Noninvasive cell specific morphometry in neuroinflammation and degeneration

Time-dependent and anisotropic diffusion in the heart: linear and spherical tensor encoding with varying degree of motion compensation

Auteurs: Samo Lasic, Henrik Lundell, Filip Szczepankiewicz, Markus Nilsson, Jürgen E. Schneider, and Irvin Teh
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 28, 2020, Page(s) 4300
Éditeur: ISMRM

Serum and cerebrospinal fluid neurofilament levels predict longitudinal atrophy of the cervical spinal cord in progressive MS

Auteurs: Henrik Lundell, Jeppe Romme Christensen, Lars Börnsen, Cecilie Ammitzbøll, Helle Bach Søndergaard, Poul Erik Hyldgaard Jensen, Per Soelberg Sørensen, Ellen Garde, Finn Sellebjerg, Hartwig Roman Siebner
Publié dans: ECTRIMS, Numéro 2019, 2019, Page(s) 906
Éditeur: ECTRIMS

Micro-Anisotropy And Time-Dependent Diffusion In The Mouse Brain In Vivo With Spherical Tensor Encoding And The Spectral Principal Axis System

Auteurs: Samo Lasic, Nathalie Just, Matthew Budde, Henrik Lundell
Publié dans: proc. intl. soc. mag. reson. med., Numéro 31, 2023, Page(s) 5021
Éditeur: ISMRM

Stay on the beat: tuning in on time-dependent diffusion inthe heart

Auteurs: Henrik Lundell, Samo Lasic, Filip Szczepankiewicz, Markus Nilsson, Daniel Topgaard, Jürgen E. Schneider, Irvin Teh
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 28, 2020, Page(s) 959
Éditeur: ISMRM

Time-Dependence In Tensor-Valued Encoding In Ex Vivo Rat Heart

Auteurs: Richard J. Foster, Samo Lasič, Henrik Lundell, Filip Szczepankiewicz, Leah Khazin, Sven Plein, Erica Dall'Armellina, Nadira Y. Yuldasheva, Jürgen E. Schneider, Irvin Teh
Publié dans: proc. intl. soc. mag. reson. med., Numéro 31, 2023, Page(s) 5010
Éditeur: ISMRM

Investigating time dependent diffusion, microscopicanisotropy and T2 effects in the mouse heart

Auteurs: Henrik Lundell, Samo Lasic, Filip Szczepankiewicz, Beata Wereszczyńska, Matthew Budde, Erica Dall'Armellina, Nadira Yuldasheva6, Jürgen E. Schneider, and Irvin Teh
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 29, 2021, Page(s) 2470
Éditeur: ISMRM

Feasibility of cervical spinal cord cross-sectionalmeasurements from 3D T1w sagittal head MRI at 7T

Auteurs: Vanessa Wiggermann, Henrik Lundell, Mads Alexander Just Madsen, Christopher Fugl Madelung, Hartwig Roman Siebner
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 29, 2021, Page(s) 3448
Éditeur: ISMRM

Multidimensional Diffusion MRI Assists Myelin-sensitiveBound Pool Fraction in Differentiating MicrostructuralMaturity of Primate Brains

Auteurs: Yi He, Henrik Lundell, Ines Mexia Rodrigues, Matthew D. Budde, Mark D. Does, Maurice Ptito, Tim Bjørn Dyrby
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 28, 2020, Page(s) 861
Éditeur: ISMRM

Preliminary Evaluation Of Brain Neural Networks Following Chemogenetically-Induced Activation Of The Motor Cortex In Rats

Auteurs: Mathias Lysholt Mathiasen, Sascha Gude, Henrik Lundell, Hartwig Roman Siebner, Nathalie Just
Publié dans: proc. intl. soc. mag. reson. med., Numéro 31, 2023, Page(s) 3503
Éditeur: ISMRM

Metabolite diffusion weighted imaging with golden angle radial echo planar spectroscopic imaging

Auteurs: Vincent Oltman Boer, Itamar Ronen, Jan Ole Pedersen, Esben Thade Petersen, Henrik Lundell
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 27, 2019, Page(s) 3616
Éditeur: ISMRM

Probing complex morphologies at decreasing diffusion times using Diffusion-weighted MR Spectroscopy

Auteurs: Just, Nathalie; Lasic, Samo; Bentsen Christensen, Ditte; Valette, Julien; Dyrby, Tim; Siebner, Hartwig; Lundell, Henrik
Publié dans: proc. intl. soc. mag. reson. med., Numéro 30, 2022, Page(s) 980
Éditeur: ISMRM

Single-shot isotropic diffusion-weighted NMR spectroscopyin the human brain at 7T using tetrahedral encoding

Auteurs: Chloé Najac, Henrik Lundell, Hermien E. Kan, Andrew G. Webb, Itamar Ronen
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 28, 2020, Page(s) 739
Éditeur: ISMRM

The spectral tilt plot (STP) – new microstructuresignatures from spectrally anisotropic b-tensorencoding

Auteurs: Samo Lasic, Filip Szczepankiewicz, Markus Nilsson, Tim B. Dyrby, Henrik Lundell
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 29, 2021, Page(s) 297
Éditeur: ISMRM

Susceptibility-induced fiber orientation dependency ofthe DWI signal in white matter measured in ex vivorat brain at 7 T

Auteurs: Sidsel Winther, Mariam Andersson, Henrik Lundell, Tim Dyrby
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 29, 2021, Page(s) 2041
Éditeur: ISMRM

Tissue microstructure by ellipsoidal tensor encodingwith independently varying spectral anisotropy andtuning

Auteurs: Samo Lasic, Henrik Lundell
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 29, 2021, Page(s) 2459
Éditeur: ISMRM

Identification of ’black hole’ T1 hypointense lesions using different intensity thresholds on gradient-echo T1w MRI

Auteurs: Wiggermann, Vanessa; Arnau Martinez, Mie; Merhout, Jasmin; Romme Christensen, Jeppe; Blinkenberg, Morten; Sellebjerg, Finn; Lundell, Henrik; Siebner, Hartwig
Publié dans: proc. intl. soc. mag. reson. med, Numéro 30, 2022, Page(s) 783
Éditeur: ISMRM

Susceptibility-induced B-field inhomogeneity of undulating axons and effects on the DWI signal

Auteurs: Winther, Sidsel; Lundell, Henrik; Dyrby, Tim
Publié dans: proc. intl. soc. mag. reson. med., Numéro 30, 2022, Page(s) 1045
Éditeur: ISMRM

Time-dependent anisotropic diffusion in the mouse heart: feasibility of motion compensated tensor-valued encoding on a 7T preclinical scanner

Auteurs: Samo Lasic, Henrik Lundell, Beata Wereszczyńska, Matthew Budde, Nadira Yuldasheva, Filip Szczepankiewicz, Erica Dall’Armellina, Jürgen E. Schneider, Irvin Teh
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 29, 2021, Page(s) 3651
Éditeur: ISMRM

Reducing spectral anisotropy in isotropic b-tensor multidimensional diffusion encoding

Auteurs: Henrik Lundell, Markus Nilsson, Filip Szczepankiewicz, Carl-Fredrik Westin, Daniel Topgaard, Samo Lasic
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 27, 2019, Page(s) 3503
Éditeur: ISMRM

Data-driven separation of MRI signal components fortissue characterization

Auteurs: Sofie Rahbek, Kristoffer H. Madsen, Henrik Lundell, Faisal Mahmood, and Lars G. Hanson
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 29, 2021, Page(s) 2471
Éditeur: ISMRM

Feasibility of axon diameter estimation in complex fiber architectures by powder averaging of the diffusion MRI signal

Auteurs: Mariam Andersson, Marco Pizzolato, Hans Martin Kjer, Henrik Lundell, Tim B. Dyrby
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 29, 2021, Page(s) 645
Éditeur: ISMRM

A minimal geometrical model for Monte Carlo simulations of time dependent di!usion in axons

Auteurs: Henrik Lundell, Samo Lasic
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Mag., Numéro 29, 2021, Page(s) 3403
Éditeur: ISMRM

Time-Dependent Diffusion In The Human Heart In Vivo

Auteurs: Irvin Teh, Sam Coveney, Richard J. Foster, Filip Szczepankiewicz, Samo Lasič, Henrik Lundell, David Shelley, Lars Mueller, Maryam Afzali, Noor Sharrack, Nadira Y. Yuldasheva, Sven Plein, Erica Dall'Armellina, and Jürgen E. Schneider
Publié dans: proc. intl. soc. mag. reson. med., Numéro 31, 2023, Page(s) 344
Éditeur: ISMRM

Differences in diffusion-weighted MRS processing and fitting pipelines, and their effect on tissue modeling: Results from a workshop challenge.

Auteurs: Najac, Chloé; Döring, André; Clarke, William, Genovese, Guglielmo; Just, Nathalie; Kreis, Roland; Lundell, Henrik; Mosso, Jessie; Mougel, Eloïse; Oeltzschner, Georg; Palombo, Marco; Ligneul, Clémence
Publié dans: proc. intl. soc. mag. reson. med, Numéro 30, 2022, Page(s) 2616
Éditeur: ISMRM

Estimating compartment- and cell-specific microscopic anisotropy in the human brain using double-diffusion encoding spectroscopy at 7T

Auteurs: Chloé Najac, Henrik Lundell, Marjolein Bulk, Hermien E. Kan, Andrew G. Webb, Itamar Ronen
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 27, 2019, Page(s) 56
Éditeur: ISMRM

Spectral principal axes system (SPAS) and tuning of tensor-valued encoding for time-dependent anisotropic diffusion

Auteurs: Lasic, Samo; Just, Nathalie; Lundell, Henrik
Publié dans: proc. intl. soc. mag. reson. med., Numéro 30, 2022, Page(s) 2509
Éditeur: ISMRM

Orientation-dependent biases in powder averaging causedby inhomogeneous distributions of magnetic susceptibilityin white matter

Auteurs: Sidsel Winther, Henrik Lundell, Mariam Andersson, Tim Dyrby
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 28, 2020, Page(s) 734
Éditeur: ISMRM

The tuned trinity of b-tensors

Auteurs: Samo Lasic, Henrik Lundell, Daniel Topgaard
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 27, 2019, Page(s) 3490
Éditeur: ISMRM

Multidimensional Diffusion MRI in the Ex Vivo MouseHeart

Auteurs: Irvin Teh, Samo Lasic, Henrik Lundell, Beata Wereszczyńska, Matthew Budde, Erica Dall'Armellina, Nadira Yuldasheva, Filip Szczepankiewicz, and Jürgen E. Schneider
Publié dans: Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med., Numéro 29, 2021, Page(s) 3618
Éditeur: ISMRM

Relationship between cerebrospinal fluid biomarkers of inflammation and tissue damage in primary progressive multiple sclerosis

Auteurs: Jacob Talbot; Helene Højsgaard Chow; Mie Mahler; Sophie Buhelt; Rikke Holm Hansen; Henrik Lundell; Tua Vinther-Jensen; Marie N.N. Hellem; Jørgen E. Nielsen; Hartwig Roman Siebner; Marina R. von Essen; Finn Sellebjerg
Publié dans: Talbot , J , Højsgaard Chow , H , Mahler , M , Buhelt , S , Holm Hansen , R , Lundell , H , Vinther-Jensen , T , Hellem , M N N , Nielsen , J E , Siebner , H R , von Essen , M R & Sellebjerg , F 2022 , ' Relationship between cerebrospinal fluid biomarkers of inflammation and tissue damage in primary progressive multiple sclerosis ' , Multiple Sclerosis and Related Disorders , vol. 68 , 104209 . h, Numéro 1, 2022, ISSN 2211-0348
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.msard.2022.104209

Intrathecal CD8+CD20+ T Cells in Primary Progressive Multiple Sclerosis

Auteurs: Marina Rode von Essen, Jacob Talbot, Rikke Holm Holm Hansen, Helene Højsgaard Chow, Henrik Lundell, Hartwig Roman Siebner, Finn Sellebjerg
Publié dans: Neurol Neuroimmunol Neuroinflamm, Numéro 10 (5), 2023, Page(s) e200140, ISSN 2332-7812
Éditeur: American Academy of Neurology
DOI: 10.1212/nxi.0000000000200140

White matter diffusivity and its correlations to state measures of psychopathology in male refugees with posttraumatic stress disorder

Auteurs: Sigurd Wiingaard Uldall, Henrik Lundell, William F.C. Baaré, Hartwig Roman Siebner, Egill Rostrup, Jessica Carlsson
Publié dans: NeuroImage: Clinical, Numéro 33, 2022, Page(s) 102929, ISSN 2213-1582
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nicl.2021.102929

