Genetyka populacyjna grzybów leśnych
Grzyby rozkładające drewno są niezwykle ważne w ekosystemach leśnych, jako że uczestniczą w gniciu drewna i formowaniu gleby. Dostarczają środowiska życia dla wielu innych organizmów i umożliwiają regenerację lasów na całym świecie. Jednakże wiele takich grzybów jest zagrożonych przez gospodarkę leśną, a ich występowanie w pofragmentowanym krajobrazie leśnym jest ograniczone przez ich cechy ekologiczne, ewolucyjne oraz związane z rozprzestrzenieniem. Uczestnicy finansowanego przez UE projektu FUNDISTRAIT (Fungal conservation genetics: species traits and dispersal) postanowili wyjaśnić mechanizmy rozprzestrzenienia się grzybów. W tym celu postanowili określić, które gatunki, populacje i charakterystyki środowiskowe korelują z rozprzestrzenieniem, które oceniano na podstawie wzorców genotypu populacji w całej społeczności grzybów. Aby to osiągnąć, skupili się na lasach w Norwegii, Finlandii i Szwecji. Naukowcy badali cztery kategorie cech związanych z możliwościami rozprzestrzenienia i przetrwania, czyli te bezpośrednio odpowiedzialne za rozprzestrzenienie, produkcję sporów, strategię życiową oraz warunki środowiskowe. Aby zbadać zmienność genetyczną, stworzyli technikę sekwencjonowania o zmniejszonej reprezentacji (DNA związane z miejscami restrykcyjnymi, sekwencjonowanie RAD) oraz zaimplementowali ją w badaniach genetyki populacji grzybów w sposób wysokoprzepustowy. Przeanalizowano ponad 1200 próbek grzybów z borealnych lasów Finlandii, które zawierają duże zróżnicowanie gatunków hub, w tym niektóre zagrożone wymarciem. Wyniki pokazały, że gatunki hub w różny sposób odpowiadały na utratę i fragmentację środowiska, przy czym duże populacje mogły lepiej się przystosować niż populacje izolowane. Badanie FUNDISTRAIT dostarczyło ważnych informacji na temat genetycznego zróżnicowania grzybów w północnej Europie. Przyszła współpraca z interesariuszami z dziedziny leśnictwa i ochrony bioróżnorodności, jak również krajowymi agencjami rolniczymi oraz środowiskowymi, zapewni podjęcie odpowiednich środków zapobiegających wymieraniu gatunków grzybów.
Słowa kluczowe
Genetyka populacyjna, las, grzyby rozkładające drewno, FUNDISTRAIT, sekwencjonowanie RAD
