Identification and analysis of novel mitochondrial proteins encoded by small open reading frames

Projektinformationen

MITOsmORFs

ID Finanzhilfevereinbarung: 648235

DOI 10.3030/648235

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 28 April 2015

Startdatum 1 September 2015

Enddatum 31 August 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 2 000 000,00

EU-Beitrag € 2 000 000,00

Koordiniert durch

UNIVERSITAETSKLINIKUM FREIBURG
Germany

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (22)

Quantitative high-confidence human mitochondrial proteome and its dynamics in cellular context

Autoren: Marcel Morgenstern, Christian D. Peikert, Philipp Lübbert, Ida Suppanz, Cinzia Klemm, Oliver Alka, Conny Steiert, Nataliia Naumenko, Alexander Schendzielorz, Laura Melchionda, Wignand W.D. Mühlhäuser, Bettina Knapp, Jakob D. Busch, Sebastian B. Stiller, Stefan Dannenmaier, Caroline Lindau, Mariya Licheva, Christopher Eickhorst, Riccardo Galbusera, Ralf M. Zerbes, Michael T. Ryan, Claudine Kraft
Veröffentlicht in: Cell Metabolism, 2021, ISSN 1550-4131
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cmet.2021.11.001

Definition of a High-Confidence Mitochondrial Proteome at Quantitative Scale

Autoren: Marcel Morgenstern, Sebastian B. Stiller, Philipp Lübbert, Christian D. Peikert, Stefan Dannenmaier, Friedel Drepper, Uri Weill, Philipp Höß, Reinhild Feuerstein, Michael Gebert, Maria Bohnert, Martin van der Laan, Maya Schuldiner, Conny Schütze, Silke Oeljeklaus, Nikolaus Pfanner, Nils Wiedemann, Bettina Warscheid
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 19/13, 2017, Seite(n) 2836-2852, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2017.06.014

Charting organellar importomes by quantitative mass spectrometry

Autoren: Christian D. Peikert, Jan Mani, Marcel Morgenstern, Sandro Käser, Bettina Knapp, Christoph Wenger, Anke Harsman, Silke Oeljeklaus, André Schneider, Bettina Warscheid
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 8, 2017, Seite(n) 15272, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms15272

Metabolic profiling of isolated mitochondria and cytoplasm reveals compartment-specific metabolic responses

Autoren: Daqiang Pan, Caroline Lindau, Simon Lagies, Nils Wiedemann, Bernd Kammerer
Veröffentlicht in: Metabolomics, Ausgabe 14/5, 2018, ISSN 1573-3882
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s11306-018-1352-x

Membrane protein insertion through a mitochondrial β-barrel gate

Autoren: Alexandra I. C. Höhr, Caroline Lindau, Christophe Wirth, Jian Qiu, David A. Stroud, Stephan Kutik, Bernard Guiard, Carola Hunte, Thomas Becker, Nikolaus Pfanner, Nils Wiedemann
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 359/6373, 2018, Seite(n) eaah6834, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aah6834

Identification of new channels by systematic analysis of the mitochondrial outer membrane

Autoren: Vivien Krüger, Thomas Becker, Lars Becker, Malayko Montilla-Martinez, Lars Ellenrieder, F.-Nora Vögtle, Helmut E. Meyer, Michael T. Ryan, Nils Wiedemann, Bettina Warscheid, Nikolaus Pfanner, Richard Wagner, Chris Meisinger
Veröffentlicht in: The Journal of Cell Biology, Ausgabe 216/11, 2017, Seite(n) 3485-3495, ISSN 0021-9525
Herausgeber: Rockefeller University Press
DOI: 10.1083/jcb.201706043

Respiratory chain supercomplexes associate with the cysteine desulfurase complex of the iron–sulfur cluster assembly machinery

Autoren: Lena Böttinger, Christoph U. Mårtensson, Jiyao Song, Nicole Zufall, Nils Wiedemann, Thomas Becker
Veröffentlicht in: Molecular Biology of the Cell, Ausgabe 29/7, 2018, Seite(n) 776-785, ISSN 1059-1524
Herausgeber: American Society for Cell Biology
DOI: 10.1091/mbc.E17-09-0555

INA complex liaises the F1Fo-ATP synthase membrane motor modules

Autoren: Nataliia Naumenko, Marcel Morgenstern, Robert Rucktäschel, Bettina Warscheid, Peter Rehling
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 8/1, 2017, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-017-01437-z

tRNAs and proteins use the same import channel for translocation across the mitochondrial outer membrane of trypanosomes

Autoren: Moritz Niemann, Anke Harsman, Jan Mani, Christian D. Peikert, Silke Oeljeklaus, Bettina Warscheid, Richard Wagner, André Schneider
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 114/37, 2017, Seite(n) E7679-E7687, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1711430114

Quantitative proteomics identifies redox switches for global translation modulation by mitochondrially produced reactive oxygen species

Autoren: Ulrike Topf, Ida Suppanz, Lukasz Samluk, Lidia Wrobel, Alexander Böser, Paulina Sakowska, Bettina Knapp, Martyna K. Pietrzyk, Agnieszka Chacinska, Bettina Warscheid
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-017-02694-8

The mitochondrial TMEM177 associates with COX20 during COX2 biogenesis

Autoren: Isotta Lorenzi, Silke Oeljeklaus, Abhishek Aich, Christin Ronsör, Sylvie Callegari, Jan Dudek, Bettina Warscheid, Sven Dennerlein, Peter Rehling
Veröffentlicht in: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research, Ausgabe 1865/2, 2018, Seite(n) 323-333, ISSN 0167-4889
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbamcr.2017.11.010