Association of Cortical Lesions With Regional Glutamate, GABA, <i>N</i> -Acetylaspartate, and Myoinositol Levels in Patients With Multiple Sclerosis

Auteurs: Mads A. Madsen, Michal Považan, Vanessa Wiggermann, Henrik Lundell, Morten Blinkenberg, Jeppe Romme Christensen, Finn Sellebjerg, Hartwig R. Siebner
Publié dans: Neurology, Numéro 103, 2024, ISSN 0028-3878
Éditeur: Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI: 10.1212/wnl.0000000000209543

An open-source tool for longitudinal whole-brain and white matter lesion segmentation

Auteurs: Stefano Cerri, Douglas N Greve, Andrew Hoopes, Henrik Lundell, Hartwig R Siebner, Mark Mühlau, Koen Van Leemput
Publié dans: NeuroImage:Clinical, Numéro 38, 2023, Page(s) 103354, ISSN 2213-1582
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nicl.2023.103354

Dimethyl Fumarate Treatment in Patients With Primary Progressive Multiple Sclerosis

Auteurs: Helene Højsgaard Chow, Jacob Talbot, Henrik Lundell, Camilla Gøbel Madsen, Lisbet Marstrand, Theis Lange, Mie Reith Mahler, Sophie Buhelt, Rikke Holm Hansen, Morten Blinkenberg, Jeppe Romme Christensen, Per Soelberg Sørensen, Marina Rode von Essen, Hartwig Roman Siebner, Finn Sellebjerg
Publié dans: Neurology - Neuroimmunology Neuroinflammation, Numéro 8/5, 2021, Page(s) e1037, ISSN 2332-7812
Éditeur: Wolters Kluwer Health
DOI: 10.1212/nxi.0000000000001037

Smoking, cardiovascular risk factors and LRP2 gene variation: Associations with disease severity, cognitive function and brain structure in primary progressive multiple sclerosis

Auteurs: Helene Højsgaard Chow, Jacob Talbot, Lisbet Marstrand, Henrik Lundell, Hartwig Roman Siebner, Helle Bach Søndergaard, Finn Sellebjerg
Publié dans: Multiple Sclerosis and Related Disorders, Numéro 56, 2021, Page(s) 103296, ISSN 2211-0348
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.msard.2021.103296

Data-driven separation of MRI signal components for tissue characterization

Auteurs: Sofie Rahbek, Kristoffer H. Madsen, Henrik Lundell, Faisal Mahmood, Lars G. Hanson
Publié dans: Journal of Magnetic Resonance, Numéro 333, 2021, Page(s) 107103, ISSN 1090-7807
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmr.2021.107103

Does powder averaging remove dispersion bias in diffusion MRI diameter estimates within real 3D axonal architectures?

Auteurs: Mariam Andersson, Marco Pizzolato, Hans Martin Kjer, Katrine Forum Skodborg, Henrik Lundell, Tim B. Dyrby
Publié dans: NeuroImage, Numéro 333, 2021, Page(s) 118718, ISSN 1053-8119
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2021.118718

Stay on the Beat With Tensor-Valued Encoding: Time-Dependent Diffusion and Cell Size Estimation in ex vivo Heart

Auteurs: Samo Lasič; Nadira Yuldasheva; Filip Szczepankiewicz; Markus Nilsson; Matthew Budde; Erica Dall’Armellina; Jürgen E. Schneider; Irvin Teh; Henrik Lundell
Publié dans: Front. Phys., Numéro 1, 2022, ISSN 2296-424X
Éditeur: Frontiers Media S. A.
DOI: 10.3389/fphy.2022.812115

Cerebellar imaging with diffusion magnetic resonance imaging: approaches, challenges, and potential

Auteurs: Henrik Lundell, Christopher J Steele
Publié dans: Current Opinion in Behavioral Sciences, Numéro 56, 2024, Page(s) 101353, ISSN 2352-1546
Éditeur: Elsevier Limited
DOI: 10.1016/j.cobeha.2024.101353

Dimethyl fumarate treatment of primary progressive multiple sclerosis: results of an open-label extension study

