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Characterization of multi-species bacterial interactions underlying the beneficial symbiosis of a Mediterranean squid.

Description du projet

Deux valent peut-être mieux qu’un: les nombreux symbiotes d’un calmar méditerranéen

La symbiose, qui signifie «vivre ensemble» en grec, est un thème commun dans la nature. Il s’applique à deux organismes impliqués dans une relation à long terme, parfois mutuellement bénéfique. La symbiose calmar-Vibrio est largement utilisée pour étudier les associations mutuellement bénéfiques, également appelées mutualismes. Au cours des dernières décennies, le calmar hawaïen (Euprymna scolopes) a fait l’objet de très nombreuses études, mais il ne possède qu’un seul symbiote, Vibrio fischeri. De nombreux organismes plus grands ont plus d’un symbiote. Grâce au soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet SquidVibrio étudiera le calmar méditerranéen Sepiola affinis et ses deux symbiotes, V. fischeri et Vibrio logei. En combinant la métagénomique, la microscopie confocale et la spectrométrie de masse, le projet abordera des questions restées sans réponse sur la façon dont les symbiotes interagissent à la fois entre eux et avec leur hôte.

Objectif

Animals often use associations with microbes to preserve their health. These mutualisms are maintained by host-microbe communication and though interactions between bacterial symbionts. The squid-vibrio symbiosis has been used for over 30 years to study beneficial host-microbe associations. However, nearly all studies of the symbiosis have used Euprymna scolopes and its only symbiont, Vibrio fischeri, which precludes examination of how multiple microbial species affect symbiosis. Using the squid Sepiola affinis, and its two symbionts, V. fischeri and Vibrio logei, the SquidVibrio project proposes to examine the effects of multiple microbial species within a mutualism. The project is organized into three objectives. 1) Implement a husbandry facility for S. affinis. 2) Quantify the symbiont populations within the S. affinis light organ over seasons and over maturation. 3) Identify how the symbiont populations alter metabolites within the light organ. First, a husbandry facility will be established at the Banyuls-sur-Mer Oceanographic Observatory that will allow for the maintenance of wild S. affinis and for rearing of the squid. Second, metagenomics will be used to estimate the proportions of V. fischeri and V. logei within the light organ. Subsequently, light organs of field-caught and reared squid will be imaged using confocal microscopy to identify if the Vibrio spp. inhabit mixed or distinct niches. The third objective will use LC-MS and mass spectrometry imaging to identify metabolites that are altered by each Vibrio spp. and how localization patterns of these molecules are affected. These methods will allow for the two-way transfer of knowledge, with the researcher providing squid husbandry techniques and the host institution providing genomics and metabolomics. The SquidVibrio project will establish S. affinis as a model organism in Europe that can provide insights into how symbionts interact both with each other and their host to underly a mutualism.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Coordinateur

SORBONNE UNIVERSITE
Contribution nette de l'UE
€ 211 754,88
Adresse
21 RUE DE L'ECOLE DE MEDECINE
75006 Paris
France

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Région
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
Aucune donnée

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