Dissecting and targeting ubiquitin networks in the course of bacterial infections

Projektinformationen

Ub-BAC

ID Finanzhilfevereinbarung: 742720

DOI 10.3030/742720

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 8 Juni 2017

Startdatum 1 Juli 2017

Enddatum 30 Juni 2022

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 2 500 000,00

EU-Beitrag € 2 500 000,00

Koordiniert durch

JOHANN WOLFGANG GOETHE-UNIVERSITAET FRANKFURT AM MAIN
Germany

Veröffentlichungen

Non-peer reviewed articles (1)

Gasdermin B in the host–pathogen tug-of-war

Autoren: Maculins, T & Dikic I
Veröffentlicht in: Cell Research, Ausgabe 31, 2021, Seite(n) 1043-1044, ISSN 1001-0602
Herausgeber: Kexue Chubaneshe/Science Press
DOI: 10.1038/s41422-021-00544-3

Peer reviewed articles (17)

Biochemical characterization of protease activity of Nsp3 from SARS-CoV-2 and its inhibition by nanobodies.

Autoren: Lee A. Armstrong; Sven M. Lange; Virginia Dee Cesare; Stephen P. Matthews; Raja Sekhar Nirujogi; Isobel Cole; Anthony G. Hope; Fraser Cunningham; Rachel Toth; Rukmini Mukherjee; Denisa Bojkova; Franz S. Gruber; David W. Gray; Paul G. Wyatt; Jindrich Cinatl; Ivan Dikic; Ivan Dikic; Paul Davies; Yogesh Kulathu
Veröffentlicht in: PLoS ONE, Ausgabe 4, 2021, ISSN 1932-6203
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0253364

SIK2 orchestrates actin-dependent host response uponSalmonella infection

Autoren: Marcel Hahn, Adriana Covarrubias-Pinto, Lina Herhaus, Shankha Satpathy, Kevin Klann, Keith B. Boyle, Christian Münch, Krishnaraj Rajalingam, Felix Randow, Chunaram Choudhary, and Ivan Dikic
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 118(19), 2021, ISSN 1091-6490
Herausgeber: PNAS
DOI: 10.1073/pnas.2024144118

Insights into catalysis and function of phosphoribosyl-linked serine ubiquitination

Autoren: Sissy Kalayil, Sagar Bhogaraju, Florian Bonn, Donghyuk Shin, Yaobin Liu, Ninghai Gan, Jérôme Basquin, Paolo Grumati, Zhao-Qing Luo, Ivan Dikic
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 557/7707, 2018, Seite(n) 734-738, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-018-0145-8

Mechanism and medical implications of mammalian autophagy

Autoren: Ivan Dikic, Zvulun Elazar
Veröffentlicht in: Nature Reviews Molecular Cell Biology, Ausgabe 19/6, 2018, Seite(n) 349-364, ISSN 1471-0072
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41580-018-0003-4

Curvature induction and membrane remodeling by FAM134B reticulon homology domain assist selective ER-phagy

Autoren: Ramachandra M. Bhaskara, Paolo Grumati, Javier Garcia-Pardo, Sissy Kalayil, Adriana Covarrubias-Pinto, Wenbo Chen, Mikhail Kudryashev, Ivan Dikic, Gerhard Hummer
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-10345-3

A selective ER ‐phagy exerts procollagen quality control via a Calnexin‐ FAM 134B complex

Autoren: Alison Forrester, Chiara De Leonibus, Paolo Grumati, Elisa Fasana, Marilina Piemontese, Leopoldo Staiano, Ilaria Fregno, Andrea Raimondi, Alessandro Marazza, Gemma Bruno, Maria Iavazzo, Daniela Intartaglia, Marta Seczynska, Eelco Anken, Ivan Conte, Maria Antonietta De Matteis, Ivan Dikic, Maurizio Molinari, Carmine Settembre
Veröffentlicht in: The EMBO Journal, Ausgabe 38/2, 2018, ISSN 0261-4189
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.201899847

ER-phagy and human diseases

Autoren: Christian A. Hübner, Ivan Dikic
Veröffentlicht in: Cell Death & Differentiation, 2019, ISSN 1350-9047
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41418-019-0444-0

Cellular quality control by the ubiquitin-proteasome system and autophagy

Autoren: Christian Pohl, Ivan Dikic
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 366/6467, 2019, Seite(n) 818-822, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aax3769

CYRI/FAM49B negatively regulates RAC1-driven cytoskeletal remodelling and protects against bacterial infection

Autoren: Kyoko E. Yuki, Hadir Marei, Evgenij Fiskin, Megan M. Eva, Angelica A. Gopal, Jeremy A. Schwartzentruber, Jacek Majewski, Mathieu Cellier, Judith N. Mandl, Silvia M. Vidal, Danielle Malo, Ivan Dikic
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 4/9, 2019, Seite(n) 1516-1531, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-019-0484-8

Ubiquitin signaling and autophagy

Autoren: Paolo Grumati, Ivan Dikic
Veröffentlicht in: Journal of Biological Chemistry, Ausgabe 293/15, 2018, Seite(n) 5404-5413, ISSN 0021-9258
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1074/jbc.tm117.000117

Open questions: why should we care about ER-phagy and ER remodelling?

Autoren: Ivan Dikic
Veröffentlicht in: BMC Biology, Ausgabe 16/1, 2018, ISSN 1741-7007
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-018-0603-7

ER-phagy at a glance

Autoren: Paolo Grumati, Ivan Dikic, Alexandra Stolz
Veröffentlicht in: Journal of Cell Science, Ausgabe 131/17, 2018, Seite(n) jcs217364, ISSN 0021-9533
Herausgeber: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/jcs.217364

Dimerization quality control via ubiquitylation

Autoren: Lina Herhaus, Ivan Dikic
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 362/6411, 2018, Seite(n) 151-152, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aav1391

Inhibition of bacterial ubiquitin ligases by SidJ–calmodulin catalysed glutamylation

Autoren: Sagar Bhogaraju, Florian Bonn, Rukmini Mukherjee, Michael Adams, Moritz M. Pfleiderer, Wojciech P. Galej, Vigor Matkovic, Jaime Lopez-Mosqueda, Sissy Kalayil, Donghyuk Shin, Ivan Dikic
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 572/7769, 2019, Seite(n) 382-386, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-019-1440-8

Regulation of Phosphoribosyl-Linked Serine Ubiquitination by Deubiquitinases DupA and DupB

Autoren: Donghyuk Shin, Rukmini Mukherjee, Yaobin Liu, Alexis Gonzalez, Florian Bonn, Yan Liu, Vladimir V. Rogov, Marcel Heinz, Alexandra Stolz, Gerhard Hummer, Volker Dötsch, Zhao-Qing Luo, Sagar Bhogaraju, Ivan Dikic
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 77/1, 2020, Seite(n) 164-179.e6, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2019.10.019

Mitochondrial Functions in Infection and Immunity

Autoren: Varnesh Tiku, Man-Wah Tan, Ivan Dikic
Veröffentlicht in: Trends in Cell Biology, Ausgabe 30/4, 2020, Seite(n) 263-275, ISSN 0962-8924
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tcb.2020.01.006

Serine-ubiquitination regulates Golgi morphology and the secretory pathway upon Legionella infection

Autoren: Liu Y, Mukherjee R, Bonn F, Colby T, Matic I, Glogger M, Heilemann M, Dikic I
Veröffentlicht in: Cell Death & Differntiation, Ausgabe 28, 2021, Seite(n) 2957-2969, ISSN 1350-9047
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41418-021-00830-y