TACK Superphylum and Lokiarchaeota Evolution: Dissecting the Ecology and Evolution of Archaea to Elucidate the Prokaryote to Eukaryote Transition

Informations projet

TACKLE

N° de convention de subvention: 695192

DOI 10.3030/695192

Projet clôturé

Date de signature de la CE 28 Juillet 2016

Date de début 1 Août 2016

Date de fin 31 Juillet 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total € 2 500 000,00

Contribution de l’UE € 2 500 000,00

Coordonné par

UNIVERSITAT WIEN
Austria

Publications

Peer reviewed articles (17)

Comparative CRISPR type III-based knockdown of essential genes in hyperthermophilic Sulfolobales and the evasion of lethal gene silencing

Auteurs: Isabelle Anna Zink, Thomas Fouqueau, Gabriel Tarrason Risa, Finn Werner, Buzz Baum, Udo Bläsi, Christa Schleper
Publié dans: RNA Biology, Numéro 18/3, 2021, Page(s) 421-434, ISSN 1547-6286
Éditeur: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15476286.2020.1813411

Ancestral Reconstructions Decipher Major Adaptations of Ammonia-Oxidizing Archaea upon Radiation into Moderate Terrestrial and Marine Environments

Auteurs: Sophie S. Abby, Melina Kerou, Christa Schleper
Publié dans: mBio, Numéro 11/5, 2020, ISSN 2150-7511
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.02371-20

Genome wide transcriptomic analysis of the soil ammonia oxidizing archaeon Nitrososphaera viennensis upon exposure to copper limitation

Auteurs: Carolina Reyes, Logan H. Hodgskiss, Melina Kerou, Thomas Pribasnig, Sophie S. Abby, Barbara Bayer, Stephan M. Kraemer, Christa Schleper
Publié dans: The ISME Journal, Numéro 14/11, 2020, Page(s) 2659-2674, ISSN 1751-7362
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41396-020-0715-2

CRISPR-mediated gene silencing reveals involvement of the archaeal S-layer in cell division and virus infection

Auteurs: Isabelle Anna Zink, Kevin Pfeifer, Erika Wimmer, Uwe B. Sleytr, Bernhard Schuster, Christa Schleper
Publié dans: Nature Communications, Numéro 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-12745-x

Nitrogen Isotope Fractionation During Archaeal Ammonia Oxidation: Coupled Estimates From Measurements of Residual Ammonium and Accumulated Nitrite

Auteurs: Maria Mooshammer, Ricardo J. E. Alves, Barbara Bayer, Michael Melcher, Michaela Stieglmeier, Lara Jochum, Simon K.-M. R. Rittmann, Margarete Watzka, Christa Schleper, Gerhard J. Herndl, Wolfgang Wanek
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 1664302X, 2020, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2020.01710

A phylogenetic and proteomic reconstruction of eukaryotic chromatin evolution

Auteurs: Xavier Grau-Bové, Cristina Navarrete, Cristina Chiva, Thomas Pribasnig, Meritxell Antó, Guifré Torruella, Luis Javier Galindo, Bernd Franz Lang, David Moreira, Purificación López-Garcia, Iñaki Ruiz-Trillo, Christa Schleper, Eduard Sabidó & Arnau Sebé-Pedrós
Publié dans: Nature Ecology & Evolution, Numéro 2397334X, 2022, Page(s) 1007-1023, ISSN 2397-334X
Éditeur: Nature Ecology & Evolution
DOI: 10.1038/s41559-022-01771-6

Proteomics and comparative genomics of Nitrososphaera viennensis reveal the core genome and adaptations of archaeal ammonia oxidizers

Auteurs: Melina Kerou, Pierre Offre, Luis Valledor, Sophie S. Abby, Michael Melcher, Matthias Nagler, Wolfram Weckwerth, Christa Schleper
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 113/49, 2016, Page(s) E7937-E7946, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1601212113

Chemotaxonomic characterisation of the thaumarchaeal lipidome

Auteurs: Felix J. Elling, Martin Könneke, Graeme W. Nicol, Michaela Stieglmeier, Barbara Bayer, Eva Spieck, José R. de la Torre, Kevin W. Becker, Michael Thomm, James I. Prosser, Gerhard J. Herndl, Christa Schleper, Kai-Uwe Hinrichs
Publié dans: Environmental Microbiology, Numéro 19/7, 2017, Page(s) 2681-2700, ISSN 1462-2912
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/1462-2920.13759

