Institut Curie 3-i PhD Program

Leistungen

Periodic report on dissemination activities 2

The report on dissemination activities should contain at least the following information Dates of Call Publication and places where it was published Flyers brochures or other information produced Presentations conferences and meetings or other events Published articles in the press Any other means of advertising the programme

Periodic report on dissemination activities 1

The report on dissemination activities should contain at least: - Dates of Call Publication and places where it was published (Supporting documents required). - Flyers, brochures, or other information produced - Presentations conferences and meetings or other events - Published articles in the press - Any other means of advertising the programme

Veröffentlichungen

Stem Cell DNA Damage and Genome Mutation in the Context of Aging and Cancer Initiation

Autoren: Lara Al-Zouabi and Alison Bardin
Veröffentlicht in: Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, 2020, Seite(n) -, ISSN 1943-0264
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/cshperspect.a036210

Multiscale morphogenesis of the mouse blastocyst by actomyosin contractility.

Autoren: Özge Özgüç; Jean-Léon Maître
Veröffentlicht in: Current Opinion in Cell Biology, Ausgabe Volume 66, 2020, Seite(n) 123-129, ISSN 0955-0674
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ceb.2020.05.002

BAP1 complex promotes transcription by opposing PRC1-mediated H2A ubiquitylation.

Autoren: Campagne, Antoine; Lee, Ming-Kang; Zielinski, Dina; Michaud, Audrey; Le Corre, Stéphanie; Dingli, Florent; Chen, Hong; Shahidian, Lara Z.; Vassilev, Ivaylo; Servant, Nicolas; Loew, Damarys; Pasmant, Eric; Postel-Vinay, Sophie; Wassef, Michel; Margueron, Raphaël
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10, 2019, Seite(n) pp.348, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-018-08255-x

Recent advances towards deciphering human dendritic cell development

Autoren: Javiera Villar, Elodie Segura
Veröffentlicht in: Molecular Immunology, Ausgabe Volume 122, 2020, Seite(n) Pages 109-115, ISSN 0161-5890
Herausgeber: Pergamon Press
DOI: 10.1016/j.molimm.2020.04.004

Synthetic reconstruction of the hunchback promoter specifies the role of Bicoid, Zelda and Hunchback in the dynamics of its transcription

Autoren: Huy Tran; Gonçalo Fernandes; Maxime Andrieu; Youssoupha Diaw; Carmina Perez Romero; Cécile Fradin; Mathieu Coppey; Aleksandra M Walczak; Nathalie Dostatni
Veröffentlicht in: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.74509

Transcription factor EB regulates phosphatidylinositol-3-phosphate levels that control lysosome positioning in the bladder cancer model

Autoren: Mathur, P., De Barros Santos, C., Lachuer, H. et al.
Veröffentlicht in: Commun Biol, Ausgabe 6, 2022, Seite(n) 114, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s42003-023-04501-1

The human pre-replication complex is an open complex

Autoren: Jian Li, Jiangqing Dong, Weitao Wang, Daqi Yu, Xinyu Fan, et al.
Veröffentlicht in: Cell, Ausgabe 186 (1), 2022, Seite(n) 98-111, ISSN 0092-8674
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2022.12.008

Review of Experimental Studies to Improve Radiotherapy Response in Bladder Cancer: Comments and Perspectives

Autoren: Linda Silina, Fatlinda Maksut,Isabelle Bernard-Pierrot,François Radvanyi,Gilles Créhange,Frédérique Mégnin-Chanet and Pierre Verrelle
Veröffentlicht in: Cancers, Ausgabe 13(1), 2021, Seite(n) 87, ISSN 2072-6694
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers13010087

Acridine–O6-benzylguanine hybrids: Synthesis, DNA binding, MGMT inhibition and antiproliferative activity

Autoren: Jaime Franco Pinto, Alexandra Fillion, Patricia Duchambon, Sophie Bombard, Anton Granzhan
Veröffentlicht in: European Journal of Medicinal Chemistry, Ausgabe Volume 227, 2022, Seite(n) 11390, ISSN 0223-5234
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.ejmech.2021.113909

Ubiquitin-like protein 3 (UBL3) is required for MARCH ubiquitination of major histocompatibility complex class II and CD86

