A machine learning framework for discovery and enrichment of metagenomics metadata from open access publications
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Auteurs:
Maaly Nassar, Alexander B Rogers, Francesco Talo', Santiago Sanchez, Zunaira Shafique, Robert D Finn, Johanna McEntyre
Publié dans:
Gigascience, Numéro 2047217X, 2022, ISSN 2047-217X
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/gigascience/giac077
EMBL’s European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) in 2024
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Auteurs:
Matthew Thakur, Catherine Brooksbank, Robert D Finn, Helen V Firth, Julia Foreman, Mallory Freeberg, Kim T Gurwitz, Melissa Harrison, David Hulcoop, Sarah E Hunt, Andrew R. Leach, Mariia Levchenko, Diana Marques, Ellen M McDonagh, Aziz Mithani, Helen Parkinson, Yasset Perez-Riverol, Zinaida Perova, Ugis Sarkans, Santosh Tirunagari, Eleni Tzampatzopoulou, Aravind Venkatesan, Juan-Antonio Vizc
Publié dans:
Nucleic Acids Research, Numéro 53, 2025, Page(s) D10-D19, ISSN 0305-1048
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/nar/gkae1089
Europe PMC in 2023
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Auteurs:
Summer Rosonovski, Maria Levchenko, Rajat Bhatnagar, Umamageswari Chandrasekaran, Lynne Faulk, Islam Hassan, Matt Jeffryes, Syed Irtaza Mubashar, Maaly Nassar, Madhumiethaa Jayaprabha Palanisamy, Michael Parkin, Jagadeeswararao Poluru, Frances Rogers, Shyamasree Saha, Mohamed Selim, Zunaira Shafique, Michele Ide-Smith, David Stephenson, Santosh Tirunagari, Aravind Venkatesan, Lijun Xing, Melissa H
Publié dans:
Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Éditeur:
Oxford University Press
DOI:
10.1093/nar/gkad1085
Enabling preprint discovery, evaluation, and analysis with Europe PMC
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Auteurs:
Mariia Levchenko, Michael Parkin, Johanna McEntyre, Melissa Harrison
Publié dans:
PLOS ONE, Numéro 19, 2024, Page(s) e0303005, ISSN 1932-6203
Éditeur:
Public Library of Science
DOI:
10.1371/journal.pone.0303005
Europe PMC annotated full-text corpus for gene/proteins, diseases and organisms
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Auteurs:
Xiao Yang, Shyamasree Saha, Aravind Venkatesan, Santosh Tirunagari, Vid Vartak & Johanna McEntyre
Publié dans:
Scientific Data, 2023, ISSN 2052-4463
Éditeur:
Springer Nature
DOI:
10.1038/s41597-023-02617-x
Searching and Evaluating Publications and Preprints Using Europe PMC
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Auteurs:
Summer Rosonovski, Maria Levchenko, Michele Ide-Smith, Lynne Faulk, Melissa Harrison, Johanna McEntyre
Publié dans:
Current Protocols, 2023, ISSN 2691-1299
Éditeur:
Current Protocols
DOI:
10.1002/cpz1.694