino Unido Aportación neta de la UEn € 231 050,00 Dirección OXFORD ROAD M13 9PL Manchester Ver en el mapa Región North West (England) Greater Manchester Manchester Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 231 050,00 CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS Francia Aportación neta de la UEn € 362 500,00 Dirección RUE MICHEL ANGE 3 75794 Paris Ver en el mapa Región Ile-de-France Ile-de-France Paris Tipo de actividad Research Organisations Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 362 500,00 UNIVERSITY OF KWAZULU-NATAL Sudáfrica Aportación neta de la UEn € 150 000,00 Dirección University Road, Chiltern Hills 3630 Westville Ver en el mapa Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 150 000,00 RIJKSINSTITUUT VOOR VOLKSGEZONDHEID EN MILIEU Países Bajos Aportación neta de la UEn € 282 753,75 Dirección Antonie Van Leeuwenhoeklaan 9 3721 MA Bilthoven Ver en el mapa Región West-Nederland Utrecht Utrecht Tipo de actividad Research Organisations Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 282 753,75 EMWEB Bélgica Aportación neta de la UEn € 405 500,00 Dirección DUIGEMHOFSTRAAT 101 3020 Herent Ver en el mapa Pyme Organización definida por ella misma como pequeña y mediana empresa (pyme) en el momento de la firma del acuerdo de subvención. Sí Región Vlaams Gewest Prov. Vlaams-Brabant Arr. Leuven Tipo de actividad Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 405 500,00 UNIVERSITY OF FLORIDA Estados Unidos Aportación neta de la UEn € 233 897,50 Dirección GRINTER HALL 223 32611 5500 Gainesville Ver en el mapa Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Participación en los programas de I+D de la UE Opens in new window Red de colaboración de HORIZON Opens in new window Coste total € 233 897,50