European Commission logo
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Investigating the functional architecture of microbial genomes with synthetic approaches

Publikacje

Multiplex assays for the identification of serological signatures of SARS-CoV-2 infection: an antibody-based diagnostic and machine learning study

Autorzy: Jason Rosado, Stéphane Pelleau, Charlotte Cockram, Sarah Hélène Merkling, Narimane Nekkab, Caroline Demeret, Annalisa Meola, Solen Kerneis, Benjamin Terrier, Samira Fafi-Kremer, Jerome de Seze, Timothée Bruel, François Dejardin, Stéphane Petres, Rhea Longley, Arnaud Fontanet, Marija Backovic, Ivo Mueller, Michael T White
Opublikowane w: The Lancet Microbe, Numer 2/2, 2021, Strona(/y) e60-e69, ISSN 2666-5247
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/s2666-5247(20)30197-x

MetaHiC phage-bacteria infection network reveals active cycling phages of the healthy human gut

Autorzy: Martial Marbouty, Agnès Thierry, Gaël A Millot, Romain Koszul
Opublikowane w: eLife, Numer 10, 2021, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.60608

Computer vision for pattern detection in chromosome contact maps

Autorzy: Cyril Matthey-Doret, Lyam Baudry, Axel Breuer, Rémi Montagne, Nadège Guiglielmoni, Vittore Scolari, Etienne Jean, Arnaud Campeas, Philippe Henri Chanut, Edgar Oriol, Adrien Méot, Laurent Politis, Antoine Vigouroux, Pierrick Moreau, Romain Koszul, Axel Cournac
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-19562-7

Karyotype engineering reveals spatio-temporal control of replication firing and gene contacts

Autorzy: Luciana Lazar-Stefanita; Jingchuan Luo; Remi Montagne; Agnes Thierry; Xiaoji Sun; Guillaume Mercy; Julien Mozziconacci; Romain Koszul; Jef D. Boeke
Opublikowane w: Cell Genomics, Numer 1, 2022, ISSN 2666-979X
Wydawca: Elsevier
DOI: 10.1016/j.xgen.2022.100163

Euryarchaeal genomes are folded into SMC-dependent loops and domains, but lack transcription-mediated compartmentalization

Autorzy: Charlotte Cockram, Agnès Thierry, Aurore Gorlas, Roxane Lestini, Romain Koszul
Opublikowane w: Molecular Cell, 2020, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.12.013

FACT mediates cohesin function on chromatin

Autorzy: Jonay Garcia-Luis, Luciana Lazar-Stefanita, Pilar Gutierrez-Escribano, Agnes Thierry, Axel Cournac, Alicia García, Sara González, Mar Sánchez, Adam Jarmuz, Alex Montoya, Marian Dore, Holger Kramer, Mohammad M. Karimi, Francisco Antequera, Romain Koszul, Luis Aragon
Opublikowane w: Nature Structural & Molecular Biology, Numer 26/10, 2019, Strona(/y) 970-979, ISSN 1545-9993
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-019-0307-x

Chromosome folding and prophage activation reveal specific genomic architecture for intestinal bacteria

Autorzy: Quentin, Lamy-Besnier; Amaury, Bignaud; Julian R, Garneau; Marie, Titecat; Devon E, Conti; Alexandra, Von Strempel; Marc, Monot; Bärbel, Stecher; Romain, Koszul; Laurent, Debarbieux; Martial, Marbouty
Opublikowane w: Microbiome, Numer 7, 2023, ISSN 2049-2618
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1186/s40168-023-01541-x

Characterizing meiotic chromosomes' structure and pairing using a designer sequence optimized for Hi‐C

Autorzy: Héloïse Muller, Vittore F Scolari, Nicolas Agier, Aurèle Piazza, Agnès Thierry, Guillaume Mercy, Stéphane Descorps‐Declere, Luciana Lazar‐Stefanita, Olivier Espeli, Bertrand Llorente, Gilles Fischer, Julien Mozziconacci, Romain Koszul
Opublikowane w: Molecular Systems Biology, Numer 14/7, 2018, ISSN 1744-4292
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.20188293

Regulation of Cohesin-Mediated Chromosome Folding by Eco1 and Other Partners

Autorzy: Lise Dauban, Rémi Montagne, Agnès Thierry, Luciana Lazar-Stefanita, Nathalie Bastié, Olivier Gadal, Axel Cournac, Romain Koszul, Frédéric Beckouët
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 77/6, 2020, Strona(/y) 1279-1293.e4, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2020.01.019

Serpentine: a flexible 2D binning method for differential Hi-C analysis

Autorzy: Lyam Baudry, Gaël A Millot, Agnes Thierry, Romain Koszul, Vittore F Scolari
Opublikowane w: Bioinformatics, Numer 36/12, 2020, Strona(/y) 3645-3651, ISSN 1367-4803
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btaa249

Sir3 mediates long-range chromosome interactions in budding yeast

Autorzy: Myriam Ruault, Vittore F. Scolari, Luciana Lazar-Stefanita, Antoine Hocher, Isabelle Loïodice, Romain Koszul, Angela Taddei
Opublikowane w: Genome Research, Numer 31/3, 2021, Strona(/y) 411-425, ISSN 1088-9051
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.267872.120

Insights in bacterial genome folding

Autorzy: Fares Osam Yáñez-Cuna; Romain Koszul
Opublikowane w: Current Opinion in Structural Biology, Numer 2, 2023, ISSN 0959-440X
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2023.102679

Smc3 acetylation, Pds5 and Scc2 control the translocase activity that establishes cohesin dependent chromatin loops

Autorzy: Nathalie Bastié, Christophe Chapard, Lise Dauban, Olivier Gadal, Frederic Beckouёt, Romain Koszul
Opublikowane w: Biorxiv, 2021
Wydawca: Biorxiv
DOI: 10.1101/2021.04.21.440823

Genomic contacts reveal the control of sister chromosome decatenation in E. coli

Autorzy: Brenna Conin, Ingrid Billault-Chaumartin, Hafez El Sayyed, Charlotte Cockram, Romain Koszul, Olivier Espeli
Opublikowane w: Biorxiv, 2021
Wydawca: Biorxiv
DOI: 10.1101/2021.05.17.444411

Cohesin regulates homology search during recombinational DNA repair

Autorzy: Aurèle Piazza, Hélène Bordelet, Agnès Dumont, Agnès Thierry, Jérôme Savocco, Fabien Girard, Romain Koszul
Opublikowane w: Biorxiv, 2020
Wydawca: Biorxiv
DOI: 10.1101/2020.12.17.423195

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników