Risultati finali
Benchmark the performance in peptide and protein identifications of EThcD versus HCD peptides from complex mixtures, whereby the Mw of the peptides is in the range between 2.5 and 10 kDa (middle-down proteomics)
Software module for comprehensive identification of PTMs, mutations and splice variantsImplement genome-informed proteomics platform that incorporates knowledge on human natural variations, disease mutations and alternative splicing. Ensure efficiency of search algorithm in huge protein/peptide spaces further inflated by multiple PTMs.
Software module for multiplexed quantification of clinical samplesDevelop and test software module that enables low variance quantification in body fluid and tissue samples for MS1 and MS2 label and label free quantification for hundreds of patients simultaneously.
Extension of software module to novel/hybrid fragmentation methodsDevelop peptide identification algorithms for EThcD, UVPD and other novel techniques with competitive identification rates. Incorporation in the MaxQuant software.
Industrialized workflow with low CVsDevelop and test a workflow that enables robust analysis of hundreds of tissue and body fluid samples with minimal intervention and CVs in the smaller than 20% range for proteins of interest
Feasibility study in cancer tissue proteomicsPerform large-scale quantitative phosphoproteomics of patient samples from ovarian cancer, colon cancer and prostate cancer samples using the protocols and MS acquisition strategies established in D5.1
Construction/coupling of UVPD to the latest Orbitrap instrumentsAn UVPD laser will be coupled to the latest Q-Exactive mass analyzer and/or other Orbitrap instruments
Software modules implemented for MS/MS based analysis of unconven-tional peptide and protein sequencesImplementation and benchmarking of all algorithms needed for the identification of peptide and proteins measured with the novel and hybrid fragmentation techniques including top and middle down proteomics.
LCMS time-scale compatible top- and middle-down proteomics workflows using hybrid fragmentation methodsBenchmark the performance in protein identifications of HCD, ETD and EThcD for proteins in the range between 10 and 100 kDa (top-down proteomics)
Top- and middle-down software moduleFurther develop the MaxQuant platform in order to analyze and quality control the top and middle down data generated in this project.
Machine learning module for biomarker discovery and classification of clinical samplesDevelop and benchmark a machine learning platform using support vector machines and deep learning networks for making robust decisions on patient treatment based on clinical samples.
LCMS time-scale compatible UV-PD peptide and protein sequencingBenchmark the performance in peptide and protein identifications of UVPD versus HCD using a cellular lysate on a Q-Exactive instrument (bottom-up proteomics)
Ethics checkAll relevant ethical approvals, consent forms and patient information sheets will be uploaded as deliverable 6.12. This will also include an up to date approval from The Central Denmark Region Committees on Health Research Ethics stating the ethical approvals for Aarhus University Hospital are also valid for project MSmed.
Develop and implement high-performance offline high-pH reversed-phase chromatography prior to high-resolution mass spectrometry for parallel analysis of major PTMs without enrichment and apply this to cancer cell lines treated with chemotherapeutic agents.
MaxQuant summer school 2The annual MaxQuant Summer School (host: MPIB, over 160 participants) provides an introduction into the MaxQuant software and application examples. Projeect results will be included into the School’s curriculum.
Data Management PlanDescribes the strategy for depositing and curating MSmed experimental data in publicly accessible proteomic data bases, the use of proteomic standard formats, and exceptions made as required to protect personal data and intellectual property to be patented
Robust and reproducible sample prepa¬ration protocols including MS instru¬mentation and acquisition strat-egies for large-scale, quantitative PTM analysis from primary tissue samples such as patient biopsy materialEstablish tissue sample preparation protocol based on heat-inactivation of biopsies, efficient protein extraction by ceramic bead milling, in-solution digestion and optimized nanoflow LC-MS/MS acquisition strategies. Benchmark the performance versus established protocols.
MaxQuant summer schoolThe annual MaxQuant Summer School (host: MPIB, over 160 participants) provides an introduction into the MaxQuant software and application examples. Projeect results will be included into the School’s curriculum.
Protocol for hyper-multiplexingDevelop labeling protocols and test them for multiplexing and analyzing) more than 10 patient samples at a time (goal is up to 20)
Scientific outreach meetingInternational scientific outreach meeting on Next Generation Proteomics linked to an annual Progress Meeting of the Netherlands Proteomics Center. Dissemination of project results to the broader community of proteomics researchers in Europe.
Pubblicazioni
Autori:
Kyle L. Fort, Christian N. Cramer, Valery G. Voinov, Yury V. Vasil’ev, Nathan I. Lopez, Joseph S. Beckman, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 17/2, 2018, Pagina/e 926-933, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.7b00622
Autori:
Alba Cristobal, Fabio Marino, Harm Post, Henk W. P. van den Toorn, Shabaz Mohammed, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Analytical Chemistry, Numero 89/6, 2017, Pagina/e 3318-3325, ISSN 0003-2700
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b03756
Autori:
Fan Liu, Philip Lössl, Richard Scheltema, Rosa Viner, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Nature Communications, Numero 8, 2017, Pagina/e 15473, ISSN 2041-1723
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/ncomms15473
Autori:
Fan Liu, Philip Lössl, Beverley M. Rabbitts, Robert S. Balaban, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Molecular & Cellular Proteomics, Numero 17/2, 2018, Pagina/e 216-232, ISSN 1535-9476
Editore:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.RA117.000470
Autori:
Chiara Francavilla, Michela Lupia, Kalliopi Tsafou, Alessandra Villa, Katarzyna Kowalczyk, Rosa Rakownikow Jersie-Christensen, Giovanni Bertalot, Stefano Confalonieri, Søren Brunak, Lars J. Jensen, Ugo Cavallaro, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
Cell Reports, Numero 18/13, 2017, Pagina/e 3242-3256, ISSN 2211-1247
Editore:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2017.03.015
Autori:
Yang Yang, Guanbo Wang, Ting Song, Carlito B. Lebrilla, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
mAbs, Numero 9/4, 2017, Pagina/e 638-645, ISSN 1942-0870
Editore:
Landes Bioscience
DOI:
10.1080/19420862.2017.1290033
Autori:
Aneika C. Leney, Karim Rafie, Daan M. F. van Aalten, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
ACS Chemical Biology, Numero 12/8, 2017, Pagina/e 2078-2084, ISSN 1554-8929
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acschembio.7b00371
Autori:
Guanbo Wang, Rob N. de Jong, Ewald T. J. van den Bremer, Paul W. H. I. Parren, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Analytical Chemistry, Numero 89/9, 2017, Pagina/e 4793-4797, ISSN 0003-2700
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b05129
Autori:
Liana Tsiatsiani, Piero Giansanti, Richard A. Scheltema, Henk van den Toorn, Christopher M. Overall, A.F. Maarten Altelaar, Albert J.R. Heck
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 16/2, 2017, Pagina/e 852-861, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.6b00825
Autori:
Dorte B. Bekker-Jensen, Christian D. Kelstrup, Tanveer S. Batth, Sara C. Larsen, Christa Haldrup, Jesper B. Bramsen, Karina D. Sørensen, Søren Høyer, Torben F. Ørntoft, Claus L. Andersen, Michael L. Nielsen, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
Cell Systems, Numero 4/6, 2017, Pagina/e 587-599.e4, ISSN 2211-1247
Editore:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cels.2017.05.009
Autori:
Harm Post, Renske Penning, Martin A. Fitzpatrick, Luc B. Garrigues, W. Wu, Harold D. MacGillavry, Casper C. Hoogenraad, Albert J. R. Heck, A. F. Maarten Altelaar
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 16/2, 2017, Pagina/e 728-737, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.6b00753
Autori:
Vojtech Franc, Yang Yang, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Analytical Chemistry, Numero 89/6, 2017, Pagina/e 3483-3491, ISSN 0003-2700
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b04527
Autori:
Louise von Stechow, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
