A Genetic View of Influenza Infection

Informazioni relative al progetto

GV-FLU

ID dell’accordo di sovvenzione: 637885

DOI 10.3030/637885

Progetto chiuso

Data della firma CE 29 Giugno 2015

Data di avvio 1 Luglio 2015

Data di completamento 30 Giugno 2021

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale € 1 497 000,00

Contributo UE € 1 497 000,00

Coordinato da

TEL AVIV UNIVERSITY
Israel

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (9)

Cell composition analysis of bulk genomics using single-cell data

Autori: Amit Frishberg, Naama Peshes-Yaloz, Ofir Cohn, Diana Rosentul, Yael Steuerman, Liran Valadarsky, Gal Yankovitz, Michal Mandelboim, Fuad A. Iraqi, Ido Amit, Lior Mayo, Eran Bacharach, Irit Gat-Viks
Pubblicato in: Nature Methods, Numero 16/4, 2019, Pagina/e 327-332, ISSN 1548-7091
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-019-0355-5

Predicting Phenotypic Diversity from Molecular and Genetic Data

Autori: Tom Harel, Naama Peshes-Yaloz, Eran Bacharach, Irit Gat-Viks
Pubblicato in: Genetics, Numero 213/1, 2019, Pagina/e 297-311, ISSN 1943-2631
Editore: Oxford academics
DOI: 10.1534/genetics.119.302463

ImmQuant: a user-friendly tool for inferring immune cell-type composition from gene-expression data

Autori: Amit Frishberg, Avital Brodt, Yael Steuerman, Irit Gat-Viks
Pubblicato in: Bioinformatics, Numero 32/24, 2016, Pagina/e 3842-3843, ISSN 1367-4803
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btw535

POEM: Identifying Joint Additive Effects on Regulatory Circuits

Autori: Maya Botzman, Aharon Nachshon, Avital Brodt, Irit Gat-Viks
Pubblicato in: Frontiers in Genetics, Numero 7, 2016, ISSN 1664-8021
Editore: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2016.00048

Exploiting Gene-Expression Deconvolution to Probe the Genetics of the Immune System

Autori: Yael Steuerman, Irit Gat-Viks
Pubblicato in: PLOS Computational Biology, Numero 12/4, 2016, Pagina/e e1004856, ISSN 1553-7358
Editore: PLoS Comput Biol.
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1004856

Dissection of Influenza Infection In Vivo by Single-Cell RNA Sequencing

Autori: Yael Steuerman, Merav Cohen, Naama Peshes-Yaloz, Liran Valadarsky, Ofir Cohn, Eyal David, Amit Frishberg, Lior Mayo, Eran Bacharach, Ido Amit, Irit Gat-Viks
Pubblicato in: Cell Systems, Numero 6/6, 2018, Pagina/e 679-691.e4, ISSN 2405-4712
Editore: Cell
DOI: 10.1016/j.cels.2018.05.008

An integrative model of cardiometabolic traits identifies two types of metabolic syndrome

Autori: Amit Frishberg, Inge van den Munckhof, Rob ter Horst, Kiki Schraa, Leo AB Joosten, Joost HW Rutten, Adrian C Iancu, Ioana M Dregoesc, Bogdan A Tigu, Mihai G Netea, Niels P Riksen, Irit Gat-Viks
Pubblicato in: eLife, Numero 10, 2021, ISSN 2050-084X
Editore: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.61710

Inferring cellular heterogeneity of associations from single cell genomics

Autori: Maya Levy, Amit Frishberg, Irit Gat-Viks
Pubblicato in: Bioinformatics, Numero 36/11, 2020, Pagina/e 3466-3473, ISSN 1367-4803
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btaa151

Exploring Neural Networks and Related Visualization Techniques in Gene Expression Data

Autori: Roni Wilentzik Müller, Irit Gat-Viks
Pubblicato in: Frontiers in Genetics, Numero 11, 2020, ISSN 1664-8021
Editore: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2020.00402