Objectif
Metagenomes comprise enormous reservoirs coding for proteins with useful activities. Unfortunately, harvesting this reservoir is difficult, because useful candidates are rare and hidden in an overwhelming majority of irrelevant genes. Screening campaigns of metagenomic libraries thus require massive capital-expenditure for robotic systems and much manpower, making them expensive, slow and available to very few users. To enable valorisation of the potential of the metagenome, this project assembles an interdisciplinary and intersectoral consortium that will integrate a range of technologies into a platform designed to beat the odds of identifying library hits faster, more efficiently and by a wider user base. Exploration and exploitation of the metagenome will be made faster and more successful by (i) ultrahigh-throughput screening in picoliter droplets that dramatically lowers the cost per assay to well below 0.01 cents and allows throughput of 10e7 assays per hour; (ii) workflows that streamline and increase the yield of library construction and functional expression and (iii) workflows for efficient bioinformatic analysis of hits based on user-friendly software solutions for metagenome analysis. Emphasis is put on technologies that are straightforwardly implemented in non-specialist labs, maximising the impact of METAFLUIDICS. This platform will be used to identify enzymes for biosynthesis of therapeutic small molecules, for green bioenergy conversion, bioremediation, food chemistry and other industrial applications
Champ scientifique
- natural sciencesphysical sciencesclassical mechanicsfluid mechanicsmicrofluidics
- natural sciencescomputer and information sciencessoftware
- engineering and technologyenvironmental biotechnologybioremediation
- natural sciencesbiological sciencesmicrobiology
- natural sciencesbiological sciencesbiochemistrybiomoleculesproteinsenzymes
Programme(s)
Régime de financement
RIA - Research and Innovation actionCoordinateur
28049 Madrid
Espagne
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Participants (15)
8000 Aarhus
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18100 ARMILLA GRANADA
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
CB4 3QU Cambridge
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
NE49 9HN Haltwhistle
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.
CB2 1TN Cambridge
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2880 Bagsvaerd
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31077 TOULOUSE CEDEX 4
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Entité juridique autre qu’un sous-traitant qui est affiliée ou juridiquement liée à un participant. L’entité réalise des travaux dans les conditions prévues par la convention de subvention, fournit des biens ou des services pour l’action, mais n’a pas signé la convention de subvention. Le tiers respecte les règles applicables au participant qui lui est lié dans le cadre de la convention de subvention en ce qui concerne l’éligibilité des coûts et le contrôle des dépenses.
75007 Paris
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3004 517 Coimbra
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03690 Alicante
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28006 Madrid
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Entité juridique autre qu’un sous-traitant qui est affiliée ou juridiquement liée à un participant. L’entité réalise des travaux dans les conditions prévues par la convention de subvention, fournit des biens ou des services pour l’action, mais n’a pas signé la convention de subvention. Le tiers respecte les règles applicables au participant qui lui est lié dans le cadre de la convention de subvention en ce qui concerne l’éligibilité des coûts et le contrôle des dépenses.
28850 Torrejon De Ardoz Madrid
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7491 Trondheim
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Participation terminée
7034 Trondheim
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7034 Trondheim
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