Un développement en biotechnologie annonce une nouvelle découverte
L'étude des protéines (que l'on retrouve dans toutes les cellules et tissus du corps humain) est d'un intérêt tout particulier pour les scientifiques, étant donné qu'elles font partie de la majorité des processus biologiques. Les protéines sont composées d'acides aminés chimiquement liés, tandis que les séquences d'acides aminés plus petites sont appelées peptides. Pendant longtemps, la recherche s'est concentré sur la fabrication de peptides synthétiques en vue d'identifier ou de reproduire les cibles biologiques. Ces peptides, et les molécules avec lesquelles elles interagissent, font fréquemment l'objet de recherche dans le domaine des sciences de la vie, et revêtent un intérêt médical et pharmaceutique considérable. Pourtant, le coût de la synthèse de peptides est un obstacle à l'analyse détaillée et à d'autres progrès dans le domaine. Ainsi, le projet PEPCHIPOMICS, soutenu par le septième programme-cadre (7e PC) pour la recherche et le développement technologique de l'Union européenne, devrait changer toute cette situation. PEPCHIPOMICS vise à synthétiser et à analyser des micro-réseaux de peptides à haute densité. Les développements dans le cadre du projet ont entraîné l'établissement d'une nouvelle plateforme d'extraction à haut débit qui intègre la synthèse, la détection et l'analyse de peptides à une échelle sans précédent. Cette technologie d'analyse de peptides peut synthétiser deux millions de différents peptides sur une surface de la taille d'un timbre. Cela suffit pour exprimer le protéome humain entier (l'ensemble de protéines exprimées par un génome, des tissus cellulaires ou un organisme) en tant que peptides superposés. Le coordinateur du projet, le professeur Soren Buus de l'université de Copenhague, explique: «Cette technologie nous permet de représenter de grandes communautés de protéines, comme par exemple, le protéome humain entier, sur une seule puce. De même, nous pouvons examiner de petits assemblages (ou même des cibles uniques) en grand détail en utilisant les nombreuses variantes du peptide d'intérêt. Ces expériences étaient onéreuses dans le passé et logistiquement exigeantes. En effet, comment sauvegarder 100 000 cibles et leurs résultats associés? Mais maintenant, la technologie est moins chère et plus facile à gérer. Les scientifiques et l'industrie peuvent utiliser des approches peptidiques complètes (pour ainsi représenter un protéome entier, par exemple) dans leurs recherches de cibles scientifiquement pertinentes et leurs recherche pour de nouveaux candidats.» Plus tôt dans l'année, le projet a réussi à découvrir que 100 000 peptides pouvaient être synthétisés en parallèle tout en détectant toute interaction avec d'«autres molécules». Ces recherches ont démontré la capacité d'interpréter les données et d'identifier ce que ces «autres molécules» peuvent reconnaître. «Mais ce n'est que le début», commente le professeur Buus. «Le prochain objectif est d'intégrer la technologie des micro-réseaux de peptides à d'autres technologies sans marquage qui détectent en temps réel les interactions entre la puce de peptides et toute autre molécule incorporée sur une puce permettant de déterminer l'activation ou la désactivation et la force de l'interaction, des paramètres intéressants en biotechnologie, en médecine et en pharmacie. Il serait même possible d'identifier les molécules interagissant avec lesdits peptides.» La capacité d'analyser les peptides à un niveau égal à la révolution génomique actuelle pourrait avoir un fort impact sur la manière d'aborder les questions scientifiques et cliniques à l'avenir, et sur la résolution des problèmes biotechnologiques et pharmaceutiques.Pour plus d'informations, consulter: PEPCHIPOMICS http://pepchipomics.ku.dk/ University of Copenhagen http://www.ku.dk/english
Pays
Danemark