Lepsze owoce dzięki genomice
Na przestrzeni ostatniej dekady naukowcy wygenerowali ogromną ilość informacji genomicznych o drzewach owocowych, opracowując przy tym szereg cennych narzędzi hodowlanych. Konieczne jest jednak zebranie i uporządkowanie tej wiedzy, aby umożliwić hodowcom komercyjnym optymalne korzystanie z niej. Projekt FRUIT BREEDOMICS (Integrated approach for increasing breeding efficiency in fruit tree crops), finansowany ze środków UE, powstał w celu poprawy wydajności produkcji jabłek i brzoskwiń. Partnerzy projektu opracowali narzędzia molekularne i bioinformatyczne umożliwiające badanie różnorodności występującej w kolekcjach zarodków i populacjach hodowlanych europejskich drzew owocowych. Stworzono nowe odmiany jabłek, odporne na parch jabłoni, mączniak i zarazę ogniową, a także odmiany brzoskwini, oporne na mszyce i grzyb Monilinia fructicola. Dzięki zastosowaniu narzędzi genomicznych udało się tego dokonać w ciągu niecałych siedmiu lat, czyli znacznie szybciej niż w przypadku konwencjonalnych programów hodowlanych. Uczestnicy projektu opracowali też standardową procedurę stosowania genomiki w hodowli jabłek i brzoskwiń. Innym aspektem projektu FRUIT BREEDOMICS było opracowanie komercyjnego wysokoprzepustowego testu umożliwiającego identyfikację polimorfizmów pojedynczego nukleotydu, kojarzonych z ekonomicznie pożądanymi cechami jabłek. Chodzi tu o odporność na choroby, jakość owoców i odporność na stres biotyczny. Stworzono relacyjną bazę danych dla zbiorów fenotypów oraz interfejs użytkownika do zarządzania i przeszukiwania zawartości bazy. Badacze dokonali też przeglądu i zebrali liczne narzędzia do wiązania cech genetycznych z fizycznymi i przetestowali te narzędzia na różnych odmianach. Rozwiązania te tworzą wspólnie nową platformę, FruitBreedomics Marker Assisted Breeding Services, która pomoże w dotarciu z nowymi technologiami do firm zajmujących się hodowlą roślin. W ramach projektu FRUIT BREEDOMICS powstały nowe narzędzia do sprawniejszej hodowli owoców, a ponadto przetestowano je pod kątem tworzenia nowych, ulepszonych odmian. Prace te będą miały istotne znaczenie dla aktualnie stosowanych metod hodowli owoców.
Słowa kluczowe
Genomika, jabłko, brzoskwinia, odporne na choroby, odmiany, drzewa owocowe, FRUIT BREEDOMICS
