Leistungen
Benchmark the performance in peptide and protein identifications of EThcD versus HCD peptides from complex mixtures, whereby the Mw of the peptides is in the range between 2.5 and 10 kDa (middle-down proteomics)
Software module for comprehensive identification of PTMs, mutations and splice variantsImplement genome-informed proteomics platform that incorporates knowledge on human natural variations, disease mutations and alternative splicing. Ensure efficiency of search algorithm in huge protein/peptide spaces further inflated by multiple PTMs.
Software module for multiplexed quantification of clinical samplesDevelop and test software module that enables low variance quantification in body fluid and tissue samples for MS1 and MS2 label and label free quantification for hundreds of patients simultaneously.
Extension of software module to novel/hybrid fragmentation methodsDevelop peptide identification algorithms for EThcD, UVPD and other novel techniques with competitive identification rates. Incorporation in the MaxQuant software.
Industrialized workflow with low CVsDevelop and test a workflow that enables robust analysis of hundreds of tissue and body fluid samples with minimal intervention and CVs in the smaller than 20% range for proteins of interest
Feasibility study in cancer tissue proteomicsPerform large-scale quantitative phosphoproteomics of patient samples from ovarian cancer, colon cancer and prostate cancer samples using the protocols and MS acquisition strategies established in D5.1
Construction/coupling of UVPD to the latest Orbitrap instrumentsAn UVPD laser will be coupled to the latest Q-Exactive mass analyzer and/or other Orbitrap instruments
Software modules implemented for MS/MS based analysis of unconven-tional peptide and protein sequencesImplementation and benchmarking of all algorithms needed for the identification of peptide and proteins measured with the novel and hybrid fragmentation techniques including top and middle down proteomics.
LCMS time-scale compatible top- and middle-down proteomics workflows using hybrid fragmentation methodsBenchmark the performance in protein identifications of HCD, ETD and EThcD for proteins in the range between 10 and 100 kDa (top-down proteomics)
Top- and middle-down software moduleFurther develop the MaxQuant platform in order to analyze and quality control the top and middle down data generated in this project.
Machine learning module for biomarker discovery and classification of clinical samplesDevelop and benchmark a machine learning platform using support vector machines and deep learning networks for making robust decisions on patient treatment based on clinical samples.
LCMS time-scale compatible UV-PD peptide and protein sequencingBenchmark the performance in peptide and protein identifications of UVPD versus HCD using a cellular lysate on a Q-Exactive instrument (bottom-up proteomics)
Ethics checkAll relevant ethical approvals, consent forms and patient information sheets will be uploaded as deliverable 6.12. This will also include an up to date approval from The Central Denmark Region Committees on Health Research Ethics stating the ethical approvals for Aarhus University Hospital are also valid for project MSmed.
Develop and implement high-performance offline high-pH reversed-phase chromatography prior to high-resolution mass spectrometry for parallel analysis of major PTMs without enrichment and apply this to cancer cell lines treated with chemotherapeutic agents.
MaxQuant summer school 2The annual MaxQuant Summer School (host: MPIB, over 160 participants) provides an introduction into the MaxQuant software and application examples. Projeect results will be included into the School’s curriculum.
Data Management PlanDescribes the strategy for depositing and curating MSmed experimental data in publicly accessible proteomic data bases, the use of proteomic standard formats, and exceptions made as required to protect personal data and intellectual property to be patented
Robust and reproducible sample prepa¬ration protocols including MS instru¬mentation and acquisition strat-egies for large-scale, quantitative PTM analysis from primary tissue samples such as patient biopsy materialEstablish tissue sample preparation protocol based on heat-inactivation of biopsies, efficient protein extraction by ceramic bead milling, in-solution digestion and optimized nanoflow LC-MS/MS acquisition strategies. Benchmark the performance versus established protocols.
MaxQuant summer schoolThe annual MaxQuant Summer School (host: MPIB, over 160 participants) provides an introduction into the MaxQuant software and application examples. Projeect results will be included into the School’s curriculum.
Protocol for hyper-multiplexingDevelop labeling protocols and test them for multiplexing and analyzing) more than 10 patient samples at a time (goal is up to 20)
Scientific outreach meetingInternational scientific outreach meeting on Next Generation Proteomics linked to an annual Progress Meeting of the Netherlands Proteomics Center. Dissemination of project results to the broader community of proteomics researchers in Europe.
