Description du projet
Faire la lumière sur les impacts plus larges de la redondance fonctionnelle sur les microbes marins
Le projet FROM, financé par l’UE, utilisera des ensembles de données de pointe sur le microbiome couvrant les océans du globe pour déterminer comment la redondance fonctionnelle influence les communautés microbiennes à grande échelle. L’équipe de recherche comparera les fonctions déduites avec la taxonomie microbienne, la sélection environnementale à partir de variables abiotiques et la dispersion dans les océans pour déterminer leur redondance. En outre, les caractéristiques morphotropiques des taxons de protistes seront rassemblées dans une nouvelle base de données qui représentera leur diversité fonctionnelle. Enfin, une caractérisation fonctionnelle innovante des réseaux écologiques sera développée afin de dévoiler l’interaction entre les réseaux d’interaction microbienne et les conditions environnementales. FROM représente une avancée majeure pour la microbiologie et l’écologie fonctionnelle, en révélant comment les microbes peuvent affecter les écosystèmes naturels, artificiels ou futurs.
Objectif
This proposal relates to a recent debate of microbiology. Functional redundancy supposes that many taxa can realize the same functions. In this scenario, the composition of microbial communities could appear as a bad predictor of their effects on ecosystems. Functional redundancy among microbes has been suggested but also disproven, growing in a limiting debate for microbiology. Our project proposes an overview of microbial functions to answer to this debate. The innovation in our project consists in studying the ecology and redundancy of functions inferred by various methods. We will use state-of-the art microbiome datasets that spans the global ocean, enabling to study the impact of geographic scales on redundancy. The host and the candidate will bring together their complementary expertise on omics, statistics, microbes’ morphology, nutrition and interactions to compare for the first time the functionality of all microbial domains across the global ocean. Inferred functions will be analyzed against microbial taxonomy, environmental selection from abiotic variables and dispersal across the ocean to study their redundancy and ecological patterns. Novel cross-disciplinary tools will be developed that will expand the outreach of our project to research in omics (e.g. bioinformatics, computational biology), biogeochemistry, modelling, evolution or global changes. Morpho-trophic features of protistan taxa will be collected into a novel database that will represent their functional diversity. Finally, an innovative functional characterization of ecological networks will be developed to unveil the interplay between microbial interaction networks and environmental conditions. Researchers and policy-makers studying how microbes affects natural, engineered, or future ecosystems, will benefit from our project that represents a major leap forward for microbiology and functional ecology.
Champ scientifique
Programme(s)
Régime de financement
MSCA-IF-EF-ST - Standard EFCoordinateur
28006 Madrid
Espagne