PROTEOMICS, Numero 17/3-4, 2017, Pagina/e 1600018, ISSN 1615-9853
Editore:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/pmic.201600018
Autori:
Adán Alpízar, Fabio Marino, Antonio Ramos-Fernández, Manuel Lombardía, Anita Jeko, Florencio Pazos, Alberto Paradela, César Santiago, Albert J. R. Heck, Miguel Marcilla
Pubblicato in:
Molecular & Cellular Proteomics, Numero 16/2, 2017, Pagina/e 181-193, ISSN 1535-9476
Editore:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.M116.063800
Autori:
Stephanie Munk, Jón Otti Sigurðsson, Zhenyu Xiao, Tanveer Singh Batth, Giulia Franciosa, Louise von Stechow, Andres Joaquin Lopez-Contreras, Alfred Cornelis Otto Vertegaal, Jesper Velgaard Olsen
Pubblicato in:
Cell Reports, Numero 21/2, 2017, Pagina/e 546-558, ISSN 2211-1247
Editore:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2017.09.059
Autori:
Christian D. Kelstrup, Dorte B. Bekker-Jensen, Tabiwang N. Arrey, Alexander Hogrebe, Alexander Harder, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 17/1, 2017, Pagina/e 727-738, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.7b00602
Autori:
Tanveer S. Batth, Moreno Papetti, Anamarija Pfeiffer, Maxim A.X. Tollenaere, Chiara Francavilla, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
Cell Reports, Numero 22/10, 2018, Pagina/e 2784-2796, ISSN 2211-1247
Editore:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2018.02.038
Autori:
Alexander Hogrebe, Louise von Stechow, Dorte B. Bekker-Jensen, Brian T. Weinert, Christian D. Kelstrup, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
Nature Communications, Numero 9/1, 2018, Pagina/e 1045, ISSN 2041-1723
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-03309-6
Autori:
Sem Tamara, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck, Aneika C. Leney
Pubblicato in:
Angewandte Chemie International Edition, Numero 56/44, 2017, Pagina/e 13641-13644, ISSN 1433-7851
Editore:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/anie.201706749
Autori:
Michiel van de Waterbeemd, Kyle L Fort, Dmitriy Boll, Maria Reinhardt-Szyba, Andrew Routh, Alexander Makarov, Albert J R Heck
Pubblicato in:
Nature Methods, Numero 14/3, 2017, Pagina/e 283-286, ISSN 1548-7091
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nmeth.4147
Autori:
Yang Yang, Vojtech Franc, Albert J.R. Heck
Pubblicato in:
Trends in Biotechnology, Numero 35/7, 2017, Pagina/e 598-609, ISSN 0167-7799
Editore:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.tibtech.2017.04.010
Autori:
Kyle L. Fort, Michiel van de Waterbeemd, Dmitriy Boll, Maria Reinhardt-Szyba, Mikhail E. Belov, Eita Sasaki, Reinhard Zschoche, Donald Hilvert, Alexander A. Makarov, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
The Analyst, Numero 143/1, 2018, Pagina/e 100-105, ISSN 0003-2654
Editore:
Royal Society of Chemistry
DOI:
10.1039/c7an01629h
Autori:
Marshall Bern, Tomislav Caval, Yong J. Kil, Wilfred Tang, Christopher Becker, Eric Carlson, Doron Kletter, K. Ilker Sen, Nicolas Galy, Dominique Hagemans, Vojtech Franc, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 17/3, 2018, Pagina/e 1216-1226, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.7b00839
Autori:
James D. Sanders, Dmitry Grinfeld, Konstantin Aizikov, Alexander Makarov, Dustin D. Holden, Jennifer S. Brodbelt
Pubblicato in:
Analytical Chemistry, Numero 90/9, 2018, Pagina/e 5896-5902, ISSN 0003-2700
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.8b00724
Autori:
Dirk Nolting, Robert Malek, Alexander Makarov
Pubblicato in:
Mass Spectrometry Reviews, 2017, ISSN 0277-7037
Editore:
John Wiley & Sons Inc.
