Signs, polynomials, and reaction networks

Informations projet

POSALG

N° de convention de subvention: 101044561

DOI

10.3030/101044561

Date de signature de la CE 16 Juin 2022

Date de début 1 Janvier 2023

Date de fin 31 Decembre 2028

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 782 649,00

Contribution de l’UE

€ 1 782 649,00

Coordonné par

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

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Publications

Peer reviewed articles (10)

Maximum likelihood estimation of log-affine models using detailed-balanced reaction networks

Auteurs: Oskar Henriksson, Carlos Améndola, Jose Israel Rodriguez, Polly Y. Yu
Publié dans: Journal of Mathematical Biology, Numéro 91, 2025, ISSN 0303-6812
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/S00285-025-02262-5

Moment varieties of the inverse Gaussian and gamma distributions are nondefective

Auteurs: Oskar Henriksson, Kristian Ranestad, Lisa Seccia, Teresa Yu
Publié dans: Journal of Symbolic Computation, Numéro 132, 2025, ISSN 0747-7171
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.JSC.2025.102460

Connectivity of Parameter Regions of Multistationarity for Multisite Phosphorylation Networks

Auteurs: Kaihnsa, Nidhi; Telek, Máté L.
Publié dans: Bulletin of Mathematical Biology, Numéro 86, 2024, ISSN 1522-9602
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.48550/ARXIV.2403.16556

The generic geometry of steady state varieties

Auteurs: Feliu, Elisenda; Henriksson, Oskar; Pascual-Escudero, Beatriz
Publié dans: SIAM Journal on Applied Algebra and Geometry, Numéro 10, 2026, ISSN 2331-8422
Éditeur: SIAM
DOI: 10.48550/ARXIV.2412.17798

Positive equilibria in mass action networks: geometry and bounds

Auteurs: Murad Banaji, Elisenda Feliu
Publié dans: Journal of Mathematical Biology, Numéro 93, 2026, ISSN 0303-6812
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/S00285-026-02429-8

Generic consistency and nondegeneracy of vertically parametrized systems

Auteurs: Elisenda Feliu; Oskar Henriksson; Beatriz Pascual-Escudero
Publié dans: Journal of Algebra, 2025, ISSN 1090-266X
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.48550/ARXIV.2304.02302

Computing positive tropical varieties and lower bounds on the number of positive roots

Auteurs: Kemal Rose, Máté L. Telek
Publié dans: Journal of Symbolic Computation, Numéro 132, 2026, ISSN 0747-7171
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.JSC.2025.102477

Real tropicalization and negative faces of the Newton polytope

Auteurs: Telek, Máté L.
Publié dans: Journal of Pure and Applied Algebra, 2024, ISSN 1873-1376
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.48550/ARXIV.2306.05154

Geometry of the Signed Support of a Multivariate Polynomial and Descartes’ Rule of Signs

Auteurs: Máté L. Telek
Publié dans: SIAM Journal on Applied Algebra and Geometry, Numéro 4, 2024, ISSN 2470-6566
Éditeur: SIAM
DOI: 10.48550/ARXIV.2310.05466

Viro's patchworking and the signed reduced A-discriminant

Auteurs: Weixun Deng; J. Maurice Rojas; Máté L. Telek
Publié dans: Journal of Symbolic Computation, 2026, ISSN 1095-855X
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.48550/ARXIV.2403.08497

Conference proceedings (1)

Solving bihomogeneous polynomial systems with a zero-dimensional projection

Auteurs: Matías Bender, Laurent Busé, Carles Checa, Elias Tsigaridas
Publié dans: Proceedings of the 2025 International Symposium on Symbolic and Algebraic Computation, 2025
Éditeur: ACM
DOI: 10.1145/3747199.3747563

Book chapters (1)

From chemical reaction networks to algebraic and polyhedral geometry—and back again

Auteurs: Elisenda Feliu and Anne Shiu
Publié dans: 2025
Éditeur: AMS