LIGATE Découverte accélérée de médicaments pour répondre à des besoins médicaux non satisfaits LIGATE promet un processus révolutionnaire de découverte de médicaments basé sur le calcul exaflopique, capable d’identifier des médicaments efficaces en quelques jours au lieu de plusieurs années. Économie numérique Technologies industrielles © Union européenne, 2022 «Nous envisageons de commencer par l’identification de nouveaux médicaments antiviraux à large spectre, en évaluant des billions de molécules par rapport à des dizaines de cibles fonctionnelles virales.» Andrea Beccari, directeur principal et responsable d’EXSCALATE chez Dompé farmaceutici Dans l’industrie et la science, les superordinateurs classiques peinent à résoudre de nombreuses tâches informatiques essentielles. Parmi ces problèmes complexes, citons l’optimisation des flux de circulation et les problèmes numériques fondamentaux en chimie et en physique pour le développement de nouveaux médicaments et matériaux. Il faut parfois plus de 13 ans pour qu’un nouveau médicament passe de la découverte précoce de composés aux essais cliniques et à une autorisation réglementaire. Sans compter le très faible taux de réussite de ce processus: moins de 10 % des essais cliniques sont couronnés de succès, seul 1 médicament sur 5 000 est commercialisé, et ceux qui le sont ne conviennent souvent qu’à une partie des patients. Cette inefficacité et ce faible taux de réussite contribuent au coût extrêmement élevé du développement de nouveaux médicaments. L’équipe du projet LIGATE mise sur une nouvelle génération de plateformes d’intelligence artificielle, de modélisation et de simulations pour résoudre ces problèmes. «Nous tirons parti de la disponibilité sans précédent des ressources informatiques et des algorithmes avancés des machines», explique Andrea Beccari, directeur principal et responsable d’EXSCALATE chez la société biopharmaceutique Dompé farmaceutici. «Notre objectif est de construire une plateforme de CHP dédiée à la conception de médicaments entièrement intégrée, non pas pour les experts en codage, mais plutôt pour les scientifiques qui en ont besoin pour tester beaucoup plus rapidement leurs théories.» Les membres du consortium ne promettent rien de moins que «la plus grande vitesse et la plus extrême précision» aux utilisateurs de leur plateforme. En cas de besoins informatiques urgents — une situation que les chercheurs ont récemment vécue avec la COVID-19 — le système pourra même exécuter des campagnes de découverte de médicaments in silico en moins d’une journée. Contrairement aux systèmes actuels, LIGATE est capable de prendre en compte toute la complexité et les perturbations systémiques que génère une maladie. Un autre avantage clé d’une telle plateforme est la réduction du recours à l’expérimentation animale. «Nous envisageons de commencer par l’identification de nouveaux médicaments antiviraux à large spectre, en évaluant des billions de molécules par rapport à des dizaines de cibles fonctionnelles virales (hélicase, polymérase, protéase, etc.)», explique Andrea Beccari. «Les meilleurs composés seront ensuite validés expérimentalement.» Bien que les résultats complets du projet ne seront pas disponibles avant la fin de 2023, les percées d’ANTAREX — qui a identifié un inhibiteur puissant du virus Zika — et d’EXSCALATE4CoV — qui a validé le raloxifène, un médicament contre l’ostéoporose, comme traitement efficace des processus inflammatoires induits par la COVID-19 — promettent assurément de belles perspectives pour l’avenir. Mots‑clés LIGATE, CHP, calcul à haute performance, superordinateur, technologies, souveraineté numérique, informatique quantique, innovation, informatique verte, efficace sur le plan énergétique, compétences, PME