Veröffentlichungen
Autoren:
Kyle L. Fort, Christian N. Cramer, Valery G. Voinov, Yury V. Vasil’ev, Nathan I. Lopez, Joseph S. Beckman, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 17/2, 2018, Seite(n) 926-933, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.7b00622
Autoren:
Alba Cristobal, Fabio Marino, Harm Post, Henk W. P. van den Toorn, Shabaz Mohammed, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Analytical Chemistry, Ausgabe 89/6, 2017, Seite(n) 3318-3325, ISSN 0003-2700
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b03756
Autoren:
Fan Liu, Philip Lössl, Richard Scheltema, Rosa Viner, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Nature Communications, Ausgabe 8, 2017, Seite(n) 15473, ISSN 2041-1723
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/ncomms15473
Autoren:
Fan Liu, Philip Lössl, Beverley M. Rabbitts, Robert S. Balaban, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 17/2, 2018, Seite(n) 216-232, ISSN 1535-9476
Herausgeber:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.RA117.000470
Autoren:
Chiara Francavilla, Michela Lupia, Kalliopi Tsafou, Alessandra Villa, Katarzyna Kowalczyk, Rosa Rakownikow Jersie-Christensen, Giovanni Bertalot, Stefano Confalonieri, Søren Brunak, Lars J. Jensen, Ugo Cavallaro, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
Cell Reports, Ausgabe 18/13, 2017, Seite(n) 3242-3256, ISSN 2211-1247
Herausgeber:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2017.03.015
Autoren:
Yang Yang, Guanbo Wang, Ting Song, Carlito B. Lebrilla, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
mAbs, Ausgabe 9/4, 2017, Seite(n) 638-645, ISSN 1942-0870
Herausgeber:
Landes Bioscience
DOI:
10.1080/19420862.2017.1290033
Autoren:
Aneika C. Leney, Karim Rafie, Daan M. F. van Aalten, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
ACS Chemical Biology, Ausgabe 12/8, 2017, Seite(n) 2078-2084, ISSN 1554-8929
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acschembio.7b00371
Autoren:
Guanbo Wang, Rob N. de Jong, Ewald T. J. van den Bremer, Paul W. H. I. Parren, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Analytical Chemistry, Ausgabe 89/9, 2017, Seite(n) 4793-4797, ISSN 0003-2700
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b05129
Autoren:
Liana Tsiatsiani, Piero Giansanti, Richard A. Scheltema, Henk van den Toorn, Christopher M. Overall, A.F. Maarten Altelaar, Albert J.R. Heck
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 16/2, 2017, Seite(n) 852-861, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.6b00825
Autoren:
Dorte B. Bekker-Jensen, Christian D. Kelstrup, Tanveer S. Batth, Sara C. Larsen, Christa Haldrup, Jesper B. Bramsen, Karina D. Sørensen, Søren Høyer, Torben F. Ørntoft, Claus L. Andersen, Michael L. Nielsen, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
Cell Systems, Ausgabe 4/6, 2017, Seite(n) 587-599.e4, ISSN 2211-1247
Herausgeber:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cels.2017.05.009
Autoren:
Harm Post, Renske Penning, Martin A. Fitzpatrick, Luc B. Garrigues, W. Wu, Harold D. MacGillavry, Casper C. Hoogenraad, Albert J. R. Heck, A. F. Maarten Altelaar
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 16/2, 2017, Seite(n) 728-737, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.6b00753
Autoren:
Vojtech Franc, Yang Yang, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Analytical Chemistry, Ausgabe 89/6, 2017, Seite(n) 3483-3491, ISSN 0003-2700
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b04527
Autoren:
Louise von Stechow, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
PROTEOMICS, Ausgabe 17/3-4, 2017, Seite(n) 1600018, ISSN 1615-9853
