Objetivo
Molecular Dynamics Simulations (MD) are widely used in molecular and structural biology and drug discovery to study the structure, properties and dynamics of small and macromolecules. The size of the simulated systems (up to a billion atoms) and the length of the simulations (from microseconds in 2010 to milliseconds in 2021 in million atom scenes) have dramatically increased following the recent advances in computing hardware (GPU clusters) and storage. Additionally, with the recent advances in Cryo Electron Microscopy and the arising of AlphaFold many new models of macromolecular structures and complexes are now available for molecular simulation.
Due to their more and more extreme size, the storage, analysis and visualization of the resulting data is becoming problematic: 1. Technically for a usable and efficient processing of the data and 2. Environmentally in terms of storage, bandwith and power comsumption.
Within the ERC ViDOCK project, we created a highly usable, free and open-source high-performance molecular visualization software called VTX. VTX is optimized to handle the biggest molecular structures and trajectories notably by including cutting-edge molecular graphics with a high performance graphics engine coupled with a video game based minimalistic task-oriented GUI to maximize its usability.
The goal of the VTX-HPC project is to improve the performance, usability and sustainability of VTX for the visualization of the High Performance Computing Molecular Dynamics Simulations big data by developing and implementing 1. a highly compact molecular structure and trajectories file format optimized for streaming for increased performances and reduced environmental load. 2. a meshless version of the widely used Solvent Excluded Surface representation for scalability purposes and real-time ray tracing in the rendering engines and 3. Adapted manipulation and controls for the generation of illustrations and movies of massive dynamic molecular scenes.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información software
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2022-POC1
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
75141 Paris
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.