DOI:
10.1002/mas.21549
Autori:
Sebastian Virreira Winter, Florian Meier, Christoph Wichmann, Juergen Cox, Matthias Mann, Felix Meissner
Pubblicato in:
Nature Methods, Numero 15, 2018, Pagina/e 527–530, ISSN 1548-7091
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-018-0037-8
Autori:
Florian Meier, Philipp E. Geyer, Sebastian Virreira Winter, Juergen Cox, Matthias Mann
Pubblicato in:
Nature Methods, Numero 15/6, 2018, Pagina/e 440-448, ISSN 1548-7091
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-018-0003-5
Autori:
Pavel Sinitcyn, Shivani Tiwary, Jan Rudolph, Petra Gutenbrunner, Christoph Wichmann, Şule Yılmaz, Hamid Hamzeiy, Favio Salinas, Jürgen Cox
Pubblicato in:
Nature Methods, Numero 15/6, 2018, Pagina/e 401-401, ISSN 1548-7091
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41592-018-0018-y
Autori:
Hamid Hamzeiy, Jürgen Cox
Pubblicato in:
Current Opinion in Biotechnology, Numero 43, 2017, Pagina/e 141-146, ISSN 0958-1669
Editore:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.copbio.2016.11.014
Autori:
Jan P. Gerlach, Ingrid Jordens, Daniele V. F. Tauriello, Ineke van ‘t Land-Kuper, Jeroen M. Bugter, Ivar Noordstra, Johanneke van der Kooij, Teck Y. Low, Felipe X. Pimentel-Muiños, Despina Xanthakis, Nicola Fenderico, Catherine Rabouille, Albert J. R. Heck, David A. Egan, Madelon M. Maurice
Pubblicato in:
Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 115/17, 2018, Pagina/e E3996-E4005, ISSN 0027-8424
Editore:
National Academy of Sciences
DOI:
10.1073/pnas.1721321115
Autori:
Pavel Sinitcyn, Jan Daniel Rudolph, Jürgen Cox
Pubblicato in:
Annual Review of Biomedical Data Science, Numero 1/1, 2018, Pagina/e 207-234, ISSN 2574-3414
Editore:
Annual Reviews
DOI:
10.1146/annurev-biodatasci-080917-013516
Autori:
Vojtech Franc, Jing Zhu, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Journal of The American Society for Mass Spectrometry, Numero 29/6, 2018, Pagina/e 1099-1110, ISSN 1044-0305
Editore:
Elsevier BV
DOI:
10.1007/s13361-018-1901-6
Autori:
Michiel van de Waterbeemd, Sem Tamara, Kyle L. Fort, Eugen Damoc, Vojtech Franc, Philipp Bieri, Martin Itten, Alexander Makarov, Nenad Ban, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Nature Communications, Numero 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-04853-x
Autori:
Tomislav Čaval, Weihua Tian, Zhang Yang, Henrik Clausen, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Nature Communications, Numero 9/1, 2018, ISSN 2041-1723
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-05536-3
Autori:
Philip Lössl, Andrea M. Brunner, Fan Liu, Aneika C. Leney, Masami Yamashita, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
ACS Central Science, Numero 2/7, 2016, Pagina/e 445-455, ISSN 2374-7943
Editore:
ACS Publications
DOI:
10.1021/acscentsci.6b00053
Autori:
Anna Secher, Christian D. Kelstrup, Kilian W. Conde-Frieboes, Charles Pyke, Kirsten Raun, Birgitte S. Wulff, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
Nature Communications, Numero 7, 2016, Pagina/e 11436, ISSN 2041-1723
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/ncomms11436
Autori:
Kyle L. Fort, Andrey Dyachenko, Clement M. Potel, Eleonora Corradini, Fabio Marino, Arjan Barendregt, Alexander A. Makarov, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Analytical Chemistry, Numero 88/4, 2016, Pagina/e 2303-2310, ISSN 0003-2700
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.5b04162
Autori:
Yu-Hsien Lin, Vojtech Franc, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 17/8, 2018, Pagina/e 2861-2869, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00318
