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Transgenerational regulation of glucose metabolism by noncoding RNAs

Descrizione del progetto

Il ruolo degli RNA lunghi non codificanti nell’obesità

L’obesità e il diabete di tipo 2 sono malattie multifattoriali i cui meccanismi di base risultano tuttora oggetto di studio. Sebbene evidenze emergenti abbiano evidenziato un certo coinvolgimento degli RNA lunghi non codificanti (lncRNA) lncRNA nella regolazione metabolica, manca ancora una comprensione completa dei loro modelli di espressione e del significato funzionale di cui dispongono nel contesto dell’obesità. Finanziato dal Consiglio europeo della ricerca, il progetto TransGen RNA è impegnato nello studio degli lncRNA associati all’obesità nel fegato e nel tessuto adiposo. I ricercatori studieranno il coinvolgimento degli lncRNA nel metabolismo del glucosio, la disregolazione della segnalazione dell’insulina nel fegato e gli effetti transgenerazionali esercitati dall’obesità paterna. Nel complesso, il progetto contribuirà a svelare le funzioni per le quali questi elementi genomici enigmatici sono responsabili.

Obiettivo

Obesity and T2D affect large populations and cause a decline in life expectancy if untreated. The pandemic proportion of obesity and inaptitude of anti-obesity approaches reflect our limited understanding of its complex environmental and genetic etiology. Genome-wide association studies revealed that disease-associated risk variants are often situated in those 98% of the genome not encoding for proteins. This noncoding genomic space yet does not reflect ‘Junk DNA’ but gives rise to >10,000 noncoding RNAs like microRNAs and long, noncoding RNAs (lncRNAs) that implicated in control of glucose metabolism and energy homeostasis also by the applicant (Kornfeld et al. Nature 2013).

LncRNAs were paraphrased as 'Dark matter of the genome' due to their tissue-specific and dynamic expression that contrast their poorly understood role in gene regulation. In the 1st part of this proposal, we ask if lncRNAs regulate glucose metabolism and are involved in the obesity-associated dysregulation of insulin signaling in the liver, the major glucoregulatory organ in mammals. Using RNA-Seq and novel lncRNA prediction algorithms, we observed that obesity alters expression of 28 annotated and 15 hitherto unknown lncRNAs in two mouse models of obesity. To identify lncRNAs causally controlling glucose metabolism, we established a siRNA screening system that allows functional interrogation of >650 lncRNAs. These in vitro findings serve as entry for the generation of lncRNA knockout mice that are metabolically phenotyped. In the 2nd part, we hypothesize that germline ncRNAs could control the transgenerational consequences of paternal obesity as shown for lower organisms. This builds upon unpublished findings from our lab showing that obesity profoundly changes expression of germline ncRNAs. In-vitro fertilization and intergenerational breedings will trace the legacy of paternal obesity across generations and reveal ncRNAs involved in this ‘Lamarckian’ control of glucose metabolism.

Parole chiave

Meccanismo di finanziamento

ERC-STG - Starting Grant

Istituzione ospitante

SYDDANSK UNIVERSITET
Contribution nette de l'UE
€ 930 637,50
Indirizzo
CAMPUSVEJ 55
5230 Odense M
Danimarca

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Regione
Danmark Syddanmark Fyn
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
€ 930 637,50

Beneficiari (2)