Modificaciones químicas para mejorar el análisis de la proteómica
La proteómica, que está encaminada a la obtención de información de las proteínas, ha revolucionado la biología moderna al comparar el contenido en proteínas de las células o tejidos. Dada la importancia funcional fundamental de las proteínas para cualquier ser vivo, la proteómica constituye una herramienta valiosa para el análisis de la señalización defectuosa de proteínas presente en enfermedades. El proyecto «Detecting protease substrates using unnatural amino acids» (TAGGING PROTEOLYSIS) propuso utilizar el método de arginilación en la proteómica. La arginilación es un proceso enzimático que añade un aminoácido básico al extremo N de un péptido. Esta sirve para el análisis de la proteómica mediante espectrometría de masas por electronebulización y une un protón a un péptido, por lo general a aminoácidos básicos. Los residuos básicos en el extremo C de un péptido se pueden generar durante la digestión con tripsina, pero el extremo N carece normalmente de aminoácidos básicos. Aparte de aumentar el estado de carga del péptido, la conjugación de un residuo arginilo al extremo N de un péptido se podría utilizar para detectar péptidos más cortos. Además, los científicos fueron capaces de realizar la secuenciación bidireccional de péptidos mediante la combinación de una carga en el extremo N con un residuo básico en el extremo C. Esto condujo a la determinación precisa de los sitios de fosforilación en los péptidos que son esenciales en las cascadas de señalización y puede establecer una correlación con la progresión o el pronóstico de una enfermedad. El método de arginilación ofrece ventajas para la química sintética de los péptidos, ya que permite la síntesis de péptidos con aminoácidos tanto en el extremo N como en el extremo C. Además, se podría utilizar para mejorar el diagnóstico clínico de enfermedades a través de ensayos ELISA especializados que detecten sitios de fosforilación alterados.