Autori:
Magnus E. Jakobsson, Jędrzej M. Małecki, Levon Halabelian, Benedikt S. Nilges, Rita Pinto, Srikanth Kudithipudi, Stephanie Munk, Erna Davydova, Fawzi R. Zuhairi, Cheryl H. Arrowsmith, Albert Jeltsch, Sebastian A. Leidel, Jesper V. Olsen, Pål Ø. Falnes
Pubblicato in:
Nature Communications, Numero 9/1, 2018, Pagina/e 3411, ISSN 2041-1723
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41467-018-05646-y
Autori:
Ashley L. Comes, Sergi Papiol, Thorsten Mueller, Philipp E. Geyer, Matthias Mann, Thomas G. Schulze
Pubblicato in:
Translational Psychiatry, Numero 8/1, 2018, Pagina/e 160, ISSN 2158-3188
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41398-018-0219-2
Autori:
Jennie R. Lill, Peter A. van Veelen, Stefan Tenzer, Arie Admon, Etienne Caron, Joshua E. Elias, Albert J.R. Heck, Miguel Marcilla, Fabio Marino, Markus Müller, Bjoern Peters, Anthony Purcell, Alessandro Sette, Theo Sturm, Nicola Ternette, Juan Antonio Vizcaíno, Michal Bassani-Sternberg
Pubblicato in:
PROTEOMICS, Numero 18/12, 2018, Pagina/e 1800110, ISSN 1615-9853
Editore:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.1002/pmic.201800110
Autori:
Sem Tamara, Andrey Dyachenko, Kyle L. Fort, Alexander A. Makarov, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Journal of the American Chemical Society, Numero 138/34, 2016, Pagina/e 10860-10868, ISSN 0002-7863
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/jacs.6b05147
Autori:
Stefka Tyanova, Tikira Temu, Pavel Sinitcyn, Arthur Carlson, Marco Y Hein, Tamar Geiger, Matthias Mann, Jürgen Cox
Pubblicato in:
Nature Methods, Numero 13/9, 2016, Pagina/e 731-740, ISSN 1548-7091
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nmeth.3901
Autori:
Yang Yang, Fan Liu, Vojtech Franc, Liem Andhyk Halim, Huub Schellekens, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Nature Communications, Numero 7, 2016, Pagina/e 13397, ISSN 2041-1723
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/ncomms13397
Autori:
Philip Lössl, Michiel van de Waterbeemd, Albert JR Heck
Pubblicato in:
The EMBO Journal, Numero 35/24, 2016, Pagina/e 2634-2657, ISSN 0261-4189
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.15252/embj.201694818
Autori:
Chiara Francavilla, Moreno Papetti, Kristoffer T G Rigbolt, Anna-Kathrine Pedersen, Jon O Sigurdsson, Giuseppe Cazzamali, Gopal Karemore, Blagoy Blagoev, Jesper V Olsen
Pubblicato in:
Nature Structural & Molecular Biology, Numero 23/6, 2016, Pagina/e 608-618, ISSN 1545-9993
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nsmb.3218
Autori:
Dmitry Grinfeld, Konstantin Aizikov, Arne Kreutzmann, Eugen Damoc, Alexander Makarov
Pubblicato in:
Analytical Chemistry, Numero 89/2, 2016, Pagina/e 1202-1211, ISSN 0003-2700
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.6b03636
Autori:
Nicolai J. Wewer Albrechtsen, Philipp E. Geyer, Sophia Doll, Peter V. Treit, Kirstine N. Bojsen-Møller, Christoffer Martinussen, Nils B. Jørgensen, Signe S. Torekov, Florian Meier, Lili Niu, Alberto Santos, Eva C. Keilhauer, Jens J. Holst, Sten Madsbad, Matthias Mann
Pubblicato in:
Cell Systems, Numero 7/6, 2018, Pagina/e 601-612.e3, ISSN 2405-4712
Editore:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cels.2018.10.012
Autori:
Nicolai Bache, Philipp E. Geyer, Dorte B. Bekker-Jensen, Ole Hoerning, Lasse Falkenby, Peter V. Treit, Sophia Doll, Igor Paron, Johannes B. Müller, Florian Meier, Jesper V. Olsen, Ole Vorm, Matthias Mann
Pubblicato in:
Molecular & Cellular Proteomics, Numero 17/11, 2018, Pagina/e 2284-2296, ISSN 1535-9476
Editore:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.TIR118.000853