Autoren: Haiyin Liu, Kayla R Wilson, Ashley M Firth, Christophe Macri, Patrick Schriek, Annabelle B Blum, Javiera Villar, Samuel Wormald, Mitch Shambrook, Bangyan Xu, Hui Jing Lim, Hamish E G McWilliam, Andrew F Hill, Laura E Edgington-Mitchell , Irina Caminschi , Mireille H Lahoud, Elodie Segura, Marco J Herold, Jose A Villadangos, Justine D Mintern
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 13, 2022, Seite(n) 1934, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-29524-w

Stiffness and tension gradients of the hair cell’s tip-link complex in the mammalian cochlea

Autoren: Mélanie Tobin, Atitheb Chaiyasitdhi, Vincent Michel, Nicolas Michalski, Pascal Martin
Veröffentlicht in: eLife, Ausgabe 8, 2019, Seite(n) -, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.43473

Germline MBD4 Mutations and Predisposition to Uveal Melanoma

Autoren: Anne-Céline Derrien; Manuel Rodrigues; Manuel Rodrigues; Alexandre Eeckhoutte; Stéphane Dayot; Alexandre Houy; Lenha Mobuchon; Sophie Gardrat; Sophie Gardrat; Delphine Lequin; Stelly Ballet; Gaëlle Pierron; Samar Alsafadi; Samar Alsafadi; Odette Mariani; Ahmed El-Marjou; Alexandre Matet; Alexandre Matet; Chrystelle Colas; Nathalie Cassoux; Nathalie Cassoux; Marc-Henri Stern; Marc-Henri Stern
Veröffentlicht in: ournal of the National Cancer Institute, Ausgabe Volume 113, Ausgabe 1, 2021, Seite(n) Pages 80–87, ISSN 0027-8874
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jnci/djaa047

Emerging Therapeutic Opportunities Based on Current Knowledge of Uveal Melanoma Biology.

Autoren: Vivet-Noguer, Raquel; Tarin, Malcy; Roman-Roman, Sergio; Alsafadi, Samar
Veröffentlicht in: Cancers, Ausgabe Iss 7, Vol 11,, 2019, Seite(n) p 1019, ISSN 2072-6694
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/cancers11071019

Interpretable network-guided epistasis detection

Autoren: Diane Duroux; Héctor Climente-Gonzáles; Chloé-Agathe Azencott; Kristel Van Steen
Veröffentlicht in: https://hal-mines-paristech.archives-ouvertes.fr/hal-03114245, Ausgabe 11, 2022, Seite(n) 1-14, ISSN 0029-3970
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/gigascience/giab093

Spatial transcriptomics for respiratory research and medicine

Autoren: Sandra Curras-Alonso, Juliette Soulier, Thomas Walter, Florian Mueller, Arturo Londoño-Vallejo and Charles Fouillade
Veröffentlicht in: European Respiratory Journal, Ausgabe 58 (1), 2021, Seite(n) 2004314, ISSN 0903-1936
Herausgeber: European Respiratory Society
DOI: 10.1183/13993003.04314-2020

Boosting GWAS using biological networks: A study on susceptibility to familial breast cancer

Autoren: Héctor Climente-González; Christine Lonjou; Christine Lonjou; Fabienne Lesueur; Fabienne Lesueur; Dominique Stoppa-Lyonnet; Dominique Stoppa-Lyonnet; Dominique Stoppa-Lyonnet; Nadine Andrieu; Nadine Andrieu; Chloé-Agathe Azencott; Chloé-Agathe Azencott
Veröffentlicht in: PLoS Computational Biology, Ausgabe 17(3), 2021, ISSN 1553-734X
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1008819

Cortical softening elicits zygotic contractility during mouse preimplantation development

Autoren: Özge Özgüç; Ludmilla de Plater; Varun Kapoor; Anna Francesca Tortorelli; Andrew G. Clark; Jean-Léon Maître
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 20(3), 2022, ISSN 1544-9173
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001593

Block HSIC Lasso

Autoren: Climente-González, Héctor; Azencott, Chloé Agathe; Kaski, Samuel; Yamada, Makoto
Veröffentlicht in: Bioinformatics, Ausgabe Volume 35, issue 14, 2019, ISSN 1367-4803
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btz333

Melanin Transfer and Fate within Keratinocytes in Human Skin Pigmentation

Autoren: Silvia Benito-Martínez, Laura Salavessa, Graça Raposo, Michael S Marks, Cédric Delevoye
Veröffentlicht in: Integrative and Comparative Biology, Ausgabe Volume 61, Ausgabe 4, 2021, Seite(n) Pages 1546–1555, ISSN 1540-7063
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/icb/icab094

Research Techniques Made Simple: Cell Biology Methods for the Analysis of Pigmentation

Autoren: Silvia Benito-Martínez, Yueyao Zhu, Riddhi Atul Jani, Dawn C. Harper, Michael S. Marks, Cédric Delevoye
Veröffentlicht in: Journal of Investigative Dermatology, Ausgabe Volume 140, Ausgabe 2, 2020, Seite(n) 257-268, ISSN 0022-202X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1016/j.jid.2019.12.002

CARM1/PRMT4: Making Its Mark beyond ItsFunction as a Transcriptional Coactivator

Autoren: Samyuktha Suresh, Solène Huard, Thierry Dubois
Veröffentlicht in: Trends in Cell Biology, Ausgabe Volume 31, Ausgabe 5, 2021, Seite(n) 402-417, ISSN 0962-8924
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tcb.2020.12.010

Abstracts

Autoren: Mikhajlov
Veröffentlicht in: European Biophysics Journal, Ausgabe 46/S1, 2017, Seite(n) 43-402, ISSN 0175-7571
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00249-017-1222-x

Systematic Analysis of Splice-Site-Creating Mutations in Cancer

Autoren: Reyka G. Jayasinghe, Song Cao, Qingsong Gao, Michael C. Wendl, Nam Sy Vo, Sheila M. Reynolds, Yanyan Zhao, Héctor Climente-González, Shengjie Chai, Fang Wang, Rajees Varghese, Mo Huang, Wen-Wei Liang, Matthew A. Wyczalkowski, Sohini Sengupta, Zhi Li, Samuel H. Payne, David Fenyö, Jeffrey H. Miner, Matthew J. Walter, Benjamin Vincent, Eduardo Eyras, Ken Chen, Ilya Shmulevich, Feng Chen, Li Ding,
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe 23/1, 2018, Seite(n) 270-281.e3, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2018.03.052

Harnessing an emissive guanine surrogate to design small-molecule fluorescent chemosensors of O6-methylguanine-DNA-methyltransferase (MGMT)

Autoren: Alexandra Fillion,Jaime Franco Pinto, Anton Granzhan
Veröffentlicht in: Organic and biomolecular chemistry, Ausgabe 2;20(9), 2022, Seite(n) 1888-1892, ISSN 1477-0520
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2ob00208f

Preclinical evaluation of drug combinations identifies co-inhibition of Bcl-2/XL/W and MDM2 as a potential therapy in uveal melanoma

Autoren: Didier Decaudin, Estelle Frisch Dit Leitz, Fariba Nemati, Malcy Tarin, Adnan Naguez, Mohamed Zerara, Benjamin Marande, Raquel Vivet-Noguer, Ensar Halilovic, Claire Fabre, Aart Jochemsen, Sergio Roman-Roman, Samar Alsafadi
Veröffentlicht in: European Journal of Cancer, Ausgabe 126, 2020, Seite(n) 93-103, ISSN 0959-8049
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.ejca.2019.12.012

Multiscale analysis of single and double maternal-zygotic Myh9 and Myh10 mutants during mouse preimplantation development.

Autoren: Markus Frederik Schliffka; Markus Frederik Schliffka; Anna Francesca Tortorelli; Özge Özgüç; Ludmilla de Plater; Oliver Polzer; Diane Pelzer; Jean-Léon Maître
Veröffentlicht in: eLife, 2021, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.68536

Erythropoietin directly remodels the clonal composition of murine hematopoietic multipotent progenitor cells

Autoren: Almut S Eisele; Jason Cosgrove; Aurelie Magniez; Emilie Tubeuf; Sabrina Tenreira Bento; Cecile Conrad; Fanny Cayrac; Tamar Tak; Anne-Marie Lyne; Jos Urbanus; Leïla Perié
Veröffentlicht in: eLife, 2022, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.66922

The More, the Merrier: DC3s Join the Human Dendritic Cell Family

Autoren: Javiera Villar, Elodie Segura
Veröffentlicht in: Immunity, Ausgabe Volume 53, Ausgabe 2, 2020, Seite(n) 233-235, ISSN 1074-7613
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.immuni.2020.07.014

FLASH Irradiation Spares Lung Progenitor Cells and Limits the Incidence of Radio-induced Senescence

Autoren: Charles Fouillade, Sandra Curras-Alonso, Lorena Giuranno, Eddy Quelennec, Sophie Heinrich, Sarah Bonnet-Boissinot, Arnaud Beddok, Sophie Leboucher, Hamza Umut Karakurt, Mylène Bohec, Sylvain Baulande, Marc Vooijs, Pierre Verrelle, Marie Dutreix, Arturo Londoño-Vallejo, Vincent Favaudon
Veröffentlicht in: Clinical Cancer Research, Ausgabe 15;26(6), 2020, Seite(n) 1497-1506, ISSN 1078-0432
Herausgeber: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-19-1440

Roles of Actin in the Morphogenesis of the Early Caenorhabditis elegans Embryo

Autoren: Dureen Samandar Eweis; Dureen Samandar Eweis; Julie Plastino; Julie Plastino
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 21(10), 2020, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms21103652

Developing an advanced gut on chip model enabling the study of epithelial cell/fibroblast interactions

Autoren: Marine Verhulsel, Anthony Simon, Moencopi Bernheim-Dennery, Venkata Ram Gannavarapu, Lauriane Gérémie, Davide Ferraro, Denis Krndija, Laurence Talini, Jean-Louis Viovy, Danijela Matic Vignjevic, Stéphanie Descroix
Veröffentlicht in: Lab Chip, Ausgabe 21, 2021, Seite(n) 365, ISSN 1473-0197
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0lc00672f

An interhemispheric neural circuit allowing binocular integration in the optic tectum.

Autoren: Gebhardt, Christoph; Auer, Thomas O.; Henriques, Pedro M.; Rajan, Gokul; Duroure, Karine; Bianco, Isaac H.; Del Bene, Filippo
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 10, 2019, Seite(n) 5471, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-13484-9

Decoding the Heterogeneity of Human Dendritic Cell Subsets

Autoren: Javiera Villar; Elodie Segura
Veröffentlicht in: Trends in Inmunology, Ausgabe Volume 41, Ausgabe 12, 2020, Seite(n) Pages 1062-107, ISSN 1471-4906
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.it.2020.10.002

Spen limits intestinal stem cell self-renewal

Autoren: Maheva Andriatsilavo, Marine Stefanutti, Katarzyna Siudeja, Carolina N Perdigoto, Benjamin Boumard, Louis Gervais, Alexandre Gillet-Markowska, Lara Al Zouabi, François Schweisguth, Allison J Bardin
Veröffentlicht in: PLOS Genetics, Ausgabe 14(11), 2018, Seite(n) -, ISSN 1553-7390
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pgen.1007773

Evolutionary divergence of locomotion in two related vertebrate species

Autoren: Gokul Rajan; Julie Lafaye; Martin Carbo-Tano; Karine Duroure; Giulia Faini; Dimitrii Tanese; Thomas Panier; Raphaël Candelier; Joerg Henninger; Ralf Britz; Benjamin Judkewitz; Christoph Gebhardt; Valentina Emiliani; Georges Debrégeas; Claire Wyart; Filippo Del Bene
Veröffentlicht in: Cell Reports, Ausgabe Volume 38, Ausgabe 13, 2022, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110585

TYRO3 as a molecular target for growth inhibition and apoptosis induction in bladder cancer.

Autoren: Florent Dufour; Florent Dufour; Linda Silina; Linda Silina; Hélène Neyret-Kahn; Hélène Neyret-Kahn; Aura Moreno-Vega; Aura Moreno-Vega; Clémentine Krucker; Clémentine Krucker; Narjesse Karboul; Narjesse Karboul; Marion Dorland-Galliot; Marion Dorland-Galliot; Pascale Maillé; Elodie Chapeaublanc; Elodie Chapeaublanc; Yves Allory; Yves Allory; Nicolas Stransky; Nicolas Stransky; Hélène Haeg
Veröffentlicht in: British Journal of Cancer, Ausgabe 120 (5), 2019, Seite(n) pp.555-564, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41416-019-0397-6

Protein arginine methyltransferase 5: A novel therapeutic target for triple-negative breast cancers

