Description du projet
Décoder les infections dormantes du fraisier
Les agents pathogènes des plantes constituent une menace majeure pour l’agriculture, car ils réduisent les rendements des cultures et provoquent d’importantes pertes après la récolte. Parmi eux, les agents pathogènes fongiques, qui peuvent rester longtemps indétectés, sont particulièrement nuisibles. Protéger la production alimentaire, implique de comprendre comment les agents pathogènes passent d’une infection silencieuse à une maladie active. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet SCOPE-BERRY concentre ses recherches sur Botrytis cinerea, un champignon qui infecte silencieusement les fraises et détruit les fruits mûrs. Les chercheurs suivront une approche interdisciplinaire combinant la microscopie, la biologie moléculaire et la transcriptomique pour cartographier l’interaction entre le champignon et l’hôte au niveau de la cellule unique. Les résultats du projet fourniront des informations fondamentales sur les infections quiescentes, ouvrant la voie à de nouvelles stratégies de prévention des maladies.
Objectif
Botrytis cinerea, a necrotrophic fungus that causes grey mold, poses a significant pre- and post-harvest threat to 1.2 million tonnes of strawberry produced annually in the EU. This pathogen can establish quiescent, asymptomatic infections in strawberry flowers and unripe fruit, which progress to symptomatic infections as the fruit ripens. Despite its importance, the biological and environmental factors that regulate the onset and termination of B. cinerea quiescence remain poorly understood.
In this study, I propose an interdisciplinary approach combining microscopy, molecular biology, and transcriptomics to unravel mechanisms driving quiescent infections and host susceptibility in the B. cinerea-strawberry pathosystem. First, I will use confocal fluorescence microscopy to track B. cinerea infection in strawberry flowers and fruit, visualizing the pathogen’s entry and transition from quiescence to necrotrophic disease. Building on these observations, I will apply single-nucleus and spatial RNA sequencing to profile the transcriptomes of both the pathogen and host at cellular resolution during key phases of infection. The resulting data will be integrated and analyzed using cutting-edge bioinformatic tools to explore cellular diversity in both organisms and identify the host's transcriptional responses during infection, providing new insights into the molecular pathways governing the complex B. cinerea-strawberry interaction.
This research pioneers the use of single-nucleus and spatial transcriptomics to study host-pathogen interactions, overcoming challenges in detecting and profiling invading pathogens at the single-cell level, and application to non-model plant species. It leverages my expertise in plant genetics, the host lab’s specialty in molecular interactions, and collaborators’ proficiency in single-cell technology and microscopy, creating a powerful professional network that will drive the success of the project and support my career growth.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture horticulture fruiticulture
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie mycologie
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
3000 LEUVEN
Belgique
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.