Autori:
Jan Daniel Rudolph, Jürgen Cox
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 18/5, 2019, Pagina/e 2052-2064, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00927
Autori:
Yasset Perez-Riverol, Attila Csordas, Jingwen Bai, Manuel Bernal-Llinares, Suresh Hewapathirana, Deepti J Kundu, Avinash Inuganti, Johannes Griss, Gerhard Mayer, Martin Eisenacher, Enrique Pérez, Julian Uszkoreit, Julianus Pfeuffer, Timo Sachsenberg, Şule Yılmaz, Shivani Tiwary, Jürgen Cox, Enrique Audain, Mathias Walzer, Andrew F Jarnuczak, Tobias Ternent, Alvis Brazma, Juan Antonio Vizcaíno
Pubblicato in:
Nucleic Acids Research, Numero 47/D1, 2018, Pagina/e D442-D450, ISSN 0305-1048
Editore:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/nar/gky1106
Autori:
Marta Murgia, Jing Tan, Philipp E. Geyer, Sophia Doll, Matthias Mann, Thomas Klopstock
Pubblicato in:
Cell Reports, Numero 29/12, 2019, Pagina/e 3825-3834.e4, ISSN 2211-1247
Editore:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.celrep.2019.11.055
Autori:
Miao-Hsia Lin, Clement M. Potel, Kamaleddin H. M. E. Tehrani, Albert J. R. Heck, Nathaniel I. Martin, Simone Lemeer
Pubblicato in:
Molecular & Cellular Proteomics, Numero 17/12, 2018, Pagina/e 2496-2507, ISSN 1535-9476
Editore:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.ra118.000880
Autori:
David Y. Chiang, Katherina M. Alsina, Eleonora Corradini, Martin Fitzpatrick, Li Ni, Satadru K. Lahiri, Julia O. Reynolds, Xiaolu Pan, Larry Scott, Albert J.R. Heck, Xander H.T. Wehrens
Pubblicato in:
Circulation, Numero 138/15, 2018, Pagina/e 1569-1581, ISSN 0009-7322
Editore:
Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
DOI:
10.1161/circulationaha.118.034361
Autori:
Karli R. Reiding, Albert Bondt, Vojtech Franc, Albert J.R. Heck
Pubblicato in:
TrAC Trends in Analytical Chemistry, Numero 108, 2018, Pagina/e 260-268, ISSN 0165-9936
Editore:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.trac.2018.09.007
Autori:
Clement M. Potel, Domenico Fasci, Albert J.R. Heck
Pubblicato in:
The FEBS Journal, Numero 285/15, 2018, Pagina/e 2856-2868, ISSN 1742-464X
Editore:
Blackwell Publishing Inc.
DOI:
10.1111/febs.14525
Autori:
Clement M. Potel, Miao-Hsia Lin, Albert J. R. Heck, Simone Lemeer
Pubblicato in:
Molecular & Cellular Proteomics, Numero 17/5, 2018, Pagina/e 1028-1034, ISSN 1535-9476
Editore:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.tir117.000518
Autori:
Clement M Potel, Miao-Hsia Lin, Albert J R Heck, Simone Lemeer
Pubblicato in:
Nature Methods, Numero 15/3, 2018, Pagina/e 187-190, ISSN 1548-7091
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/nmeth.4580
Autori:
Oleg Klykov, Barbara Steigenberger, Sibel Pektaş, Domenico Fasci, Albert J. R. Heck, Richard A. Scheltema
Pubblicato in:
Nature Protocols, Numero 13/12, 2018, Pagina/e 2964-2990, ISSN 1754-2189
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41596-018-0074-x
Autori:
Domenico Fasci, Hugo van Ingen, Richard A. Scheltema, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Molecular & Cellular Proteomics, Numero 17/10, 2018, Pagina/e 2018-2033, ISSN 1535-9476
Editore:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.ra118.000924
Autori:
Barbara Steigenberger, Roland J. Pieters, Albert J. R. Heck, Richard A. Scheltema
Pubblicato in:
ACS Central Science, Numero 5/9, 2019, Pagina/e 1514-1522, ISSN 2374-7943
Editore:
ACS Publications
DOI:
10.1021/acscentsci.9b00416
Autori:
Tomislav Čaval, Jing Zhu, Albert J.R. Heck
Pubblicato in:
Analytical Chemistry, Numero 91/16, 2019, Pagina/e 10401-10406, ISSN 0003-2700
