Description du projet
Variantes structurelles et aptitude des espèces
Les individus diffèrent par la séquence de leur ADN, ce qui entraîne une grande variation génomique au sein de la population. Cependant, l’accumulation de mutations délétères, connue sous le nom de déficit génétique, réduit l’aptitude des individus et des populations. Les variantes structurelles, y compris les insertions, les suppressions et les inversions de séquences d’ADN, peuvent influencer profondément le déficit génétique, mais elles sont souvent négligées en raison des difficultés de détection et d’analyse à grande échelle. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet SV-Load vise à élucider la manière dont les variantes structurelles contribuent à l’adaptation de la population en combinant la modélisation informatique et la validation expérimentale. En utilisant l’espèce de mouche Coelopa frigida, il fournira des informations importantes sur le rôle des variantes structurelles dans la formation de la diversité génétique et de l’adaptation entre les espèces.
Objectif
How can we accurately measure and predict genetic load? In SV-load, I aim to understand how an often overlooked, but high impact class of genomic variation contributes to genetic load. Structural variants (SVs) have been shown to have significant implications for individual and population fitness and impact more genomic content overall than traditional whole-genomic markers (i.e. single nucleotide polymorphisms, SNPs). However, whole-genome SVs are underrepresented in population studies as they have historically been difficult to characterise and genotype at the population-scale. As a result, the dynamics of SV diversity in the face of fundamental evolutionary processes (e.g. selection, recombination, and population size) is relatively unresolved and hinders the study of genetic load across disciplines. To address this gap, I will implement in-silico approaches to forecast and experimentally test how SVs respond to different demographic parameters in a non-model species (Coelopa frigida). During my PhD and first postdoc I honed the sequencing and bioinformatic skills necessary to study genome-wide SVs at the population-scale. I will bring this expertise to the host lab of Dr. Mérot and Dr. Glémin at the Université de Rennes (UR, France), experts in the field of evolutionary biology and ecology. Training with the host lab, and a secondment with A/Prof Bataillon at Aarhus University (AU, Denmark) will broaden my modelling and experimental skills. Through these collaborations, I will learn new multidisciplinary approaches in modelling, statistical genomics and experimentation. This project will not only complement my existing skills but enable me to gain a competitive advantage in establishing my European career in the exciting and dynamic field of evolutionary biology. Finally, this project will aid in advancing our understanding of genetic load, which remains a fundamental challenge for biologists in the agriculture, conservation, and evolution research sectors.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
La classification de ce projet a été validée par des humains.
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La classification de ce projet a été validée par des humains.
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75794 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.