Unifying the global phylogeny and environmental distribution of ammonia-oxidising archaea based on amoA genes

Auteurs: Ricardo J. Eloy Alves, Bui Quang Minh, Tim Urich, Arndt von Haeseler, Christa Schleper
Publié dans: Nature Communications, Numéro 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-03861-1

Candidatus Nitrosocaldus cavascurensis, an Ammonia Oxidizing, Extremely Thermophilic Archaeon with a Highly Mobile Genome

Auteurs: Sophie S. Abby, Michael Melcher, Melina Kerou, Mart Krupovic, Michaela Stieglmeier, Claudia Rossel, Kevin Pfeifer, Christa Schleper
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 9, 2018, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2018.00028

Ammonia Oxidation by the Arctic Terrestrial Thaumarchaeote Candidatus Nitrosocosmicus arcticus Is Stimulated by Increasing Temperatures

Auteurs: Ricardo J. Eloy Alves, Melina Kerou, Anna Zappe, Romana Bittner, Sophie S. Abby, Heiko A. Schmidt, Kevin Pfeifer, Christa Schleper
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 10, 2019, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2019.01571

Metagenomes from Coastal Marine Sediments Give Insights into the Ecological Role and Cellular Features of Loki - and Thorarchaeota

Auteurs: Lokeshwaran Manoharan, Jessica A. Kozlowski, Robert W. Murdoch, Frank E. Löffler, Filipa L. Sousa, Christa Schleper
Publié dans: mBio, Numéro 10/5, 2019, ISSN 2150-7511
Éditeur: ASM
DOI: 10.1128/mbio.02039-19

Heavily Armed Ancestors: CRISPR Immunity and Applications in Archaea with a Comparative Analysis of CRISPR Types in Sulfolobales

Auteurs: Isabelle Anna Zink, Erika Wimmer, Christa Schleper
Publié dans: Biomolecules, Numéro 10/11, 2020, Page(s) 1523, ISSN 2218-273X
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/biom10111523

Microbial diversity of a closed salt lagoon in the Puertecitos area, Upper Gulf of California

Auteurs: Jessica A Kozlowski, Markes E Johnson, Jorge Ledesma-Vasquez, Daniel Birgel, Jörn Peckmann, Christa Schleper
Publié dans: Ciencias Marinas, Numéro 23959053, 2018, Page(s) 71-90, ISSN 2395-9053
Éditeur: Ciencias Marinas
DOI: 10.7773/cm.v44i2.2825

Linking 16S rRNA Gene Classification to amoA Gene Taxonomy Reveals Environmental Distribution of Ammonia-Oxidizing Archaeal Clades in Peatland Soils

Auteurs: Haitao Wang, Alexandre Bagnoud, Rafael I. Ponce-Toledo, Melina Kerou, Micha Weil, Christa Schleper, Tim Urich
Publié dans: mSystems, Numéro 23795077, 2021, Page(s) e00546-21, ISSN 2379-5077
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/msystems.00546-21

Comparative Proteomics of Three Species of Ammonia-Oxidizing Bacteria

Auteurs: Jackie K. Zorz, Jessica A. Kozlowski, Lisa Y. Stein, Marc Strous, Manuel Kleiner
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 1664302X, 2018, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2018.00938

Genomes of Thaumarchaeota from deep sea sediments reveal specific adaptations of three independently evolved lineages.

Auteurs: Melina Kerou, Rafael I. Ponce-Toledo, Rui Zhao, Sophie S. Abby, Miho Hirai, Hidetaka Nomaki, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, Steffen L. Jørgensen & Christa Schleper
Publié dans: Genomes of Thaumarchaeota from deep sea sediments reveal specific adaptations of three independently evolved lineages, Numéro 17517370, 2021, Page(s) 2792-2808, ISSN 1751-7370
Éditeur: The ISME Journal (ISME J)
DOI: 10.1038/s41396-021-00962-6