Nowa metoda ukazuje strukturę białek błonowych
Białka stanowią główny składnik wszystkich żywych komórek i odgrywają kluczową rolę w wielu ważnych procesach biologicznych. Białka błony komórkowej są niezbędne do regulacji wnikania i uwalniania molekuł poprzez błonę, przekazywania sygnałów i adhezji komórek. Mimo ich znaczenia, nie uzyskano danych 3D o strukturze wszystkich białek błonowych z powodu trudności w ich krystalizacji. Celem finansowanego przez UE projektu MEM-MAS (Structure and dynamics of metal ion transporters using solid-state nuclear magnetic resonance at high field and fast magic angle spinning) było opracowanie metody badania struktury białek błonowych przy użyciu spektroskopii NMR. Konsorcjum z powodzeniem przezwyciężyło dotychczasowe ograniczenia w poznawaniu struktur molekularnych metodą NMR, zwiększając czułość i wiarygodność przy utrzymaniu rozdzielczości widmowej. Zastosowano tę zaawansowaną metodę do badania dwóch białek błonowych, uzyskując widma o dobrej rozdzielczości jednego z nich. Opracowanie nowej sekwencji impulsów przyspieszyło czasochłonny etap przypisywania rezonansu. Wraz z zastosowaniem nowego sprzętu umożliwiło to użycie techniki wirowania próbki pod kątem magicznym (MAS). Okazała się ona szczególnie użyteczna w przypadku większych białek o mniejszej homogenności strukturalnej, takich jak białka nukleokapsydu wirusów. Podsumowując, oczekuje się, że wyniki projektu MEM-MAS zrewolucjonizują badania strukturalne metodą spektroskopii NMR ciała stałego. Wysokoprzepustowe określanie struktury białek błonowych pozwoli dowiedzieć się więcej o ich funkcji i pomoże opracować nowe metody leczenia chorób człowieka.
Słowa kluczowe
Białka błonowe, struktura, spektroskopia NMR, sekwencja impulsu, wirowanie próbki pod kątem magicznym, MAS
