Three-dimensional holo’omic landscapes to unveil host-microbiota interactions shaping animal production

Información del proyecto

3D-omics

Identificador del acuerdo de subvención: 101000309

DOI

10.3030/101000309

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 10 Mayo 2021

Fecha de inicio 1 Septiembre 2021

Fecha de finalización 31 Diciembre 2025

Financiado con arreglo a

• SOCIETAL CHALLENGES - Food security, sustainable agriculture and forestry, marine, maritime and inland water research, and the bioeconomy

Coste total

€ 10 073 540,01

Aportación de la UE

€ 9 994 415,00

Coordinado por

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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Los enlaces a los documentos y las publicaciones de los proyectos del Séptimo Programa Marco, así como los enlaces a algunos tipos de resultados específicos, como conjuntos de datos y «software», se obtienen dinámicamente de OpenAIRE .

Resultado final

Documents, reports (7)

Manuscript: modulate microbiota based on 3D'omics

Manuscript: modulate microbiota based on 3D’omics

Manuscript: comparison of 3D'omics and multi-omics

Manuscript: comparison of 3D’omics and multi-omics

International Collaboration Reinforcing report
Outreach and public engagement activity report
Economic and Life Cycle Assessment of 3D'omics

Economic and Life Cycle Assessment of 3D’omics

3D'omics technology blueprint

3D’omics technology blueprint

Manuscript: how to implement 3D'omics data in breeding and nutrition

Manuscript: how to implement 3D’omics data in breeding and nutrition

Other (5)

3D'omics outreach videos

3Domics outreach videos

www.3domics.eu website

www3domicseu website

3D'omics data and metadata standards

3D’omics data and metadata standards

3D'omics visualisation platform

3D’omics visualisation platform

3D'omics outreach video 2

Publicaciones

Peer reviewed articles (4)

Predicting microbial interactions with approaches based on flux balance analysis: an evaluation

Autores: Clémence Joseph, Haris Zafeiropoulos, Kristel Bernaerts, Karoline Faust
Publicado en: BMC Bioinformatics, Edición 25, 2024, ISSN 1471-2105
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-024-05651-7

microbetag: simplifying microbial network interpretation through annotation, enrichment tests, and metabolic complementarity analysis

Autores: Haris Zafeiropoulos, Ermis Ioannis Michail Delopoulos, Andi Erega, Aline Schneider, Annelies Geirnaert, John Morris, Karoline Faust
Publicado en: Genome Biology, Edición 26, 2025, Página(s) 1-34, ISSN 1474-760X
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-025-03769-2

Integrating host and microbiome biology using holo-omics

Autores: Carl M Kobel, Jenny Merkesvik, Idun Maria Tokvam Burgos, Wanxin Lai, Ove Øyås, Phillip B Pope, Torgeir R Hvidsten, Velma T E Aho
Publicado en: Molecular Omics, Edición 20, 2026, Página(s) 438-452, ISSN 2515-4184
Editor: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1039/d4mo00017j

Differential effects of synbiotic delivery route (feed, water, combined) in broilers challenged with Salmonella Infantis

Autores: Victoria Drauch, Mahdi Ghanbari, Nicole Reisinger, Michaela Mohnl, Claudia Hess, Michael Hess
Publicado en: Poultry Science, Edición 104, 2025, Página(s) 104890, ISSN 0032-5791
Editor: Poultry Science Association Inc.
DOI: 10.1016/j.psj.2025.104890