Integrating Multi-Disciplinary Expertise in a Learning and Adaptive European Pandemic Preparedness System

Informations projet

LEAPS

N° de convention de subvention: 101094685

DOI

10.3030/101094685

Date de signature de la CE 9 Octobre 2023

Date de début 1 Octobre 2023

Date de fin 30 Septembre 2027

Financé au titre de

• Health

Coût total

€ 2 999 600,00

Contribution de l’UE

€ 2 999 600,00

Coordonné par

KATHOLIEKE UNIVERSITEIT LEUVEN
Belgium

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Documents, reports (2)

D7.1 - content prioritization

D7.1 - content prioritization: a document defining the contents and target audience (M6)

D7.4 - First DECM Plan

D7.4 - Preliminary Dissemination, Exploitation and Communication Plan (M6)

Data Management Plan (2)

D8.1 - Data Management Plan

D8.1 - Data management plan

D3.5 - First Consortium DMP

D3.5 - First consortium data management plan (M6)

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

D7.6 - Project Website

LEAPS project website

Publications

Peer reviewed articles (9)

Modeling memory B cell responses in a lymphoid organ-chip to evaluate mRNA vaccine boosting

Auteurs: Raphaël Jeger-Madiot, Delphine Planas, Isabelle Staropoli, Hippolyte Debarnot, Jérôme Kervevan, Héloïse Mary, Camilla Collina, Barbara F. Fonseca, Rémy Robinot, Stacy Gellenoncourt, Olivier Schwartz, Lorna Ewart, Michael Bscheider, Samy Gobaa, Lisa A. Chakrabarti
Publié dans: Journal of Experimental Medicine, Numéro 221, 2024, ISSN 0022-1007
Éditeur: Rockefeller University Press
DOI: 10.1084/JEM.20240289

Broad sarbecovirus neutralization by combined memory B cell antibodies to ancestral SARS-CoV-2

Auteurs: Cyril Planchais, Ignacio Fernández, Benjamin Chalopin, Timothée Bruel, Pierre Rosenbaum, Maxime Beretta, Jordan D. Dimitrov, Laurine Conquet, Flora Donati, Matthieu Prot, Françoise Porrot, Delphine Planas, Isabelle Staropoli, Florence Guivel-Benhassine, Eduard Baquero, Sylvie van der Werf, Ahmed Haouz, Etienne Simon-Lorière, Xavier Montagutelli, Bernard Maillère, Félix A. Rey, Pablo Guardado-Calvo, Hervé Nozach, Olivier Schwartz, Hugo Mouquet
Publié dans: iScience, Numéro 27, 2025, ISSN 2589-0042
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.ISCI.2024.110354

Distinct evolution of SARS-CoV-2 Omicron XBB and BA.2.86/JN.1 lineages combining increased fitness and antibody evasion

Auteurs: Delphine Planas, Isabelle Staropoli, Vincent Michel, Frederic Lemoine, Flora Donati, Matthieu Prot, Francoise Porrot, Florence Guivel-Benhassine, Banujaa Jeyarajah, Angela Brisebarre, Océane Dehan, Léa Avon, William Henry Bolland, Mathieu Hubert, Julian Buchrieser, Thibault Vanhoucke, Pierre Rosenbaum, David Veyer, Hélène Péré, Bruno Lina, Sophie Trouillet-Assant, Laurent Hocqueloux, Thierry Prazuck, Etienne Simon-Loriere, Olivier Schwartz
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-024-46490-7

BEAST X for Bayesian phylogenetic, phylogeographic and phylodynamic inference

Auteurs: Guy Baele; Xiang Ji; Gabriel W. Hassler; John T. McCrone; Yucai Shao; Zhenyu Zhang; Andrew J. Holbrook; Philippe Lemey; Alexei J. Drummond; Andrew Rambaut; Marc A. Suchard
Publié dans: Nature Methods, 2025, ISSN 1548-7105
Éditeur: Nature Methods
DOI: 10.1038/S41592-025-02751-X

Structural basis of TMPRSS2 zymogen activation and recognition by the HKU1 seasonal coronavirus

Auteurs: Ignacio Fernández, Nell Saunders, Stéphane Duquerroy, William H. Bolland, Atousa Arbabian, Eduard Baquero, Catherine Blanc, Pierre Lafaye, Ahmed Haouz, Julian Buchrieser, Olivier Schwartz, Félix A. Rey
Publié dans: Cell, Numéro 187, 2024, ISSN 0092-8674
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.CELL.2024.06.007

Large-scale genomic surveillance reveals immunosuppression drives mutation dynamics in persistent SARS-CoV-2 infections

Auteurs: Mark P. Khurana; Alexandros Katsiferis; Neil Scheidwasser; Mathilde Marie Brunnich Sloth; Jacob Curran-Sebastian; Christian Morgenstern; Man-Hung Eric Tang; Jannik Fonager; Morten Rasmussen; Marc Stegger; Charles Whittaker; Sune Lehmann; Laust H. Mortensen; Pikka Jokelainen; Moritz U.G. Kraemer; Neil M. Ferguson; Mahan Ghafari; Tyra G. Krause; David A. Duchene; Samir Bhatt
Publié dans: Crossref, 2025, ISSN 0000-0000
Éditeur: medRxiv
DOI: 10.1101/2025.02.10.25321987

On the importance of assessing topological convergence in Bayesian phylogenetic inference

Auteurs: Marius Brusselmans; Luiz Max Carvalho; Samuel L. Hong; Jiansi Gao; Frederick A Matsen IV; Andrew Rambaut; Philippe Lemey; Marc A Suchard; Gytis Dudas; Guy Baele
Publié dans: Virus Evolution, 2024, ISSN 2057-1577
Éditeur: Virus Evolution
DOI: 10.48550/ARXIV.2402.11657

International importance and spread of SARS-CoV-2 variants Alpha, Delta, and Omicron BA.1 into Spain

Auteurs: Gallego-Garcia, Pilar; Hong, Samuel L.; Bollen, Nena; Dellicour, Simon; Baele, Guy; Suchard, Marc A.; Lemey, Philippe; Posada, David
Publié dans: Communications Medicine, 2025, ISSN 2730-664X
Éditeur: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/S43856-025-00912-9

Escape of SARS-CoV-2 Variants KP.1.1, LB.1, and KP.3.3 From Approved Monoclonal Antibodies

Auteurs: Delphine Planas, Isabelle Staropoli, Cyril Planchais, Emilie Yab, Banujaa Jeyarajah, Yannis Rahou, Matthieu Prot, Florence Guivel-Benhassine, Frederic Lemoine, Vincent Enouf, Etienne Simon-Loriere, Hugo Mouquet, Marie-Anne Rameix-Welti, Olivier Schwartz
Publié dans: Pathogens and Immunity, Numéro 10, 2024, ISSN 2469-2964
Éditeur: Case Western Reserve University
DOI: 10.20411/PAI.V10I1.752

Other (1)

HIPSTR: highest independent posterior subtree reconstruction in TreeAnnotator X

Auteurs: Guy Baele; Luiz M Carvalho; Marius Brusselmans; Gytis Dudas; Xiang Ji; John T McCrone; Philippe Lemey; Marc A Suchard; Andrew Rambaut
Publié dans: Bioinformatics, 2024
Éditeur: preprint
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAF488