Description du projet
La dynamique évolutive des parasites bactériophages et des bactéries
Les bactériophages, ou phages, sont des virus qui infectent les bactéries et façonnent l’évolution microbienne. Cependant, les phages eux-mêmes peuvent être parasités par des éléments génétiques mobiles appelés éléments satellites. Ces derniers n’ont pas la capacité de se répliquer de manière indépendante et détournent les phages pour se propager. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet TriSH vise à étudier comment des éléments satellites spécifiques interagissent avec les phages et évoluent au sein des hôtes Escherichia coli et Klebsiella. Les chercheurs utiliseront des approches expérimentales et informatiques pour découvrir la base génétique de ces interactions et leurs conséquences évolutives. Les résultats du projet amélioreront notre compréhension de la biologie des satellites et ouvriront la voie à de nouveaux outils dans le domaine de la thérapie par les phages et de la biotechnologie.
Objectif
Phages, viruses that infect bacteria, play key roles in shaping bacterial fitness and evolution. At the same time, phages themselves are parasitized by satellites - mobile genetic elements (MGEs) lacking genes for autonomous replication but that can hijack (helper) phages for their own propagation. Despite billions of years of coevolution between satellites, phages and bacteria, we know little about how selection affects these elements and their interactions. Recent studies showed that P4-like satellites are diverse and widespread across distant bacterial genomes, but outside a few P2-like prophages described decades ago, the actual range of phages that P4-like elements can hijack is unknown. The aim of my project is to decipher the mobilization potential of P4-like satellites, study the genetic basis of this mobilization and reveal how selection acts on satellites, phages and bacteria when they coevolve. With access to over 200 strains of Escherichia coli and Klebsiella, I will combine experimental and computational analyses to shed light on the genetic and evolutionary interactions between P4-like satellites, their helpers and their common bacterial hosts. Leveraging my expertise in microbial evolution and molecular biology, this project will introduce new expertise in satellite biology, bioinformatics, and coevolutionary microbiology. This project will provide new models to explore satellite-helper dynamics, with potential applications in biotechnology and phage therapy. At the Institut Pasteur, I will collaborate in an interdisciplinary environment within the Department of Genomes and Genetics, receiving outstanding academic training with numerous opportunities for interdisciplinary collaborations. This provides unique prospects for my career development towards independency. Research findings will be published in high-impact journals, open-access, and presented at international conferences, with outreach efforts to engage a broad audience.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
La classification de ce projet a été validée par des humains.
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La classification de ce projet a été validée par des humains.
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75724 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.