Descripción del proyecto
Nuevos métodos de cultivo de la patata para la seguridad alimentaria mundial
La patata, uno de los tres principales cultivos alimentarios del mundo, es un alimento básico para 1 300 millones de personas. Sin embargo, la mejora de la patata se ha quedado rezagada debido a su complejo genoma tetraploide, que complica los métodos modernos de mejora. En este sentido, el equipo del proyecto BYTE2BITE, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, pretende revolucionar el cultivo de la patata mediante el desarrollo de un pangenoma casi completo y de innovadoras herramientas genómicas para la determinación precisa del genotipo y el análisis del genoma. El equipo de BYTE2BITE también pondrá en marcha un programa de actividades previas a la mejora genética para producir nuevas variedades de patata con baja carga mutacional. Dicho método pionero pretende aprovechar el potencial genético de la patata, garantizando una mayor productividad y seguridad alimentaria en las próximas décadas.
Objetivo
Potato is one of the three most important food crops in the world. Around 1.3 billion people rely on potato as a staple food every day. But despite this exceptional socio-economic importance, the improvement of potato during the past 150 years has been limited. The main reason for this deficit is the highly heterozygous, autotetraploid genome of potato. This complicates several important aspects of breeding including the fixation of beneficial alleles and the implementation of modern, genomics-assisted breeding techniques.
Recently it has been suggested to convert tetraploid potato into a diploid crop, and thereby overcome all the difficulties associated with tetraploid potato breeding. However, the creation of diploid potatoes is hampered by the large number of deleterious recessive mutations that have accumulated in the tetraploid genome and are exposed in the diploid potatoes.
In BYTE2BITE we will address the fundamental issues that hold back the success of potato breeding. We will generate the first-of-its-kind, near-to-complete pan-genome of potato and use this resource to develop unprecedented genome-graph tools for efficient genotyping and haplotype-resolved genome analysis. We will then use this new computational toolbox to establish a genomics-assisted pre-breeding programme in which we will generate novel potato cultivars with low mutational load. This new resource will open the doors to efficient breeding unleashing the genetic potential of potato and thereby help to secure the way we feed the world for the decades to come.
Specifically, in BYTE2BITE we want to achieve the following goals:
1. A near-to-complete pan-genome describing almost the entire haplotype diversity of potato
2. A genome graph tool for cost-efficient genotyping and haplotype-resolved genome analyses
3. A genomics-assisted pre-breeding programme for potatoes with low mutational load
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
- ciencias naturalesciencias biológicasgenéticamutación
- ciencias agrícolasagricultura, silvicultura y pescaagricultura
- ciencias naturalesciencias biológicasgenéticagenoma
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Palabras clave
Programa(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Régimen de financiación
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstitución de acogida
80539 MUNCHEN
Alemania