Herausgeber:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/pmic.201600018
Autoren:
Adán Alpízar, Fabio Marino, Antonio Ramos-Fernández, Manuel Lombardía, Anita Jeko, Florencio Pazos, Alberto Paradela, César Santiago, Albert J. R. Heck, Miguel Marcilla
Veröffentlicht in:
Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 16/2, 2017, Seite(n) 181-193, ISSN 1535-9476
Herausgeber:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.M116.063800
Autoren:
Stephanie Munk, Jón Otti Sigurðsson, Zhenyu Xiao, Tanveer Singh Batth, Giulia Franciosa, Louise von Stechow, Andres Joaquin Lopez-Contreras, Alfred Cornelis Otto Vertegaal, Jesper Velgaard Olsen
Veröffentlicht in:
Cell Reports, Ausgabe 21/2, 2017, Seite(n) 546-558, ISSN 2211-1247
Herausgeber:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2017.09.059
Autoren:
Christian D. Kelstrup, Dorte B. Bekker-Jensen, Tabiwang N. Arrey, Alexander Hogrebe, Alexander Harder, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 17/1, 2017, Seite(n) 727-738, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.7b00602
Autoren:
Tanveer S. Batth, Moreno Papetti, Anamarija Pfeiffer, Maxim A.X. Tollenaere, Chiara Francavilla, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
Cell Reports, Ausgabe 22/10, 2018, Seite(n) 2784-2796, ISSN 2211-1247
Herausgeber:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2018.02.038
Autoren:
Alexander Hogrebe, Louise von Stechow, Dorte B. Bekker-Jensen, Brian T. Weinert, Christian D. Kelstrup, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
Nature Communications, Ausgabe 9/1, 2018, Seite(n) 1045, ISSN 2041-1723
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-03309-6
Autoren:
Sem Tamara, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck, Aneika C. Leney
Veröffentlicht in:
Angewandte Chemie International Edition, Ausgabe 56/44, 2017, Seite(n) 13641-13644, ISSN 1433-7851
Herausgeber:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/anie.201706749
Autoren:
Michiel van de Waterbeemd, Kyle L Fort, Dmitriy Boll, Maria Reinhardt-Szyba, Andrew Routh, Alexander Makarov, Albert J R Heck
Veröffentlicht in:
Nature Methods, Ausgabe 14/3, 2017, Seite(n) 283-286, ISSN 1548-7091
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nmeth.4147
Autoren:
Yang Yang, Vojtech Franc, Albert J.R. Heck
Veröffentlicht in:
Trends in Biotechnology, Ausgabe 35/7, 2017, Seite(n) 598-609, ISSN 0167-7799
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.tibtech.2017.04.010
Autoren:
Kyle L. Fort, Michiel van de Waterbeemd, Dmitriy Boll, Maria Reinhardt-Szyba, Mikhail E. Belov, Eita Sasaki, Reinhard Zschoche, Donald Hilvert, Alexander A. Makarov, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
The Analyst, Ausgabe 143/1, 2018, Seite(n) 100-105, ISSN 0003-2654
Herausgeber:
Royal Society of Chemistry
DOI:
10.1039/c7an01629h
Autoren:
Marshall Bern, Tomislav Caval, Yong J. Kil, Wilfred Tang, Christopher Becker, Eric Carlson, Doron Kletter, K. Ilker Sen, Nicolas Galy, Dominique Hagemans, Vojtech Franc, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 17/3, 2018, Seite(n) 1216-1226, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.7b00839
Autoren:
James D. Sanders, Dmitry Grinfeld, Konstantin Aizikov, Alexander Makarov, Dustin D. Holden, Jennifer S. Brodbelt
Veröffentlicht in:
Analytical Chemistry, Ausgabe 90/9, 2018, Seite(n) 5896-5902, ISSN 0003-2700
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.8b00724
Autoren:
Dirk Nolting, Robert Malek, Alexander Makarov
Veröffentlicht in:
Mass Spectrometry Reviews, 2017, ISSN 0277-7037
Herausgeber:
John Wiley & Sons Inc.