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.9b02125
Autori:
Jean-François Greisch, Sem Tamara, Richard A. Scheltema, Howard W. R. Maxwell, Robert D. Fagerlund, Peter C. Fineran, Stephan Tetter, Donald Hilvert, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Chemical Science, Numero 10/30, 2019, Pagina/e 7163-7171, ISSN 2041-6520
Editore:
Royal Society of Chemistry
DOI:
10.1039/c9sc01857c
Autori:
Clement M. Potel, Miao-Hsia Lin, Nadine Prust, Henk W. P. van den Toorn, Albert J. R. Heck, Simone Lemeer
Pubblicato in:
Analytical Chemistry, Numero 91/9, 2019, Pagina/e 5542-5547, ISSN 0003-2700
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.9b00734
Autori:
Laura C. Demmers, Albert J. R. Heck, Wei Wu
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 18/4, 2019, Pagina/e 1634-1643, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00821
Autori:
Kelly A. Dingess, Henk W. P. van den Toorn, Marko Mank, Bernd Stahl, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Analytical and Bioanalytical Chemistry, Numero 411/7, 2019, Pagina/e 1351-1363, ISSN 1618-2642
Editore:
Springer Verlag
DOI:
10.1007/s00216-018-01566-4
Autori:
Clement M. Potel, Simone Lemeer, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Analytical Chemistry, Numero 91/1, 2018, Pagina/e 126-141, ISSN 0003-2700
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.analchem.8b04746
Autori:
Jing Zhu, Luc Garrigues, Henk Van den Toorn, Bernd Stahl, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 18/1, 2018, Pagina/e 225-238, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00550
Autori:
Andrey Dyachenko, Sem Tamara, Albert J. R. Heck
Pubblicato in:
Journal of The American Society for Mass Spectrometry, Numero 30/1, 2019, Pagina/e 7-15, ISSN 1044-0305
Editore:
Elsevier BV
DOI:
10.1007/s13361-018-1910-5
Autori:
Tomislav Čaval, Jing Zhu, Weihua Tian, Sanne Remmelzwaal, Zhang Yang, Henrik Clausen, Albert J.R. Heck
Pubblicato in:
Molecular & Cellular Proteomics, Numero 18/1, 2019, Pagina/e 16-27, ISSN 1535-9476
Editore:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.ra118.000967
Autori:
Sebastiaan C. de Graaf, Oleg Klykov, Henk van den Toorn, Richard A. Scheltema
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 18/2, 2018, Pagina/e 642-651, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00725
Autori:
Christoph Wichmann, Florian Meier, Sebastian Virreira Winter, Andreas-David Brunner, Jürgen Cox, Matthias Mann
Pubblicato in:
Molecular & Cellular Proteomics, Numero 18/5, 2019, Pagina/e 982-994, ISSN 1535-9476
Editore:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.tir118.001131
Autori:
Philipp E Geyer, Eugenia Voytik, Peter V Treit, Sophia Doll, Alisa Kleinhempel, Lili Niu, Johannes B Müller, Marie‐Luise Buchholtz, Jakob M Bader, Daniel Teupser, Lesca M Holdt, Matthias Mann
Pubblicato in:
EMBO Molecular Medicine, Numero 11/11, 2019, Pagina/e e10427, ISSN 1757-4676
Editore:
John Wiley & Sons Ltd.
DOI:
10.15252/emmm.201910427
Autori:
Lili Niu, Philipp E Geyer, Nicolai J Wewer Albrechtsen, Lise L Gluud, Alberto Santos, Sophia Doll, Peter V Treit, Jens J Holst, Filip K Knop, Tina Vilsbøll, Anders Junker, Stephan Sachs, Kerstin Stemmer, Timo D Müller, Matthias H Tschöp, Susanna M Hofmann, Matthias Mann
Pubblicato in:
Molecular Systems Biology, Numero 15/3, 2019, Pagina/e e8793, ISSN 1744-4292
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.15252/msb.20188793
Autori:
Alicia Lundby, Giulia Franciosa, Kristina B. Emdal, Jan C. Refsgaard, Sebastian P. Gnosa, Dorte B. Bekker-Jensen, Anna Secher, Svetlana R. Maurya, Indranil Paul, Blanca L. Mendez, Christian D. Kelstrup, Chiara Francavilla, Marie Kveiborg, Guillermo Montoya, Lars J. Jensen, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
