Objectif
The human genome encodes for hundreds of transcriptional programs, which facilitates the unique functions and morphologies presented by different cell types. Only recently, the role of DNA packaging into chromatin emerged as one of the major contributors to the modularity and dynamics of the genome. Here, I propose to harness my computational expertise with vast amounts of publicly available data in mice and humans, and study the internal modularity and dynamics of genome packaging, and its relation to the expression levels of underlying genes in various conditions.
Specifically, the objectives of this proposal are fourfold: (1) Identify chromatin domains at a genome-wide scale. I will analyze data from hundreds of genome-wide chromatin tracks, and develop computational algorithms to segment the genome into atomic units of chromatin packaging, that open and close as homogenous blocks under various conditions and transcriptional programs. (2) Annotate and understand the functional roles of each domain. I will utilize public gene expression data and genomic maps of chromatin modifiers to annotate the role of each chromatin block, and construct an unbiased comprehensive map of the genome packaging. (3) Study the mechanisms that define, maintain and modify chromatin domains. Using sequence motifs and published binding data, I will identify chromatin regulators involved in differential domains. (4) The role of aberrant chromatin packaging in cancerous tissues. I will contrast the above domains with chromatin in cancerous tissues, and link differences to transcriptional abnormalities, thus producing a detailed set of testable hypotheses regarding the mechanisms and progression of tumors.
With proven experience and proven background in genomics and computation and algorithms, I am poised to significantly contribute to our understanding of genome packaging and transcriptional regulation.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2013-CIG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
91904 JERUSALEM
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.