Auteurs: Helene Højsgaard Chow, Jacob Talbot, Henrik Lundell, Lisbet Marstrand, Camilla Gøbel Madsen, Helle Bach Søndergaard, Malene Bredahl Hansen, Per Solberg Sørensen, Hartwig Roman Siebner, Finn Sellebjerg
Publié dans: Multiple Sclerosis and Related Disorders, Numéro 70, 2023, Page(s) 104458, ISSN 2211-0348
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.msard.2022.104458

NfL and GFAP in serum are associated with microstructural brain damage in progressive multiple sclerosis

Auteurs: C. Ammitzbøll, T.B. Dyrby, L. Börnsen, K. Schreiber, R. Ratzer, J. Romme Christensen, P. Iversen, M. Magyari, H. Lundell, P.E.H. Jensen, P.S. Sørensen, H.R. Siebner, F. Sellebjerg
Publié dans: Multiple Sclerosis and Related Disorders, Numéro 77, 2024, Page(s) 104854, ISSN 2211-0348
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.msard.2023.104854

Multidimensional diffusion MRI with spectrally modulated gradients reveals unprecedented microstructural detail

Auteurs: H. Lundell, M. Nilsson, T. B. Dyrby, G. J. M. Parker, P. L. Hubbard Cristinacce, F.-L. Zhou, D. Topgaard, S. Lasič
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 9/1, 2019, Page(s) 1-12, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-019-45235-7

Cytosolic diffusivity and microscopic anisotropy of N -acetyl aspartate in human white matter with diffusion-weighted MRS at 7 T

Auteurs: Henrik Lundell, Carson Ingo, Tim B. Dyrby, Itamar Ronen
Publié dans: NMR in Biomedicine, 2020, Page(s) e4304, ISSN 0952-3480
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/nbm.4304

Cortical and Subcortical Effects of Transcutaneous Spinal Cord Stimulation in Humans with Tetraplegia

Auteurs: Francisco D. Benavides, Hang Jin Jo, Henrik Lundell, V. Reggie Edgerton, Yuri Gerasimenko, Monica A. Perez
Publié dans: The Journal of Neuroscience, Numéro 40/13, 2020, Page(s) 2633-2643, ISSN 0270-6474
Éditeur: Society for Neuroscience
DOI: 10.1523/jneurosci.2374-19.2020

Tuned exchange imaging: Can the filter exchange imaging pulse sequence be adapted for applications with thin slices and restricted diffusion?

Auteurs: Samo Lasič, Arthur Chakwizira, Henrik Lundell, Carl‐Fredrik Westin, Markus Nilsson
Publié dans: NMR in Biomedicine, Numéro 37, 2024, ISSN 0952-3480
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/nbm.5208

Compartmental diffusion and microstructural properties of human brain gray and white matter studied with double diffusion encoding magnetic resonance spectroscopy of metabolites and water

Auteurs: Henrik Lundell, Chloé Najac, Marjolein Bulk, Hermien E. Kan, Andrew G. Webb, Itamar Ronen
Publié dans: NeuroImage, Numéro 234, 2021, Page(s) 117981, ISSN 1053-8119
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.neuroimage.2021.117981

Linking lesions in sensorimotor cortex to contralateral hand function in multiple sclerosis: a 7 T MRI study

Auteurs: Mads A J Madsen, Vanessa Wiggermann, Marta F M Marques, Henrik Lundell, Stefano Cerri, Oula Puonti, Morten Blinkenberg, Jeppe Romme Christensen, Finn Sellebjerg, Hartwig R Siebner
Publié dans: Brain, Numéro 145, 2022, Page(s) 3522-3535, ISSN 0006-8950
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/brain/awac203

Double diffusion encoding and applications for biomedical imaging

Auteurs: Rafael N. Henriques, Marco Palombo, Sune N. Jespersen, Noam Shemesh, Henrik Lundell, Andrada Ianuş
Publié dans: Journal of Neuroscience Methods, Numéro 348, 2021, Page(s) 108989, ISSN 0165-0270
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jneumeth.2020.108989

Chapter 2. Diffusion Encoding with General Gradient Waveforms

Auteurs: Henrik Lundell, Samo Lasic
Publié dans: Advanced Diffusion Encoding Methods in MRI, 2020, Page(s) 12-67, ISBN 978-1-78801-726-8
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/9781788019910-00012

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