Objectif NEXTGEN proposes the bold step of using whole genome data to develop and optimise conservation genetic management of livestock diversity for the foreseeable future. The rationale for choosing whole genome data is to ‘future-proof’ DNA-based analysis in livestock conservation against upcoming changes in technology and analysis. Thus, in the context of whole genome data availability, our global objective is to develop cost-effective optimized methodologies for preserving farm-animal biodiversity, using cattle, sheep, and goats as model species. More specifically, NEXTGEN will: - produce whole genome data in selected populations; - develop the necessary bioinformatics approaches, taking advantage of the 1000 human genomes project, and focusing on the identification of genomic regions under recent selection (adaptive / neutral variation); - develop the methods for optimizing breeding and biobanking, taking into account both neutral and adaptive variations; - develop innovative biobanking methods based on freeze-dried nuclei; - provide guidelines for studying disease resistance and genome/environment relationships in a spatial context; - assess the value of wild ancestors and breeds from domestication centres as genetic resources; - assess the performance of a surrogate marker system compared with whole genome sequence data for preserving biodiversity; - provide efficient training and a wide dissemination of the improved methodologies. The consortium has been designed to specifically reach these objectives, and encompasses skills in conservation genetics, bioinformatics, biobanking and breeding technologies, GIScience. The work plan has been established with great care. The sequencing task has been postponed to year 3 to take advantage of cost dynamics, while the two first years are dedicated to bioinformatics and to an innovative sampling strategy that fully integrates the spatial aspect and that offers more value at the data analysis stage. Champ scientifique natural sciencescomputer and information sciencesdata sciencenatural sciencesbiological sciencesecologyecosystemsagricultural sciencesanimal and dairy sciencedomestic animalsanimal husbandrynatural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomes Programme(s) FP7-KBBE - Specific Programme "Cooperation": Food, Agriculture and Biotechnology Thème(s) KBBE-2009-1-1-03 - Optimisation of methods to maintain farm animal biodiversity – SICA Appel à propositions FP7-KBBE-2009-3 Voir d’autres projets de cet appel Régime de financement CP-FP-SICA - Small/medium-scale focused research project for specific cooperation actions dedicated to international cooperation partner countries(SICA) Coordinateur CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS Contribution de l’UE € 1 257 443,00 Adresse RUE MICHEL ANGE 3 75794 Paris France Voir sur la carte Région Ile-de-France Ile-de-France Paris Type d’activité Research Organisations Contact administratif Guillaume Rochet (Mr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée Participants (10) Trier par ordre alphabétique Trier par contribution de l’UE Tout développer Tout réduire CARDIFF UNIVERSITY Royaume-Uni Contribution de l’UE € 253 968,00 Adresse NEWPORT ROAD 30 36 CF24 0DE Cardiff Voir sur la carte Région Wales East Wales Cardiff and Vale of Glamorgan Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Nick Bodycombe (Mr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée UNIVERSITA CATTOLICA DEL SACRO CUORE Italie Contribution de l’UE € 250 376,00 Adresse LARGO GEMELLI 1 20123 Milano Voir sur la carte Région Nord-Ovest Lombardia Milano Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Libero Ranelli (Dr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée PARCO TECNOLOGICO PADANO S.R.L. Italie Contribution de l’UE € 236 880,00 Adresse Via Einstein - Localita Cascina Codazza 26900 LODI Voir sur la carte Région Nord-Ovest Lombardia Lodi Type d’activité Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contact administratif Gianluca Carenzo (Dr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY Allemagne Contribution de l’UE € 353 104,00 Adresse Meyerhofstrasse 1 69117 Heidelberg Voir sur la carte Région Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis Type d’activité Research Organisations Contact administratif Tom Ratcliff (Mr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée ECOLE POLYTECHNIQUE FEDERALE DE LAUSANNE Suisse Contribution de l’UE € 189 504,00 Adresse BATIMENT CE 3316 STATION 1 1015 Lausanne Voir sur la carte Région Schweiz/Suisse/Svizzera Région lémanique Vaud Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Véronique Boillat-Kireev (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée UNIVERSITA DEGLI STUDI DI TERAMO Italie Contribution de l’UE € 135 828,00 Adresse VIA RENATO BALZARINI 1 3 5 7 64100 Teramo Voir sur la carte Région Sud Abruzzo Teramo Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Maria Luigia Scuteri (Dr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée MAKERERE UNIVERSITY Ouganda Contribution de l’UE € 109 200,00 Adresse Main Campus 256 Kampala Voir sur la carte Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Vincent Muwanika (Dr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Coût total Aucune donnée INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE AGRONOMIQUE Maroc Contribution de l’UE € 143 808,00 Adresse AVENUE DE LA VICTOIRE 10000 Rabat Voir sur la carte Type d’activité Research Organisations Contact administratif Mohamed Badraoui (Prof.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée Gorgan University of Agricultural Science and Natural resources Iran Contribution de l’UE € 69 888,00 Adresse Shahid Beheshti street 4913815749 GORGAN Voir sur la carte Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Hassan Soltanloo (Dr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée COMMONWEALTH SCIENTIFIC AND INDUSTRIAL RESEARCH ORGANISATION Australie Contribution de l’UE Aucune donnée Adresse CLUNIES ROSS STREET CSIRO BLACK MOUNTAIN SCIENCE AND INNOVATION PARK 2601 Acton Act Voir sur la carte Type d’activité Research Organisations Contact administratif James Kijas (Dr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée