Estrazione di DNA plasmidico più sicura ed efficiente
Gli antimicrobici sono farmaci naturali o sintetici che inibiscono o uccidono i batteri e sono quindi preziosi per il controllo di malattie infettive mortali. Dato loro successo in medicina umana, gli antimicrobici vengono usati anche per trattare le malattie batteriche negli animali e nelle piante. Questo avviene in particolare nel Sud-est asiatico, dove l'industria di acquacoltura è un segmento predominante della produzione zootecnica. Per ora sono disponibili poche informazioni sul tipo e sulla quantità di utilizzo di antimicrobici nelle aziende di allevamento ittico, pertanto la valutazione di possibili rischi per la salute rimane una sfida. Uno di questi rischi potenziali è lo sviluppo di batteri antimicrobici resistenti causati dal rilascio di antimicrobici nell'ambiente, che compromettono la salute dell'uomo e la produttività futura. Pertanto, il progetto ASIARESIST ha studiato la probabilità di incidenza dei geni di resistenza antimicrobica trasferibili nell'acquacoltura del Sud-est asiatico. Lo scopo era individuare i punti critici di controllo (CCP) presso i quali i piscicoltori possono utilizzare i sistemi di monitoraggio per allontanare o eradicare i pericoli alla sicurezza di alimenti e ambiente. Nell'ambito di questa ricerca, è stato migliorato un metodo per la mini-preparazione di DNA plasmidico dai batteri trovati nei siti di acquacoltura. Questo isolamento su piccola scala di DNA plasmidico si basava sulla lisi alcalina e consentiva di estrarre DNA plasmidico con peso molecolare elevato. Il DNA plasmidico consiste in un anello di DNA che non si trova in un cromosoma, ma che è in grado di replicarsi autonomamente. Viene spesso usato per purificare una sequenza specifica perché si può facilmente eliminare dal resto del genoma. Di conseguenza, si può evitare l'uso di colonne di purificazione di DNA e di solventi nocivi. Grazie a queste caratteristiche, il metodo fornisce mezzi efficienti ed economici per analizzare il DNA plasmidico. Inoltre, è adatto ad altri gruppi batterici con diverse condizioni di crescita batterica.