Cell, Numero 179/2, 2019, Pagina/e 543-560.e26, ISSN 0092-8674
Editore:
Cell Press
DOI:
10.1016/j.cell.2019.09.008
Autori:
Tanveer S. Batth, Maxim A. X. Tollenaere, Patrick Rüther, Alba Gonzalez-Franquesa, Bhargav S. Prabhakar, Simon Bekker-Jensen, Atul S. Deshmukh, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
Molecular & Cellular Proteomics, Numero 18/5, 2019, Pagina/e 1027-1035, ISSN 1535-9476
Editore:
American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI:
10.1074/mcp.tir118.001270
Autori:
Kristina B. Emdal, Anna-Kathrine Pedersen, Dorte B. Bekker-Jensen, Alicia Lundby, Shana Claeys, Katleen De Preter, Frank Speleman, Chiara Francavilla, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
Science Signaling, Numero 11/557, 2018, Pagina/e eaap9752, ISSN 1937-9145
Editore:
American Association for the Advancement of Science
DOI:
10.1126/scisignal.aap9752
Autori:
Christian D. Kelstrup, Konstantin Aizikov, Tanveer S. Batth, Arne Kreutzman, Dmitry Grinfeld, Oliver Lange, Daniel Mourad, Alexander A. Makarov, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
Journal of Proteome Research, Numero 17/11, 2018, Pagina/e 4008-4016, ISSN 1535-3893
Editore:
American Chemical Society
DOI:
10.1021/acs.jproteome.8b00381
Autori:
Vyacheslav Akimov, Inigo Barrio-Hernandez, Sten V. F. Hansen, Philip Hallenborg, Anna-Kathrine Pedersen, Dorte B. Bekker-Jensen, Michele Puglia, Stine D. K. Christensen, Jens T. Vanselow, Mogens M. Nielsen, Irina Kratchmarova, Christian D. Kelstrup, Jesper V. Olsen, Blagoy Blagoev
Pubblicato in:
Nature Structural & Molecular Biology, Numero 25/7, 2018, Pagina/e 631-640, ISSN 1545-9993
Editore:
Nature Publishing Group
DOI:
10.1038/s41594-018-0084-y
Autori:
Miia R. Mäkelä, Ourdia Bouzid, Diogo Robl, Harm Post, Mao Peng, Albert Heck, Maarten Altelaar, Ronald P. de Vries
Pubblicato in:
New Biotechnology, Numero 37, 2017, Pagina/e 162-171, ISSN 1871-6784
Editore:
Elsevier BV
DOI:
10.1016/j.nbt.2017.02.002
Autori:
Hecht, E.S., Scigelova, M., Eliuk, S. and Makarov, A.
Pubblicato in:
Encyclopedia of Analytical Chemistry, 2019
Editore:
Wiley Online Library
Autori:
Fabian Coscia, Sophia Doll, Jacob Mathias Bech, Andreas Mund, Ernst Lengyel, Jan Lindebjerg, Gunvor Iben Madsen, José M. A. Moreira, Matthias Mann
Pubblicato in:
bioRxiv, 2019
Editore:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/779009
Autori:
Dorte B. Bekker-Jensen, Ana Martínez del Val, Sophia Steigerwald, Patrick Rüther, Kyle Fort, Tabiwang N. Arrey, Alexander Harder, Alexander Makarov, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
bioRxiv, 2019
Editore:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/860643
Autori:
Dorte B. Bekker-Jensen, Oliver M. Bernhardt, Alexander Hogrebe, Ana Martinez del Val, Lynn Verbeke, Tejas Gandhi, Christian D. Kelstrup, Lukas Reiter, Jesper V. Olsen
Pubblicato in:
bioRxiv, 2019
Editore:
Cold Spring Harbor Laboratory
DOI:
10.1101/657858
Diritti di proprietà intellettuale
Numero candidatura/pubblicazione:
25
69639
Data:
1939-09-13
Numero candidatura/pubblicazione:
EP
15165127
Data:
2015-04-24
Numero candidatura/pubblicazione:
GB
1618595.1
Data:
2016-11-04
Numero candidatura/pubblicazione:
EP
17158299
Data:
2017-02-28
Numero candidatura/pubblicazione:
19
175643
Data:
2017-06-02
Numero candidatura/pubblicazione:
17
174330
Data:
2017-06-02
È in corso la ricerca di dati su OpenAIRE...
Si è verificato un errore durante la ricerca dei dati su OpenAIRE
Nessun risultato disponibile