A Genetic View of Influenza Infection

Projektinformationen

GV-FLU

ID Finanzhilfevereinbarung: 637885

DOI 10.3030/637885

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 29 Juni 2015

Startdatum 1 Juli 2015

Enddatum 30 Juni 2021

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten € 1 497 000,00

EU-Beitrag € 1 497 000,00

Koordiniert durch

TEL AVIV UNIVERSITY
Israel

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (9)

Cell composition analysis of bulk genomics using single-cell data

Autoren: Amit Frishberg, Naama Peshes-Yaloz, Ofir Cohn, Diana Rosentul, Yael Steuerman, Liran Valadarsky, Gal Yankovitz, Michal Mandelboim, Fuad A. Iraqi, Ido Amit, Lior Mayo, Eran Bacharach, Irit Gat-Viks
Veröffentlicht in: Nature Methods, Ausgabe 16/4, 2019, Seite(n) 327-332, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-019-0355-5

Predicting Phenotypic Diversity from Molecular and Genetic Data

Autoren: Tom Harel, Naama Peshes-Yaloz, Eran Bacharach, Irit Gat-Viks
Veröffentlicht in: Genetics, Ausgabe 213/1, 2019, Seite(n) 297-311, ISSN 1943-2631
Herausgeber: Oxford academics
DOI: 10.1534/genetics.119.302463

ImmQuant: a user-friendly tool for inferring immune cell-type composition from gene-expression data

Autoren: Amit Frishberg, Avital Brodt, Yael Steuerman, Irit Gat-Viks
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 32/24, 2016, Seite(n) 3842-3843, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btw535

POEM: Identifying Joint Additive Effects on Regulatory Circuits

Autoren: Maya Botzman, Aharon Nachshon, Avital Brodt, Irit Gat-Viks
Veröffentlicht in: Frontiers in Genetics, Ausgabe 7, 2016, ISSN 1664-8021
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2016.00048

Exploiting Gene-Expression Deconvolution to Probe the Genetics of the Immune System

Autoren: Yael Steuerman, Irit Gat-Viks
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 12/4, 2016, Seite(n) e1004856, ISSN 1553-7358
Herausgeber: PLoS Comput Biol.
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1004856

Dissection of Influenza Infection In Vivo by Single-Cell RNA Sequencing

Autoren: Yael Steuerman, Merav Cohen, Naama Peshes-Yaloz, Liran Valadarsky, Ofir Cohn, Eyal David, Amit Frishberg, Lior Mayo, Eran Bacharach, Ido Amit, Irit Gat-Viks
Veröffentlicht in: Cell Systems, Ausgabe 6/6, 2018, Seite(n) 679-691.e4, ISSN 2405-4712
Herausgeber: Cell
DOI: 10.1016/j.cels.2018.05.008

An integrative model of cardiometabolic traits identifies two types of metabolic syndrome

Autoren: Amit Frishberg, Inge van den Munckhof, Rob ter Horst, Kiki Schraa, Leo AB Joosten, Joost HW Rutten, Adrian C Iancu, Ioana M Dregoesc, Bogdan A Tigu, Mihai G Netea, Niels P Riksen, Irit Gat-Viks
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 10, 2021, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.61710

Inferring cellular heterogeneity of associations from single cell genomics

Autoren: Maya Levy, Amit Frishberg, Irit Gat-Viks
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe 36/11, 2020, Seite(n) 3466-3473, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btaa151

Exploring Neural Networks and Related Visualization Techniques in Gene Expression Data

Autoren: Roni Wilentzik Müller, Irit Gat-Viks
Veröffentlicht in: Frontiers in Genetics, Ausgabe 11, 2020, ISSN 1664-8021
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2020.00402