Un nouveau projet pour la création d'un réseau paneuropéen de ressources microbologiques
Une nouvelle initiative financée par l'UE se lance dans la création d'un réseau paneuropéen de centres spécialisés dans la collecte, l'analyse et la conservation d'échantillons de souches microbiologiques telles que les bactéries, les virus et les champignons microscopiques. Baptisé EMBARC («European consortium of microbial resource centres»), le projet triennal est financé à hauteur de 4,2 millions d'euros au titre du thème «Infrastructures» du septième programme-cadre (7e PC). EMBARC rassemble 10 organisations européennes de recherche de 7 pays qui, ensemble, hébergent près de 200000 souches microbiologiques ainsi que les souches de bactéries les plus anciennes, qui ont été isolées en 1892 et sont aujourd'hui conservées à l'Institut national français de recherche agronomique (INRA). L'un des objectifs principaux du projet est d'harmoniser les méthodes de conservation et d'identification des échantillons utilisées par ces organismes. Le consortium souhaite particulièrement mettre en place une banque d'ADN étant donné la demande croissante de ce genre de souches par la communauté scientifique. Les techniques actuelles de préservation d'ADN doivent être améliorées, notamment pour les échantillons nécessitant une conservation sur de longues années. Les partenaires du projet exploreront également de nouvelles approches pour la classification et l'identification des micro-organismes. «Une collection de micro-organismes n'est pas un musée, elle n'est pas statique, il faut constamment l'enrichir, développer de nouvelles méthodes d'identification et de conservation», ajoute Chantal Bizet de l'Institut Pasteur en France. L'Institut Pasteur participe à la coordination du projet EMBARC conjointement avec l'INRA. Un autre objectif du projet est d'étudier les différents modèles financiers, dont les fonds privés, afin de garantir l'avenir à long terme du réseau. «La qualité des bio-ressources est essentielle dans toutes les recherches entreprises pour caractériser et valoriser la biodiversité», explique Sylvie Lortal de l'INRA. «Contribuer à la pérennité des collections et à leur financement durable est une des missions prioritaires d'EMBARC.» Les micro-organismes contenus dans les collections des partenaires du projet ont été utilisées dans une large gamme d'applications, y compris dans la recherche académique, l'enseignement, l'agro-alimentaire, l'industrie pharmaceutique et le milieu hospitalier. Prenons l'exemple d'un nouveau vaccin en cours d'élaboration. Il peut être intéressant de travailler sur des souches collectées avant l'utilisation généralisée des antibiotiques. Les centres de ressources microbiologiques possèdent des souches conservées depuis plus de 70 datant de l'ère pré-antibiotique. Les partenaires du projet lanceront des appels d'offres afin de mettre leurs ressources, leurs équipements et leur expertise à disposition de la communauté scientifique. Parmi les services offerts par les partenaires, citons la formation, l'identification d'espèces et l'authentification de souches, de même qu'un criblage à haut débit qui permettra de comparer les propriétés d'un grand nombre d'échantillons. Enfin, de par ses activités de mise en réseau et d'harmonisation, EMBARC jettera les bases du futur réseau international de CRB (Global Biological Resource Centre Network, GBRCN), permettant à l'expertise et à la recherche européennes d'être au premier plan de la scène internationale.