Les microbiomes et les holobiomes, moteurs d’une bioéconomie circulaire durable
Les micro-organismes, qui comprennent les archées, les bactéries, les champignons et les virus, ainsi que leur matériel génétique et leurs interactions dans un environnement particulier, forment un microbiome. Toutes les plantes et tous les animaux de la planète sont associés à des microbiomes. Par conséquent, comprendre ce que font les microbiomes, ce qu’ils sont et comment ils interagissent peut révéler comment gérer au mieux les ressources de notre planète pour obtenir notre nourriture et améliorer notre santé. Les communautés microbiennes des milieux naturels jouent un rôle clé dans l’environnement et les systèmes alimentaires en assurant le cycle de l’azote, la suppression des agents pathogènes et la régulation du climat. Les microbiomes du sol facilitent le piégeage du carbone et la fertilité des sols, tandis que les microbiomes océaniques contribuent à la séquestration du carbone et à la régulation du climat. Il est essentiel de préserver les microbiomes naturels et la biodiversité microbienne des pressions anthropiques exercées par l’agriculture industrielle, l’utilisation intensive d’herbicides, la dépendance excessive aux antibiotiques et le changement climatique, afin de garantir une alimentation durable et de qualité. Travailler avec les microbes, plutôt que contre eux, est judicieux d’un point de vue économique et environnemental. En appliquant la science émergente des holobiomes – des systèmes intégrés dans les hôtes et de leurs microbiomes associés dans le sol, les plantes, les animaux, les humains et l’environnement – les micro-organismes peuvent offrir des solutions transformatrices aux principaux défis en matière de durabilité.
Systèmes résilients, économes en ressources et intelligents face au changement climatique
Ce Results Pack CORDIS se concentre sur le rôle des innovations basées sur les microbiomes dans la création de systèmes résilients, efficaces en termes de ressources et intelligents face au changement climatique dans les domaines de l’agriculture, de l’aquaculture, de la sylviculture et de la production biologique, afin de faire progresser la bioéconomie en Europe. En outre, l’utilisation des microbiomes dans le cadre de la bioéconomie contribuera à moderniser et à renforcer la base industrielle de l’UE tout en soutenant la transition vers une économie circulaire et à faible émission de carbone. En s’appuyant sur une série de projets financés par Horizon 2020 et Horizon Europe, ce Results Pack montre comment la compréhension et l’ingénierie des microbiomes contribuent à la bioéconomie de l’UE. Les avantages comprennent l’amélioration de la qualité des aliments, la santé des sols et des écosystèmes, la réduction des intrants synthétiques, l’amélioration du bien-être animal et la transformation des flux de déchets en produits biosourcés de grande valeur dans divers secteurs. Les 12 projets sélectionnés sont axés sur la recherche sur le microbiome et l’holobiome. Ce travail facilite la transition de l’UE vers une bioéconomie circulaire compétitive, tout en soutenant les objectifs clés du pacte vert pour l’Europe(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre), de la vision de l’UE pour l’agriculture et l’alimentation(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) et de la stratégie en matière de bioéconomie(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre). En outre, ce Results Pack vise à accroître la visibilité des solutions basées sur les microbiomes et à encourager l’engagement du public à leur égard, afin de sensibiliser davantage les citoyens et de créer une demande pour des innovations durables. Ce faisant, il répond également aux ambitions plus larges de l’UE dans le cadre de la Stratégie de l’UE en faveur des start-up et des scale-up(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) et de la stratégie européenne pour les sciences de la vie(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) en renforçant l’environnement établi pour que les innovations liées aux microbiomes se traduisent par des applications commerciales. En outre, les résultats de projets contribueront à orienter les futures décisions politiques, à stimuler l’investissement dans la biotechnologie microbienne et à encourager l’émergence de start-ups et de scale-ups compétitives qui contribueront aux transitions verte et numérique de l’Europe. Le projet MICRO4BIOGAS a permis d’améliorer la production de biogaz en optimisant les micro-organismes impliqués dans la digestion anaérobie. CIRCLES a étudié le rôle des microbiomes dans l’amélioration de la productivité, de la qualité, de la sécurité et de la durabilité des aliments. MASTER a mis au point un nouveau protocole et un kit d’extraction d’ADN pour renforcer les systèmes alimentaires. 3D-omics et HoloRuminant ont étudié le microbiome intestinal du bétail afin d’optimiser les performances et de réduire l’impact sur l’environnement. SMART PROTEIN, SoildiverAgro et EcoStack ont permis d’approfondir les connaissances sur les écosystèmes du sol afin d’améliorer la durabilité et la production agricole. En améliorant la connaissance de la biodiversité des sols, EXCALIBUR a amélioré le biocontrôle et la biofertilisation dans l’horticulture. Parallèlement, HoliSoils a étudié les microbiomes des sols forestiers afin de favoriser une gestion des terres et un piégeage du carbone intelligents sur le plan climatique. AtlantECO a étudié l’impact des changements environnementaux sur le microbiome océanique. Enfin, RUSTICA a converti des résidus organiques provenant de fruits et légumes en un engrais biologique.
