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EPIGENETICS FOR FEMALE PERSONALIZED CANCER CARE

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Des biopsies liquides pour le diagnostic du cancer des ovaires et du sein

Chez les femmes, presque la moitié des cancers concernent les organes reproducteurs. Afin d'améliorer l'issue clinique, des outils de diagnostic efficaces et des interventions personnalisées sont nécessaires d'urgence.

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Le cancer du sein est le cancer le plus courant chez les femmes, et son potentiel métastatique élevé aboutit à une mortalité importante. Le cancer des ovaires, bien qu'il ne soit pas prédominant, présente un faible taux de survie étant donné l'étape précoce asymptomatique de la maladie et le diagnostic retardé. En revanche, l'incidence du cancer de l'utérus et les décès associés ont été réduits de 80 % grâce à la généralisation du dépistage à l'aide du test Papanicolaou. Une prévision similaire et des approches de détection précoce sont nécessaires de toute urgence pour le cancer du sein et des ovaires. Dans cet objectif, le consortium EPI-FEM-CARE (Epigenetics for female personalised cancer care), financé par l'UE, s'est engagé à mettre au point de nouveaux bio-essais capables de dépister des molécules cibles spécifiques reflétant la maladie. Le consortium se composait de partenaires universitaires et industriels dotés d'une expertise clinique et scientifique significative en la matière. Plus spécifiquement, ils souhaitaient établir une série de tests sanguins fondés sur la technologie de méthylation de l'ADN qui faciliterait la détection précoce et la prévision du résultat thérapeutique dans le cancer du sein et des ovaires. La méthylation de l'ADN est une modification chimique qui affecte l'expression génique et peut répondre à des indices environnementaux. Le consortium EPI-FEM-CARE a utilisé une technologie capable de détecter la méthylation de l'ADN dans le sérum par rapport à un contexte de dépassement de l'ADN normal contaminant. Cette approche reposait sur la détection de régions à méthylation différentielle spécifiques aux cancers du sein et des ovaires et a été validée sur de nombreux échantillons de patients. Dans ce cadre, les partenaires ont mis au point des protocoles spécialisés pour extraire de très faibles concentrations d'ADN dans le sérum. Par ailleurs, de nouveaux algorithmes ont été développés pour l'identification de modèles de méthylation uniques aux échantillons tumoraux, fournissant ainsi une spécificité et une sensibilité supérieures dans l'utilité clinique des marqueurs de méthylation de l'ADN. Par ailleurs, le test spécifique au cancer du sein a été appliqué aux échantillons de patients soumis au traitement adjuvant pour évaluer la capacité du test à prévoir la réponse thérapeutique. Étant donné l'impact socio-économique des cancers gynécologiques, les produits livrables de l'étude ouvrent la voie à un diagnostic amélioré et précis. Cette approche offre de nombreux avantages par rapport aux micropuces d'expression génique et aux méthodes protéomiques. Fait important, le test détecte les modèles de régions à méthylation différentielle dans les cellules cancéreuses, permettant une stratification des patients afin de déterminer la thérapie personnalisée optimisée.

Mots‑clés

Cancer du sein, cancer des ovaires, EPI-FEM-CARE, test sanguin, méthylation de l'ADN

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