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From reservoirs to vectors: role of amoebae in antibiotic resistance gene transfer and aquatic microbial dynamics under global environmental factors

Description du projet

Amibes libres et leur rôle dans la propagation des gènes de résistance aux antibiotiques

L’approche «Une seule santé» considère la résistance aux antimicrobiens (RAM) comme une menace mondiale grave. Les milieux aquatiques affectés par les activités humaines constituent des points chauds pour la propagation des gènes de résistance aux antibiotiques (ARG pour «antibiotic resistance genes»), principalement par transfert horizontal de gènes (HGT pour «horizontal gene transfer») médié par des éléments génétiques mobiles (MGE pour «mobile genetic elements»). Les amibes libres (FLA pour «free-living amoebae») peuvent agir à la fois comme prédateurs de bactéries et comme hôtes protecteurs de pathogènes, ce qui pourrait faciliter la propagation des ARG. Cependant, la compréhension du rôle des FLA dans cette dissémination reste limitée. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet FLUXARG étudiera les FLA en tant que réservoirs, vecteurs de transmission des ARG et points chauds pour les HGT dans les environnements aquatiques. Les résultats de cette étude contribueront à l’élaboration de nouvelles stratégies pour lutter contre cette menace émergente.

Objectif

Antimicrobial resistance (AMR) has become a global threat and a major public health priority under the “One Health” approach. In particular, Aquatic environments affected by anthropogenic activities, represent a huge reservoir and potential hotspot for the spread of antibiotic resistance genes (ARGs), potentially via horizontal gene transfer (HGT) involving mobile genetic elements (MGEs). Current data suggests that free-living amoebae (FLA), which are often underestimated, could play a potential key role in the spread of AMR. FLA not only act as natural predators of bacteria but also serve as protective hosts for various pathogens, enhancing their survival and potential for HGT. Previous studies have shown that FLA are reservoirs for pathogenic bacteria and ARGs of major clinical interest. However, their exact role in the ARGs dissemination via HGT and the involvement of MGEs in this process remains poorly explored. The project FLUXARG aims to further investigate the role of amoebae as reservoirs of ARGs and their contribution to the transmission of ARGs in aquatic environments. By studying HGT between bacteria living in amoebae, we aim to understand how ARGs are spread in aquatic environments via FLA. In addition, FLUXARG will investigate the effect of abiotic factors, such as physicochemical parameters during seasonal variations, on the efficiency of HGT between intra-amoebic bacteria. In parallel, FLUXARG will assess how these interactions shape the composition and diversity of aquatic and amoebic microbiomes, leading to a better understanding of their ecological importance. To achieve these objectives, in FLUXARG, I will employ culture assays, high-throughput genomic and metagenomic techniques, and experimental microcosms to mimicking environmental conditions. The results will lead to a better understanding of the role of FLA in the persistence and spread of AMR, potentially guiding the development of effective strategies to mitigate this growing threat.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

UNIVERSITE LYON 1 CLAUDE BERNARD
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 226 420,56
Adresse
BOULEVARD DU 11 NOVEMBRE 1918 NUM43
69622 Villeurbanne Cedex
France

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Région
Auvergne-Rhône-Alpes Rhône-Alpes Rhône
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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