Descripción del proyecto
Una investigación avanzada conecta los puntos entre las infecciones y las enfermedades inmunitarias
Entender cómo contribuyen las infecciones a las enfermedades relacionadas con el sistema inmunitario, como el lupus o la esclerosis múltiple, es todo un reto. En estas enfermedades influye una compleja mezcla de factores, como las infecciones, la genética y el medio ambiente, por lo que resulta difícil determinar con precisión los desencadenantes específicos. El equipo del proyecto ID-DarkMatter-NCD, financiado con fondos europeos, prevé utilizar tecnología avanzada para estudiar miles de elementos microbianos. Los investigadores analizarán las respuestas de los anticuerpos a 600 000 antígenos de identificación y elaborarán perfiles de 6 000 pacientes de 6 enfermedades no transmisibles relacionadas con el sistema inmunitario utilizando la multiómica y el genotipado personalizado. Utilizando el aprendizaje automático para el análisis de datos, el equipo ayudará a descubrir cómo interactúan las infecciones con el sistema inmunitario para desencadenar enfermedades. Los hallazgos del proyecto podrían ayudar a comprender, prevenir y tratar estas afecciones, lo que ofrecería esperanza a millones de personas afectadas por enfermedades relacionadas con el sistema inmunitario en todo el mundo.
Objetivo
While it is known that post-COVID-19-condition (PCC) is caused by SARS-CoV-2 infection, for most other immune-related noncommunicable diseases (IR-NCDs), no such infectious disease (ID) triggers have been identified (yet). Many IDs exist that could potentially cause IR-NCDs, however these microbes have large genomes encoding many antigens possibly associated with IR-NCDs. Given that it is challenging to measure all these 100,000s of structures in parallel, they represent the dark matter of ID-immune interactions.
Furthermore, exposure to an ID alone typically does not trigger development of an IR-NCD: For example only a subset of patients infected with SARS-CoV-2 develop PCC. So, genetic- and environmental aspects also affect the onset of IR-NCDs, but the exact factors are unknown for most IR-NCDs.
Here, we aim to 1.) identify IDs triggering IR-NCDs by screening for antibody responses against 600,000 ID antigens, and 2.) to disentangle environmental and genetic factors affecting the transition from IDs to IR-NCDs. We will combine novel multi-omics approaches and technologies for personalized genotyping of HLA and adaptive immune receptor genes to deeply profile 6,000 patients of six IR-NCDs (PCC, multiple sclerosis, ME/CFS, rheumatoid arthritis, lupus, IBD) to identify novel biomarkers and disease mechanisms.
This project will represent the largest and most deeply profiled systematic study of multiple IR-NCDs with layered datasets allowing for comparative analyses yielding insights into shared mechanisms and potential differences in the role of IDs between IR-NCDs. Building on associations identified from population scale and clinical cohorts, we will demonstrate causality in gnotobiotic mouse models, and leverage machine learning (ML) algorithms to predict disease progression and response to treatment. The combination of novel assays with ML represents a broadly applicable pipeline that can be used for studying the interplay of any other IDs/ IR-NCDs.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véase: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Palabras clave
Programa(s)
Tema(s)
Convocatoria de propuestas
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-HLTH-2023-DISEASE-03
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HORIZON-RIA - HORIZON Research and Innovation ActionsCoordinador
1090 Wien
Austria