Cel Production of mature mRNA transcripts in vertebrates is regulated at three stages: transcription initiation, splicing and polyadenylation. The combinatorial arrangement of variations at each stage generates, from a single gene, a variety of mRNA isoforms with different start sites, exons or 3' UTRs. Expression of Alternative Transcripts (AT) has been observed to be specific to tissue-type or developmental stage. Disruptions in expression patterns have serious consequences for an organism and are associated with numerous diseases, including cancer, multiple sclerosis, heart failure and neurodegenerative disorders. Identifying disease-specific AT's can lead to development of novel drug targets or markers. European bioinformatics laboratories have contributed to identification of variants of transcript start site, of splicing, and of polyadenylation sites. Our objective here is to develop and integrate these independent approaches in order to derive a unified view of AT formation and create a genome-scale reference database for human AT; such a data is envisaged to include alternate transcript structures, functional consequences of variations, phylogenetic conservation, and references to other major genome and proteome resources. In addition, we will seek to identify tissue- or disease-specificity of isoforms using bioinformatics approaches. This will potentially reveal co-regulated expression patterns and associated regulatory motifs involved in transcript maturation. Finally, a selection of alternative transcripts will be submitted to experimental validation using semi-quantitative RT-PCR. Dziedzina nauki natural sciencescomputer and information sciencesdatabasesmedical and health sciencesbasic medicineneurologymultiple sclerosismedical and health sciencesclinical medicineoncologymedical and health sciencesclinical medicinecardiologynatural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomes Słowa kluczowe basic biological processes diagnosis disease markers gene expression regulation microarrays splicing transcriptone Program(-y) FP6-LIFESCIHEALTH - Life sciences, genomics and biotechnology for health: Thematic Priority 1 under the Focusing and Integrating Community Research programme 2002-2006. Temat(-y) LSH-2003-1.1.0-1 - Topics for Specific Targeted Research Project in the area of Fundamental knowledge and basic tools for functional genomics in all organisms Zaproszenie do składania wniosków FP6-2002-LIFESCIHEALTH Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia System finansowania STREP - Specific Targeted Research Project Koordynator INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE Wkład UE Brak danych Adres 101, Rue de Tolbiac PARIS Francja Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych Uczestnicy (8) Sortuj alfabetycznie Sortuj według wkładu UE Rozwiń wszystko Zwiń wszystko EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY Niemcy Wkład UE Brak danych Adres Meyerhofstrasse 1 102209 HEIDELBERG Zobacz na mapie Koszt całkowity Brak danych UNIVERSITY OF THE WESTERN CAPE Republika Południowej Afryki Wkład UE Brak danych Adres Modderdam Road X17 BELLVILLE Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych FUNDACIÓ IMIM Hiszpania Wkład UE Brak danych Adres Paseig Maritim, 25 BARCELONA Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych ESTONIAN BIOCENTRE Estonia Wkład UE Brak danych Adres Riia 23b TARTU Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych UNIVERSITÄTKLINIKUM HEIDELBERG Niemcy Wkład UE Brak danych Adres Vosstr. 2 HEIDELBERG Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych INSERM-TRANSFERT SA Francja Wkład UE Brak danych Adres 101 Rue de tolbiac PARIS Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych MAX-DELBRÜCK-CENTRUM FÜR MOLEKULARE MEDIZIN (MDC) BERLIN-BUCH Niemcy Wkład UE Brak danych Adres Robert-Rössle-Strasse 10 740238 BERLIN Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych CENTRE DE REGULACIÓ GENÒMICA Hiszpania Wkład UE Brak danych Adres Passeig Maritim, 37-49 BARCELONA Zobacz na mapie Linki Strona internetowa Opens in new window Koszt całkowity Brak danych
