Epigenetic regulation of endocrine therapy resistance in breast cancer: A systems medicine approach to predict treatment outcome

Leistungen

Prizes (best presentation and publication) received at third EpiPredict annual meeting.

Prizes (best presentation, best publication, and best exposure for the lay public) received at fourth annual meeting

PhD degrees awarded

Prizes (best presentation, best publication, and best exposure for the lay public) received at second EpiPredict annual meeting.

Prize first annual meeting

Prize (best presentation) received at first EpiPredict annual meeting.

Veröffentlichungen

NET works after all? Engineering robustness through diversity

Autoren: Thierry D.G.A. Mondeel, Stefania Astrologo, Yanfei Zhang, Hans V. Westerhoff
Veröffentlicht in: IFAC-PapersOnLine, Ausgabe 51/19, 2018, Seite(n) 128-137, ISSN 2405-8963
Herausgeber: Elsevier- IFAC
DOI: 10.1016/j.ifacol.2018.09.007

Enhancer mapping uncovers phenotypic heterogeneity and evolution in patients with luminal breast cancer

Autoren: Darren K. Patten, Giacomo Corleone, Balázs Győrffy, Ylenia Perone, Neil Slaven, Iros Barozzi, Edina Erdős, Alina Saiakhova, Kate Goddard, Andrea Vingiani, Sami Shousha, Lőrinc Sándor Pongor, Dimitri J. Hadjiminas, Gaia Schiavon, Peter Barry, Carlo Palmieri, Raul C. Coombes, Peter Scacheri, Giancarlo Pruneri, Luca Magnani
Veröffentlicht in: Nature Medicine, Ausgabe 24/9, 2018, Seite(n) 1469-1480, ISSN 1078-8956
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-018-0091-x

Epigenetic editing: towards realization of the curable genome concept

Autoren: D Goubert, W F Beckman, P J Verschure, M G Rots
Veröffentlicht in: Convergent Science Physical Oncology, Ausgabe 3/1, 2017, Seite(n) 013006, ISSN 2057-1739
Herausgeber: IOP PUBLISHING LTD
DOI: 10.1088/2057-1739/aa5cc0

Extensive and systematic rewiring of histone post-translational modifications in cancer model systems

Autoren: Roberta Noberini, Daniela Osti, Claudia Miccolo, Cristina Richichi, Michela Lupia, Giacomo Corleone, Sung-Pil Hong, Piergiuseppe Colombo, Bianca Pollo, Lorenzo Fornasari, Giancarlo Pruneri, Luca Magnani, Ugo Cavallaro, Susanna Chiocca, Saverio Minucci, Giuliana Pelicci, Tiziana Bonaldi
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 46/8, 2018, Seite(n) 3817-3832, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gky224

Targeting PLK1 overcomes T-DM1 resistance via CDK1-dependent phosphorylation and inactivation of Bcl-2/xL in HER2-positive breast cancer

Autoren: Özge Saatci, Simone Borgoni, Özge Akbulut, Selvi Durmuş, Umar Raza, Erol Eyüpoğlu, Can Alkan, Aytekin Akyol, Özgür Kütük, Stefan Wiemann, Özgür Şahin
Veröffentlicht in: Oncogene, Ausgabe 37/17, 2018, Seite(n) 2251-2269, ISSN 0950-9232
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41388-017-0108-9

Targeted epigenetic editing of SPDEF reduces mucus production in lung epithelial cells

Autoren: Juan Song, David Cano Rodriguez, Melanie Winkle, Rutger A.F. Gjaltema, Désirée Goubert, Tomasz P. Jurkowski, Irene H Heijink, Marianne G. Rots, Machteld N Hylkema
Veröffentlicht in: American Journal of Physiology - Lung Cellular and Molecular Physiology, 2016, Seite(n) ajplung.00059.2016, ISSN 1040-0605
Herausgeber: American Physiological Society
DOI: 10.1152/ajplung.00059.2016

Acquired CYP19A1 amplification is an early specific mechanism of aromatase inhibitor resistance in ERα metastatic breast cancer

Autoren: Luca Magnani, Gianmaria Frigè, Raffaella Maria Gadaleta, Giacomo Corleone, Sonia Fabris, Hermannus Kempe, Pernette J Verschure, Iros Barozzi, Valentina Vircillo, Sung-Pil Hong, Ylenia Perone, Massimo Saini, Andreas Trumpp, Giuseppe Viale, Antonino Neri, Simak Ali, Marco Angelo Colleoni, Giancarlo Pruneri, Saverio Minucci
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 49/3, 2017, Seite(n) 444-450, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ng.3773

Cell-to-Cell Transcription Variability as Measured by Single-Molecule RNA FISH to Detect Epigenetic State Switching

Autoren: William Beckman, Ilona M. Vuist, Hermannus Kempe, Pernette J. Verschure
Veröffentlicht in: Epigenome Editing, Ausgabe 1767, 2018, Seite(n) 385-393, ISBN 978-1-4939-7773-4
Herausgeber: Springer New York
DOI: 10.1007/978-1-4939-7774-1_21

Establishment of Cell Lines Stably Expressing dCas9-Fusions to Address Kinetics of Epigenetic Editing

Autoren: Désirée Goubert, Mihály Koncz, Antal Kiss, Marianne G. Rots
Veröffentlicht in: Epigenome Editing, Ausgabe 1767, 2018, Seite(n) 395-415, ISBN 978-1-4939-7773-4
Herausgeber: Springer New York
DOI: 10.1007/978-1-4939-7774-1_22

Rewriting DNA Methylation Signatures at Will: The Curable Genome Within Reach?

Autoren: Sabine Stolzenburg, Désirée Goubert, Marianne G. Rots
Veröffentlicht in: DNA Methyltransferases - Role and Function, Ausgabe 945, 2016, Seite(n) 475-490, ISBN 978-3-319-43622-7
Herausgeber: Springer International Publishing
DOI: 10.1007/978-3-319-43624-1_17

Chromatin Immunoprecipitation and High-Throughput Sequencing (ChIP-Seq): Tips and Tricks Regarding the Laboratory Protocol and Initial Downstream Data Analysis

Autoren: Darren K. Patten, Giacomo Corleone, Luca Magnani
Veröffentlicht in: Epigenome Editing - Methods and Protocols, Ausgabe 1767, 2018, Seite(n) 271-288, ISBN 978-1-4939-7773-4
Herausgeber: Springer New York
DOI: 10.1007/978-1-4939-7774-1_15

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