Opis projektu
Odkrycie ukrytej strony chorób zakaźnych
Okres inkubacji to przedział czasu pomiędzy wystawieniem na czynnik zakaźny wywołujący chorobę a wystąpieniem pierwszego objawu. Podczas gdy jego długość może się różnić u poszczególnych osób, w zależności od patogenu w znacznym stopniu mogą różnić się także tempo replikacji, jak również rodzaj i długość trwania stłumionych objawów. W związku z tym zespół finansowanego ze środków UE projektu DCUBATION przeprowadzi badania dotyczące faktycznego momentu wystąpienia objawów. Zajmie się on oceną w czasie rzeczywistym wcześniejszego ryzyka zakażenia układu oddechowego poprzez integrację modeli przenoszenia zakażenia z danymi na poziomie indywidualnym z elektronicznej dokumentacji medycznej 4,5 miliona osób. W ramach projektu zidentyfikowane zostaną drobne zmiany w stanie pacjentów we wczesnej fazie zakażenia poprzez analizę cyfrowych danych sensorycznych z urządzeń noszonych na ciele.
Cel
Infectious diseases pose one of the greatest risks for a global catastrophe. Just like controlling the spread of wildfires, an early detection of infectious diseases is instrumental to containing outbreaks. Nearly all infections start silently, and gradually progress until clinical symptoms appear. In this silent period, the incubation period (IP), pathogens inhibit major pathways of the innate immune system, allowing an extended period of unhindered replication. The rate of replication, as well as the type and length of suppressed symptoms vary considerably between pathogens, creating a unique signature for each pathogen. Thus, improved understanding of the IP is pivotal for early detection, prevention and control of infectious diseases. Previous studies estimating IPs have used aggregated retrospective data, and are subject to the biases of patient self-reporting. I hypothesise that the actual onset of clinical symptoms occurs earlier than previously known, can be identified more accurately, and can be used in real-time for patient empowerment. Focusing on respiratory infections, my methodological approach includes: 1) real-time evaluation of the prior risk for respiratory infections by integrating transmission models with individual-level data from electronic medical records of 4.5 Million individuals, 2) identification of micro-changes in patients’ behaviour during the early phase of an infection by prospectively analysing digital sensory data from wearable devices and mobile phones of 5000 selected participants, 3) early detection of the causing pathogen validated with self-swab kits that are tested using RT-PCR. Our preliminary work that combined an analysis of EMR and transmission modelling led to a change in public health policy in Israel. The proposed study has the potential to open new research directions on the hidden side of infectious diseases and to initiate a new era of personalized medicine through dramatic changes in patient-doctor interaction.
Dziedzina nauki
- natural sciencescomputer and information sciencesinternetinternet of things
- medical and health scienceshealth sciencespublic health
- medical and health scienceshealth sciencesinfectious diseases
- medical and health sciencesbasic medicineimmunology
- medical and health scienceshealth sciencespersonalized medicine
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-STG - Starting GrantInstytucja przyjmująca
69978 Tel Aviv
Izrael