Une nouvelle méthode d'analyse pour observer et étudier les cellules
Il faut parfois se rapprocher personnellement de quelque chose pour mieux l'appréhender. Ainsi, les biologistes et généticiens rêvent depuis longtemps de pouvoir analyser les profils des gènes au niveau cellulaire, mais les limites des technologies actuelles les ont contraint à les étudier «de loin». Aujourd'hui, une équipe de Suède et des États-Unis a montré qu'une nouvelle méthode de séquençage génomique, appelée «Smart-Seq», peut aider les scientifiques à mener des analyses des cellules données en profondeur. Dans leur article publié dans la revue Nature Biotechnology, les chercheurs présentent les applications potentielles de Smart-Seq, lesquelles aideront les scientifiques à mieux comprendre les complexités du développement tumoral. Les travaux étaient soutenus par le projet SINGLE-CELL GENOMICS («Single-cell gene regulation in differentiation and pluripotency»), financé à hauteur de 1 654 383 euros par le Conseil européen de la recherche (CER). L'auteur de l'étude, le Dr Rickard Sandberg du l'institut Ludwig pour la recherche sur le cancer en Suède, commente: «Nos résultats sont certes préliminaires, mais nous avons démontré qu'il était possible de mener des études sur des cellules individuelles cliniquement pertinentes. Des chercheurs du monde entier spécialisés dans le cancer seront désormais en mesure d'analyser ces cellules plus systématiquement pour produire de meilleures méthodes de diagnostic et de traitement dans le futur.» Les études antérieures avaient démontré qu'il était normal pour un gène de générer plusieurs formes de la même protéine par différentes configurations de copies à partir du gène original. Ce phénomène est appelé épissage, et implique que les cellules d'un même tissu ne sont pas forcément aussi homogènes qu'on ne le pense. Cette nouvelle étude l'a étudié plus en profondeur et a développé une méthode pour la cartographie complète de l'expression génétique de cellules individuelles. En montrant les gènes actifs, il est possible de décrire avec précision et d'étudier les différences au niveau de l'expression génétique entre cellules du même tissu. Selon le Dr Sandberg, «les scientifiques attendent depuis longtemps une méthode comme celle-ci, mais les limites techniques ont rendu difficile le développement d'une méthode aussi sensible et fiable. Cette méthode présente plusieurs domaines d'application dans la recherche en cancérologie, où l'on peut l'utiliser pour étudier quels types de cellules forment des tumeurs cancérigènes chez un patient.» L'équipe a étudié des cellules tumorales dans le système sanguin d'un patient souffrant d'un mélanome malin récurrent. Une fois les cellules tumorales identifiées grâce à un test sanguin, l'équipe a appliqué la méthode Smart-Seq pour analyser leur expression génétique. Cette méthode leur a permis de montrer que les cellules tumorales avaient activé des protéines membranaires importantes, lesquelles seraient responsables de la capacité des cellules tumorales à envahir le système de surveillance de l'organisme et à se répandre dans le sang ou la lymphe. L'objectif principal du projet SINGLE-CELL GENOMICS, qui durera jusqu'en 2015, est de mieux comprendre la régulation génétique au cours de la différenciation in vivo et dans les cellules pluripotentes en étudiant les cellules uniques issues d'embryons murins en phase préimplantatoire, un système modèle doté d'une résolution de cellule individuelle naturelle et d'un potentiel médical et biologique important.Pour de plus amples informations, consulter: Karolinska Institutet: http://ki.se/ki/jsp/polopoly.jsp;jsessionid=asbIXwZ9FhR62Gog5I?l=en&d=130
Pays
Suède, États-Unis