Autoren: Mathilde Vinet, Samyuktha Suresh, Virginie Maire, Clarisse Monchecourt, Fariba Némati, Laetitia Lesage, Fabienne Pierre, Mengliang Ye, Auriane Lescure, Amélie Brisson, Didier Meseure, André Nicolas, Guillem Rigaill, Elisabetta Marangoni, Elaine Del Nery, Sergio Roman‐Roman, and Thierry Dubois
Veröffentlicht in: Cancer Medicine, Ausgabe Volume 8, Ausgabe 5, 2019, Seite(n) 2414–2428, ISSN 2045-7634
Herausgeber: John Wiley & Sons
DOI: 10.1002/cam4.2114

Asymmetry is defined during meiosis in the oocyte of the parthenogenetic nematode Diploscapter pachys

Autoren: Dureen Samandar Eweis; Marie Delattre; Julie Plastino
Veröffentlicht in: Developmental Biology, Ausgabe 00121606, 2022, Seite(n) Pages 13-21, ISSN 0012-1606
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.ydbio.2021.12.013

Controlling Confinement and Topology to Study Collective Cell Behaviors

Autoren: Guillaume Duclos, Maxime Deforet, Hannah G. Yevick, Olivier Cochet-Escartin, Flora Ascione, Sarah Moitrier, Trinish Sarkar, Victor Yashunsky, Isabelle Bonnet, Axel Buguin, Pascal Silberzan
Veröffentlicht in: Cell Migration. Methods in Molecular Biology, Ausgabe vol 1749, 2018, Seite(n) pp 387–399, ISBN 978-1-4939-7700-0
Herausgeber: Humana Press
DOI: 10.1007/978-1-4939-7701-7_28

The 2020 motile active matter roadmap

Autoren: Gerhard Gompper, Roland G Winkler, Thomas Speck, Alexandre Solon, Cesare Nardini, Fernando Peruani, Hartmut Löwen, Ramin Golestanian, U Benjamin Kaupp, Luis Alvarez, Thomas Kiørboe, Eric Lauga, Wilson C K Poon, Antonio DeSimone, Santiago Muiños-Landin, Alexander Fischer, Nicola A Söker, Frank Cichos, Raymond Kapral, Pierre Gaspard, Marisol Ripoll, Francesc Sagues, Amin Doostmohammadi, Julia M
Veröffentlicht in: Journal of Physics: Condensed Matter, Ausgabe 193001, 2020, Seite(n) 67pp, ISSN 0953-8984
Herausgeber: IOP Publishing
DOI: 10.1088/1361-648x/ab6348

The 2019 Motile Active Matter Roadmap

Autoren: Gompper, Gerhard; Winkler, Roland G.; Speck, Thomas; Solon, Alexandre; Nardini, Cesare; Peruani, Fernando; Loewen, Hartmut; Golestanian, Ramin; Kaupp, U. Benjamin; Alvarez, Luis; Kioerboe, Thomas; Lauga, Eric; Poon, Wilson; De Simone, Antonio; Cichos, Frank; Fischer, Alexander; Landin, Santiago Muinos; Soeker, Nicola; Kapral, Raymond; Gaspard, Pierre; Ripoll, Marisol; Sagues, Francesc; Yeomans, Ju
Veröffentlicht in: arXiv, 2019, ISSN 2331-8422
Herausgeber: Cornell University
DOI: 10.48550/arxiv.1912.06710

Genome-wide mapping of human DNA replication by optical replication mapping supports a stochastic model of eukaryotic replication

Autoren: Wang W, Klein KN, Proesmans K, Yang H, Marchal C, Zhu X, Borrman T, Hastie A, Weng Z, Bechhoefer J, Chen CL, Gilbert DM, Rhind N.
Veröffentlicht in: Mol Cell, Ausgabe Jul 15;81(14), 2021, Seite(n) 2975-2988, ISSN 1940-3402
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1016/j.molcel.2021.05.024

Real Time de novo Deposition of Centromeric Histone-associated Proteins Using the Auxin Inducible Degradation System

Autoren: Hoffmann, Sebastian; Fachinetti, Daniele
Veröffentlicht in: Histone Variants. Methods in Molecular Biology, Ausgabe vol 1832, 2018, ISBN 978-1-4939-8663-7
Herausgeber: Humana Press
DOI: 10.1007/978-1-4939-8663-7_12

Rechte des geistigen Eigentums

METALLIC TRANS-(N-HETEROCYCLIC CARBENE)-AMINE-PLATINUM COMPLEXES AND USES THEREOF FOR TREATING CANCER

Antrags-/Publikationsnummer: 20 21078966
Datum: 2021-10-19
Antragsteller: INSTITUT CURIE

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