Structural Basis of Membrane Protein Chaperoning through the Mitochondrial Intermembrane Space

Autoren: Katharina Weinhäupl, Caroline Lindau, Audrey Hessel, Yong Wang, Conny Schütze, Tobias Jores, Laura Melchionda, Birgit Schönfisch, Hubert Kalbacher, Beate Bersch, Doron Rapaport, Martha Brennich, Kresten Lindorff-Larsen, Nils Wiedemann, Paul Schanda
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 175/5, 2018, Seite(n) 1365-1379.e25, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2018.10.039

Complete Native Stable Isotope Labeling by Amino Acids of Saccharomyces cerevisiae for Global Proteomic Analysis

Autoren: Stefan Dannenmaier, Sebastian B. Stiller, Marcel Morgenstern, Philipp Lübbert, Silke Oeljeklaus, Nils Wiedemann, Bettina Warscheid
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, Ausgabe 90/17, 2018, Seite(n) 10501-10509, ISSN 0003-2700
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.8b02557

Separating mitochondrial protein assembly and endoplasmic reticulum tethering by selective coupling of Mdm10

Autoren: Lars Ellenrieder, Łukasz Opaliński, Lars Becker, Vivien Krüger, Oliver Mirus, Sebastian P. Straub, Katharina Ebell, Nadine Flinner, Sebastian B. Stiller, Bernard Guiard, Chris Meisinger, Nils Wiedemann, Enrico Schleiff, Richard Wagner, Nikolaus Pfanner, Thomas Becker
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 7, 2016, Seite(n) 13021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/ncomms13021

Dynamic organization of the mitochondrial protein import machinery

Autoren: Sebastian P. Straub, Sebastian B. Stiller, Nils Wiedemann, Nikolaus Pfanner
Veröffentlicht in: Biological Chemistry, Ausgabe 397/11, 2016, ISSN 1431-6730
Herausgeber: Walter de Gruyter GmbH & Co. KG
DOI: 10.1515/hsz-2016-0145

Mitochondrial Machineries for Protein Import and Assembly

Autoren: Nils Wiedemann, Nikolaus Pfanner
Veröffentlicht in: Annual Review of Biochemistry, Ausgabe 86/1, 2016, ISSN 0066-4154
Herausgeber: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-biochem-060815-014352

Heat Stress-Induced Metabolic Remodeling in Saccharomyces cerevisiae

Autoren: Daqiang Pan, Nils Wiedemann, Bernd Kammerer
Veröffentlicht in: Metabolites, Ausgabe 9/11, 2019, Seite(n) 266, ISSN 2218-1989
Herausgeber: Springer
DOI: 10.3390/metabo9110266

The mitochondrial carrier pathway transports non-canonical substrates with an odd number of transmembrane segments

Autoren: Heike Rampelt, Iva Sucec, Beate Bersch, Patrick Horten, Inge Perschil, Jean-Claude Martinou, Martin van der Laan, Nils Wiedemann, Paul Schanda, Nikolaus Pfanner
Veröffentlicht in: BMC Biology, Ausgabe 18/1, 2020, ISSN 1741-7007
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-019-0733-6

Mitochondrial proteins: from biogenesis to functional networks

Autoren: Nikolaus Pfanner, Bettina Warscheid, Nils Wiedemann
Veröffentlicht in: Nature Reviews Molecular Cell Biology, Ausgabe 20/5, 2019, Seite(n) 267-284, ISSN 1471-0072
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-018-0092-0

The mitochondrial transporter SLC25A25 links ciliary TRPP2 signaling and cellular metabolism

Autoren: Alexis Hofherr, Claudia Seger, Fiona Fitzpatrick, Tilman Busch, Elisabeth Michel, Jingting Luan, Lea Osterried, Frieder Linden, Albrecht Kramer-Zucker, Barbara Wakimoto, Conny Schütze, Nils Wiedemann, Anna Artati, Jerzy Adamski, Gerd Walz, Edmund R. S. Kunji, Craig Montell, Terry Watnick, Michael Köttgen
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 16/8, 2018, Seite(n) e2005651, ISSN 1545-7885
Herausgeber: PLOS
DOI: 10.1371/journal.pbio.2005651

Mitochondrial OXA Translocase Plays a Major Role in Biogenesis of Inner-Membrane Proteins

Autoren: Sebastian B. Stiller, Jan Höpker, Silke Oeljeklaus, Conny Schütze, Sandra G. Schrempp, Jens Vent-Schmidt, Susanne E. Horvath, Ann E. Frazier, Natalia Gebert, Martin van der Laan, Maria Bohnert, Bettina Warscheid, Nikolaus Pfanner, Nils Wiedemann
Veröffentlicht in: Cell Metabolism, Ausgabe 23/5, 2016, Seite(n) 901-908, ISSN 1550-4131
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cmet.2016.04.005

One library to make them all: streamlining the creation of yeast libraries via a SWAp-Tag strategy

Autoren: Ido Yofe, Uri Weill, Matthias Meurer, Silvia Chuartzman, Einat Zalckvar, Omer Goldman, Shifra Ben-Dor, Conny Schütze, Nils Wiedemann, Michael Knop, Anton Khmelinskii, Maya Schuldiner
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 13/4, 2016, Seite(n) 371-378, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/nmeth.3795