DOI:
10.1002/mas.21549
Autoren:
Sebastian Virreira Winter, Florian Meier, Christoph Wichmann, Juergen Cox, Matthias Mann, Felix Meissner
Veröffentlicht in:
Nature Methods, Ausgabe 15, 2018, Seite(n) 527–530, ISSN 1548-7091
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-018-0037-8
Autoren:
Florian Meier, Philipp E. Geyer, Sebastian Virreira Winter, Juergen Cox, Matthias Mann
Veröffentlicht in:
Nature Methods, Ausgabe 15/6, 2018, Seite(n) 440-448, ISSN 1548-7091
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-018-0003-5
Autoren:
Pavel Sinitcyn, Shivani Tiwary, Jan Rudolph, Petra Gutenbrunner, Christoph Wichmann, Şule Yılmaz, Hamid Hamzeiy, Favio Salinas, Jürgen Cox
Veröffentlicht in:
Nature Methods, Ausgabe 15/6, 2018, Seite(n) 401-401, ISSN 1548-7091
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-018-0018-y
Autoren:
Hamid Hamzeiy, Jürgen Cox
Veröffentlicht in:
Current Opinion in Biotechnology, Ausgabe 43, 2017, Seite(n) 141-146, ISSN 0958-1669
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.copbio.2016.11.014
Autoren:
Jan P. Gerlach, Ingrid Jordens, Daniele V. F. Tauriello, Ineke van ‘t Land-Kuper, Jeroen M. Bugter, Ivar Noordstra, Johanneke van der Kooij, Teck Y. Low, Felipe X. Pimentel-Muiños, Despina Xanthakis, Nicola Fenderico, Catherine Rabouille, Albert J. R. Heck, David A. Egan, Madelon M. Maurice
Veröffentlicht in:
Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 115/17, 2018, Seite(n) E3996-E4005, ISSN 0027-8424
Herausgeber:
National Academy of Sciences
DOI:
10.1073/pnas.1721321115
Autoren:
Pavel Sinitcyn, Jan Daniel Rudolph, Jürgen Cox
Veröffentlicht in:
Annual Review of Biomedical Data Science, Ausgabe 1/1, 2018, Seite(n) 207-234, ISSN 2574-3414
Herausgeber:
Annual Reviews
DOI:
10.1146/annurev-biodatasci-080917-013516
Autoren:
Vojtech Franc, Jing Zhu, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Journal of The American Society for Mass Spectrometry, Ausgabe 29/6, 2018, Seite(n) 1099-1110, ISSN 1044-0305
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1007/s13361-018-1901-6
Autoren:
Michiel van de Waterbeemd, Sem Tamara, Kyle L. Fort, Eugen Damoc, Vojtech Franc, Philipp Bieri, Martin Itten, Alexander Makarov, Nenad Ban, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Nature Communications, Ausgabe 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-04853-x
Autoren:
Tomislav Čaval, Weihua Tian, Zhang Yang, Henrik Clausen, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Nature Communications, Ausgabe 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-05536-3
Autoren:
Philip Lössl, Andrea M. Brunner, Fan Liu, Aneika C. Leney, Masami Yamashita, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
ACS Central Science, Ausgabe 2/7, 2016, Seite(n) 445-455, ISSN 2374-7943
Herausgeber:
ACS Publications
DOI:
10.1021/acscentsci.6b00053
Autoren:
Anna Secher, Christian D. Kelstrup, Kilian W. Conde-Frieboes, Charles Pyke, Kirsten Raun, Birgitte S. Wulff, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
Nature Communications, Ausgabe 7, 2016, Seite(n) 11436, ISSN 2041-1723
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/ncomms11436
Autoren:
Kyle L. Fort, Andrey Dyachenko, Clement M. Potel, Eleonora Corradini, Fabio Marino, Arjan Barendregt, Alexander A. Makarov, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Analytical Chemistry, Ausgabe 88/4, 2016, Seite(n) 2303-2310, ISSN 0003-2700
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.5b04162
Autoren:
Yu-Hsien Lin, Vojtech Franc, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 17/8, 2018, Seite(n) 2861-2869, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00318
Autoren:
Magnus E. Jakobsson, Jędrzej M. Małecki, Levon Halabelian, Benedikt S. Nilges, Rita Pinto, Srikanth Kudithipudi, Stephanie Munk, Erna Davydova, Fawzi R. Zuhairi, Cheryl H. Arrowsmith, Albert Jeltsch, Sebastian A. Leidel, Jesper V. Olsen, Pål Ø. Falnes
Veröffentlicht in:
Nature Communications, Ausgabe 9/1, 2018, Seite(n) 3411, ISSN 2041-1723
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-05646-y
Autoren:
Ashley L. Comes, Sergi Papiol, Thorsten Mueller, Philipp E. Geyer, Matthias Mann, Thomas G. Schulze
Veröffentlicht in:
Translational Psychiatry, Ausgabe 8/1, 2018, Seite(n) 160, ISSN 2158-3188
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41398-018-0219-2
Autoren:
Jennie R. Lill, Peter A. van Veelen, Stefan Tenzer, Arie Admon, Etienne Caron, Joshua E. Elias, Albert J.R. Heck, Miguel Marcilla, Fabio Marino, Markus Müller, Bjoern Peters, Anthony Purcell, Alessandro Sette, Theo Sturm, Nicola Ternette, Juan Antonio Vizcaíno, Michal Bassani-Sternberg
Veröffentlicht in:
PROTEOMICS, Ausgabe 18/12, 2018, Seite(n) 1800110, ISSN 1615-9853
Herausgeber:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/pmic.201800110
Autoren:
Sem Tamara, Andrey Dyachenko, Kyle L. Fort, Alexander A. Makarov, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Journal of the American Chemical Society, Ausgabe 138/34, 2016, Seite(n) 10860-10868, ISSN 0002-7863
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/jacs.6b05147
Autoren:
Stefka Tyanova, Tikira Temu, Pavel Sinitcyn, Arthur Carlson, Marco Y Hein, Tamar Geiger, Matthias Mann, Jürgen Cox
Veröffentlicht in:
Nature Methods, Ausgabe 13/9, 2016, Seite(n) 731-740, ISSN 1548-7091
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nmeth.3901
Autoren:
Yang Yang, Fan Liu, Vojtech Franc, Liem Andhyk Halim, Huub Schellekens, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Nature Communications, Ausgabe 7, 2016, Seite(n) 13397, ISSN 2041-1723
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/ncomms13397
Autoren:
Philip Lössl, Michiel van de Waterbeemd, Albert JR Heck
Veröffentlicht in:
The EMBO Journal, Ausgabe 35/24, 2016, Seite(n) 2634-2657, ISSN 0261-4189
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.15252/embj.201694818
Autoren:
Chiara Francavilla, Moreno Papetti, Kristoffer T G Rigbolt, Anna-Kathrine Pedersen, Jon O Sigurdsson, Giuseppe Cazzamali, Gopal Karemore, Blagoy Blagoev, Jesper V Olsen
Veröffentlicht in:
Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe 23/6, 2016, Seite(n) 608-618, ISSN 1545-9993
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nsmb.3218
Autoren:
Dmitry Grinfeld, Konstantin Aizikov, Arne Kreutzmann, Eugen Damoc, Alexander Makarov
Veröffentlicht in:
Analytical Chemistry, Ausgabe 89/2, 2016, Seite(n) 1202-1211, ISSN 0003-2700
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b03636
Autoren:
Nicolai J. Wewer Albrechtsen, Philipp E. Geyer, Sophia Doll, Peter V. Treit, Kirstine N. Bojsen-Møller, Christoffer Martinussen, Nils B. Jørgensen, Signe S. Torekov, Florian Meier, Lili Niu, Alberto Santos, Eva C. Keilhauer, Jens J. Holst, Sten Madsbad, Matthias Mann
Veröffentlicht in:
Cell Systems, Ausgabe 7/6, 2018, Seite(n) 601-612.e3, ISSN 2405-4712
Herausgeber:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cels.2018.10.012
Autoren:
Nicolai Bache, Philipp E. Geyer, Dorte B. Bekker-Jensen, Ole Hoerning, Lasse Falkenby, Peter V. Treit, Sophia Doll, Igor Paron, Johannes B. Müller, Florian Meier, Jesper V. Olsen, Ole Vorm, Matthias Mann
Veröffentlicht in:
Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 17/11, 2018, Seite(n) 2284-2296, ISSN 1535-9476
Herausgeber:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.TIR118.000853
Autoren:
Jan Daniel Rudolph, Jürgen Cox
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 18/5, 2019, Seite(n) 2052-2064, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00927
Autoren:
Yasset Perez-Riverol, Attila Csordas, Jingwen Bai, Manuel Bernal-Llinares, Suresh Hewapathirana, Deepti J Kundu, Avinash Inuganti, Johannes Griss, Gerhard Mayer, Martin Eisenacher, Enrique Pérez, Julian Uszkoreit, Julianus Pfeuffer, Timo Sachsenberg, Şule Yılmaz, Shivani Tiwary, Jürgen Cox, Enrique Audain, Mathias Walzer, Andrew F Jarnuczak, Tobias Ternent, Alvis Brazma, Juan Antonio Vizcaíno
Veröffentlicht in:
Nucleic Acids Research, Ausgabe 47/D1, 2018, Seite(n) D442-D450, ISSN 0305-1048
Herausgeber:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/nar/gky1106
Autoren:
Marta Murgia, Jing Tan, Philipp E. Geyer, Sophia Doll, Matthias Mann, Thomas Klopstock
Veröffentlicht in:
Cell Reports, Ausgabe 29/12, 2019, Seite(n) 3825-3834.e4, ISSN 2211-1247
Herausgeber:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2019.11.055
Autoren:
Miao-Hsia Lin, Clement M. Potel, Kamaleddin H. M. E. Tehrani, Albert J. R. Heck, Nathaniel I. Martin, Simone Lemeer
Veröffentlicht in:
Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 17/12, 2018, Seite(n) 2496-2507, ISSN 1535-9476
Herausgeber:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.ra118.000880
Autoren:
David Y. Chiang, Katherina M. Alsina, Eleonora Corradini, Martin Fitzpatrick, Li Ni, Satadru K. Lahiri, Julia O. Reynolds, Xiaolu Pan, Larry Scott, Albert J.R. Heck, Xander H.T. Wehrens
Veröffentlicht in:
Circulation, Ausgabe 138/15, 2018, Seite(n) 1569-1581, ISSN 0009-7322
Herausgeber:
Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI:
10.1161/circulationaha.118.034361
Autoren:
Karli R. Reiding, Albert Bondt, Vojtech Franc, Albert J.R. Heck
Veröffentlicht in:
TrAC Trends in Analytical Chemistry, Ausgabe 108, 2018, Seite(n) 260-268, ISSN 0165-9936
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.trac.2018.09.007
Autoren:
Clement M. Potel, Domenico Fasci, Albert J.R. Heck
Veröffentlicht in:
The FEBS Journal, Ausgabe 285/15, 2018, Seite(n) 2856-2868, ISSN 1742-464X
Herausgeber:
Blackwell Publishing Inc.
DOI:
10.1111/febs.14525
Autoren:
Clement M. Potel, Miao-Hsia Lin, Albert J. R. Heck, Simone Lemeer
Veröffentlicht in:
Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 17/5, 2018, Seite(n) 1028-1034, ISSN 1535-9476
Herausgeber:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.tir117.000518
Autoren:
Clement M Potel, Miao-Hsia Lin, Albert J R Heck, Simone Lemeer
Veröffentlicht in:
Nature Methods, Ausgabe 15/3, 2018, Seite(n) 187-190, ISSN 1548-7091
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nmeth.4580
Autoren:
Oleg Klykov, Barbara Steigenberger, Sibel Pektaş, Domenico Fasci, Albert J. R. Heck, Richard A. Scheltema
Veröffentlicht in:
Nature Protocols, Ausgabe 13/12, 2018, Seite(n) 2964-2990, ISSN 1754-2189
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41596-018-0074-x
Autoren:
Domenico Fasci, Hugo van Ingen, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 17/10, 2018, Seite(n) 2018-2033, ISSN 1535-9476
Herausgeber:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.ra118.000924
Autoren:
Barbara Steigenberger, Roland J. Pieters, Albert J. R. Heck, Richard A. Scheltema
Veröffentlicht in:
ACS Central Science, Ausgabe 5/9, 2019, Seite(n) 1514-1522, ISSN 2374-7943
Herausgeber:
ACS Publications
DOI:
10.1021/acscentsci.9b00416
Autoren:
Tomislav Čaval, Jing Zhu, Albert J.R. Heck
Veröffentlicht in:
Analytical Chemistry, Ausgabe 91/16, 2019, Seite(n) 10401-10406, ISSN 0003-2700
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.9b02125
Autoren:
Jean-François Greisch, Sem Tamara, Richard A. Scheltema, Howard W. R. Maxwell, Robert D. Fagerlund, Peter C. Fineran, Stephan Tetter, Donald Hilvert, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Chemical Science, Ausgabe 10/30, 2019, Seite(n) 7163-7171, ISSN 2041-6520
Herausgeber:
Royal Society of Chemistry
DOI:
10.1039/c9sc01857c
Autoren:
Clement M. Potel, Miao-Hsia Lin, Nadine Prust, Henk W. P. van den Toorn, Albert J. R. Heck, Simone Lemeer
Veröffentlicht in:
Analytical Chemistry, Ausgabe 91/9, 2019, Seite(n) 5542-5547, ISSN 0003-2700
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.9b00734
Autoren:
Laura C. Demmers, Albert J. R. Heck, Wei Wu
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 18/4, 2019, Seite(n) 1634-1643, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00821
Autoren:
Kelly A. Dingess, Henk W. P. van den Toorn, Marko Mank, Bernd Stahl, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Analytical and Bioanalytical Chemistry, Ausgabe 411/7, 2019, Seite(n) 1351-1363, ISSN 1618-2642
Herausgeber:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s00216-018-01566-4
Autoren:
Clement M. Potel, Simone Lemeer, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Analytical Chemistry, Ausgabe 91/1, 2018, Seite(n) 126-141, ISSN 0003-2700
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.8b04746
Autoren:
Jing Zhu, Luc Garrigues, Henk Van den Toorn, Bernd Stahl, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 18/1, 2018, Seite(n) 225-238, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00550
Autoren:
Andrey Dyachenko, Sem Tamara, Albert J. R. Heck
Veröffentlicht in:
Journal of The American Society for Mass Spectrometry, Ausgabe 30/1, 2019, Seite(n) 7-15, ISSN 1044-0305
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1007/s13361-018-1910-5
Autoren:
Tomislav Čaval, Jing Zhu, Weihua Tian, Sanne Remmelzwaal, Zhang Yang, Henrik Clausen, Albert J.R. Heck
Veröffentlicht in:
Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 18/1, 2019, Seite(n) 16-27, ISSN 1535-9476
Herausgeber:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.ra118.000967
Autoren:
Sebastiaan C. de Graaf, Oleg Klykov, Henk van den Toorn, Richard A. Scheltema
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 18/2, 2018, Seite(n) 642-651, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00725
Autoren:
Christoph Wichmann, Florian Meier, Sebastian Virreira Winter, Andreas-David Brunner, Jürgen Cox, Matthias Mann
Veröffentlicht in:
Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 18/5, 2019, Seite(n) 982-994, ISSN 1535-9476
Herausgeber:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.tir118.001131
Autoren:
Philipp E Geyer, Eugenia Voytik, Peter V Treit, Sophia Doll, Alisa Kleinhempel, Lili Niu, Johannes B Müller, Marie‐Luise Buchholtz, Jakob M Bader, Daniel Teupser, Lesca M Holdt, Matthias Mann
Veröffentlicht in:
EMBO Molecular Medicine, Ausgabe 11/11, 2019, Seite(n) e10427, ISSN 1757-4676
Herausgeber:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.15252/emmm.201910427
Autoren:
Lili Niu, Philipp E Geyer, Nicolai J Wewer Albrechtsen, Lise L Gluud, Alberto Santos, Sophia Doll, Peter V Treit, Jens J Holst, Filip K Knop, Tina Vilsbøll, Anders Junker, Stephan Sachs, Kerstin Stemmer, Timo D Müller, Matthias H Tschöp, Susanna M Hofmann, Matthias Mann
Veröffentlicht in:
Molecular Systems Biology, Ausgabe 15/3, 2019, Seite(n) e8793, ISSN 1744-4292
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.15252/msb.20188793
Autoren:
Alicia Lundby, Giulia Franciosa, Kristina B. Emdal, Jan C. Refsgaard, Sebastian P. Gnosa, Dorte B. Bekker-Jensen, Anna Secher, Svetlana R. Maurya, Indranil Paul, Blanca L. Mendez, Christian D. Kelstrup, Chiara Francavilla, Marie Kveiborg, Guillermo Montoya, Lars J. Jensen, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
Cell, Ausgabe 179/2, 2019, Seite(n) 543-560.e26, ISSN 0092-8674
Herausgeber:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cell.2019.09.008
Autoren:
Tanveer S. Batth, Maxim A. X. Tollenaere, Patrick Rüther, Alba Gonzalez-Franquesa, Bhargav S. Prabhakar, Simon Bekker-Jensen, Atul S. Deshmukh, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
Molecular & Cellular Proteomics, Ausgabe 18/5, 2019, Seite(n) 1027-1035, ISSN 1535-9476
Herausgeber:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.tir118.001270
Autoren:
Kristina B. Emdal, Anna-Kathrine Pedersen, Dorte B. Bekker-Jensen, Alicia Lundby, Shana Claeys, Katleen De Preter, Frank Speleman, Chiara Francavilla, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
Science Signaling, Ausgabe 11/557, 2018, Seite(n) eaap9752, ISSN 1937-9145
Herausgeber:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/scisignal.aap9752
Autoren:
Christian D. Kelstrup, Konstantin Aizikov, Tanveer S. Batth, Arne Kreutzman, Dmitry Grinfeld, Oliver Lange, Daniel Mourad, Alexander A. Makarov, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
Journal of Proteome Research, Ausgabe 17/11, 2018, Seite(n) 4008-4016, ISSN 1535-3893
Herausgeber:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00381
Autoren:
Vyacheslav Akimov, Inigo Barrio-Hernandez, Sten V. F. Hansen, Philip Hallenborg, Anna-Kathrine Pedersen, Dorte B. Bekker-Jensen, Michele Puglia, Stine D. K. Christensen, Jens T. Vanselow, Mogens M. Nielsen, Irina Kratchmarova, Christian D. Kelstrup, Jesper V. Olsen, Blagoy Blagoev
Veröffentlicht in:
Nature Structural & Molecular Biology, Ausgabe 25/7, 2018, Seite(n) 631-640, ISSN 1545-9993
Herausgeber:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41594-018-0084-y
Autoren:
Miia R. Mäkelä, Ourdia Bouzid, Diogo Robl, Harm Post, Mao Peng, Albert Heck, Maarten Altelaar, Ronald P. de Vries
Veröffentlicht in:
New Biotechnology, Ausgabe 37, 2017, Seite(n) 162-171, ISSN 1871-6784
Herausgeber:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.nbt.2017.02.002
Autoren:
Hecht, E.S., Scigelova, M., Eliuk, S. and Makarov, A.
Veröffentlicht in:
Encyclopedia of Analytical Chemistry, 2019
Herausgeber:
Wiley Online Library
Autoren:
Fabian Coscia, Sophia Doll, Jacob Mathias Bech, Andreas Mund, Ernst Lengyel, Jan Lindebjerg, Gunvor Iben Madsen, José M. A. Moreira, Matthias Mann
Veröffentlicht in:
bioRxiv, 2019
Herausgeber:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/779009
Autoren:
Dorte B. Bekker-Jensen, Ana Martínez del Val, Sophia Steigerwald, Patrick Rüther, Kyle Fort, Tabiwang N. Arrey, Alexander Harder, Alexander Makarov, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
bioRxiv, 2019
Herausgeber:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/860643
Autoren:
Dorte B. Bekker-Jensen, Oliver M. Bernhardt, Alexander Hogrebe, Ana Martinez del Val, Lynn Verbeke, Tejas Gandhi, Christian D. Kelstrup, Lukas Reiter, Jesper V. Olsen
Veröffentlicht in:
bioRxiv, 2019
Herausgeber:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/657858
Rechte des geistigen Eigentums
Antrags-/Publikationsnummer:
25
69639
Datum:
1939-09-13
Antrags-/Publikationsnummer:
EP
15165127
Datum:
2015-04-24
Antrags-/Publikationsnummer:
GB
1618595.1
Datum:
2016-11-04
Antrags-/Publikationsnummer:
EP
17158299
Datum:
2017-02-28
Antrags-/Publikationsnummer:
19
175643
Datum:
2017-06-02
Antrags-/Publikationsnummer:
17
174330
Datum:
2017-06-02
Suche nach OpenAIRE-Daten ...
Bei der Suche nach OpenAIRE-Daten ist ein Fehler aufgetreten
Es liegen keine Ergebnisse vor